Algoritmos paralelos realísticos para a maior subsequência comum

• Autor(a) principal: Peviani, Claudia Regina Tinós
• Data de Publicação: 2009
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFMS
• Texto Completo: https://repositorio.ufms.br/handle/123456789/454
• topic: Programação Paralela; Algoritmos; Programação Dinâmica; Algoritmos Úteis e Específicos

Neste trabalho estudou-se o problema da Maior Subsequência Comum (Longest Common Subsequence - LCS) que deseja encontrar uma subsequência comum de comprimento máximo de duas sequências. O problema LCS pode ser resolvido em tempo sequencial quadrático usando a técnica de programação dinâmica. Este trabalho consiste em estudar os algoritmos paralelos baseados nos modelos realísticos para resolver o problema LCS. Inicialmente estudou-se um algoritmo sequencial, um algoritmo paralelo no modelo PRAM e um no modelo realístico que encontra a LCS de todas as subcadeias. Fez-se uma implementação paralela realística com O(p) rodadas de comunicação usando p processadores. O resultado desta implementação não obteve speedup satisfatório, o que motivou o estudo mais teórico da paralelização do problema. Neste sentido, a partir do algoritmo PRAM descreveu-se uma solução paralela realística, usando estrutura de dados bem conhecidas como soma prefixa paralela e a técnica de pointer jumping.