Avaliação do uso de códons em infecções virais usando como modelo o vírus da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-COV-2)

• Autor(a) principal: Elisson Nogueira Lopes
• Data de Publicação: 2022
• Tipo de documento: Tese
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFMG
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/1843/48361
• topic: Vírus; Epidemia; Códons; Bioinformática; Vigilância; Bioinformática; Síndrome Respiratória Aguda Grave; Vírus; Códon

O surto de (Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2) SARS-CoV-2 que começou no ano de 2019, em Wuhan, China, rapidamente tornou-se uma preocupação global. Após alguns meses, o vírus foi identificado em todos os continentes do mundo e, em 11 de março de 2020, a Organização Mundial da Saúde (OMS) declarou a doença causada pelo SARS-CoV-2 (Corona Virus Disease: Covid-19) como pandemia. A partir disso, a rápida disseminação viral e o alarmante número de indivíduos infectados contribuíram para o surgimento de diferentes variantes ao longo do tempo. No presente trabalho, propôs-se uma metodologia de bioinformática associada à vigilância genômica como um meio de ajudar a elucidar o processo infeccioso causado por esse patógeno emergente. Para isso, foram analisadas todas as sequências referências disponíveis de Betacoronavírus de forma a correlacioná-las com a disponibilidade de tRNAs dos hospedeiros. Essas análises permitiram identificar um mecanismo de competição entre os Betacoronavírus e os hospedeiros, através da seleção de códons, além de identificar oito hospedeiros suscetíveis como potenciais reservatórios para o SARS-CoV-2. Adicionalmente, foi estimado o impacto de Variantes de Preocupação Internacionais (VOCs) introduzidas no Brasil, avaliando como a substituição de diferentes nucleotídeos, ao longo do tempo, possibilitou o aumento dos números de casos e de mortes no país. Os resultados reforçam a necessidade da implementação da vigilância genômica em larga escala, para compreender as medidas de transmissão de variantes e para auxiliar a implementação de rápidas medidas de contenção. A metodologia aplicada neste estudo pode ser replicada para a caracterização de outros possíveis patógenos emergentes e reemergentes em âmbitos nacional e mundial.