Easyvs: uma ferramenta para triagem virtual mista baseada em alvo e ligante

• Autor(a) principal: Wandré Nunes de Pinho Veloso
• Data de Publicação: 2019
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/30754
• topic: EasyVS; GPCR; ligantes

O processo de descoberta de fármacos consiste em diversas etapas e a utilização de ferramentas computacionais pode ser parte essencial, em especial, durante os primeiros estágios da pesquisa. É possível, por exemplo, o estudo de grande número de moléculas a partir de propriedades fisico-químicas ou mesmo prevendo o possível modo e energia de ligação entre duas ou mais moléculas. O EasyVS é uma ferramenta WEB desenvolvida para simplificar o processo descrito anteriormente a partir da seleção de compostos e bibliotecas de compostos e triagem virtual de ligantes. Com uma interface intuitiva, a ferramenta permite aos usuários ir desde a seleção de uma proteína-alvo com estrutura conhecida, passando pela parametrização do docking até sua execução e visualização de resultados, em poucos clicks. O EasyVS também permite aos usuários a escolha dentre mais de 16 milhões de moléculas através de filtros baseados nas propriedades moleculares, assim como o agrupamento considerando índice de similaridade de Tanimoto. Essa ferramenta foi utilizada, em um estudo de caso, para a triagem virtual de ligantes para as GPCR (receptores acoplados a proteínas G) e apresentou resultados satisfatórios, indicando moléculas já conhecidas como ligantes, separandoas de decoys, assim como novos potenciais ligantes para serem estudados. Esse estudo mostrou-se relevante pois as GPCRs são consideradas a maior família de alvos para fármacos aprovados. Pretende-se aumentar a capacidade de processamento do servidor disponível para o EasyVS a fim de diminuir o tempo de computação das requisições, além de viabilizar novas funcionalidades para o EasyVS.