IDENTIFICAÇÃO DE PADRÕES DE EXPRESSÃO EM DOENÇAS GENÉTICAS USANDO UMA REDE DE INTEGRAÇÃO DE VIAS DE MANUTENÇÃO DO GENOMA, ANGIOGÊNESE, HIPÓXIA EVIGILÂNCIA IMUNOLÓGICA

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Vieira, Sylvio André Garcia
Data de Publicação: 2016
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional Universidade Franciscana
Texto Completo: http://www.tede.universidadefranciscana.edu.br:8080/handle/UFN-BDTD/571
Resumo: The analysis of the biological formations through computer programs has been turning the interpretation of information quicker, more practical, and more reliable. There are a great number of data stored in specialized databases all over the world, that need to be analyzed and interpreted. On the biological databases, there are data obtained from a variety of ways of research in organisms affected by illnesses such as adenoma and carcinoma. There are also data related to the processes of maintenance of the organism in various levels, called pathways. These pathways act in the organism in a different way in every stage, such as in its normality or in the presence of some genetic disease. This study aims at using graphs in order to develop a model of pathway interaction network that incorporate the maintenance of the genome and other activities of the organism conveyed in adenoma and carcinoma of the adrenal cortex, identifying those who are active in the organism in the presence of gene mutation. In order to determine which pathways are modified in the presence of each disease was used a calculus of relative activity of the route associated to the statistical test Z. To visualize the results, graphs were used, whose junctions represent the pathways and whose edges represent the interactions. Through the computer program developed, it was possible to identify the differences that the organism presents in these conditions, allowing the suggestion of employment of this technique to identify modifications that the organism may present when a new nanoencapsulated drug is used.
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On the biological databases, there are data obtained from a variety of ways of research in organisms affected by illnesses such as adenoma and carcinoma. There are also data related to the processes of maintenance of the organism in various levels, called pathways. These pathways act in the organism in a different way in every stage, such as in its normality or in the presence of some genetic disease. This study aims at using graphs in order to develop a model of pathway interaction network that incorporate the maintenance of the genome and other activities of the organism conveyed in adenoma and carcinoma of the adrenal cortex, identifying those who are active in the organism in the presence of gene mutation. In order to determine which pathways are modified in the presence of each disease was used a calculus of relative activity of the route associated to the statistical test Z. To visualize the results, graphs were used, whose junctions represent the pathways and whose edges represent the interactions. Through the computer program developed, it was possible to identify the differences that the organism presents in these conditions, allowing the suggestion of employment of this technique to identify modifications that the organism may present when a new nanoencapsulated drug is used.A análise de informações biológicas por meios computacionais vem tornando as atividades de interpretação das informações mais rápida, prática e confiável. Existem muitos dados depositados em bancos especializados ao redor do mundo, que precisam ser avaliados e interpretados. Nestes bancos de dados de informações biológicas há informações resultantes de várias formas de pesquisas em organismos acometidos de doenças, como adenomas e carcinomas. A evolução dessas doenças ocorre através da ativação de vias muito específicas. Estas vias atuam no organismo de forma diferente em cada estado, como na sua normalidade ou na presença de alguma doença genética. Este trabalho tem por objetivo utilizar grafos para desenvolver um modelo de redes de interação de vias que envolvam a manutenção do genoma e outras atividades do organismo expressas em adenoma e carcinoma de córtex adrenal, identificando as vias expressas no organismo na presença de mutações. Para determinar quais vias estariam com a sua expressão alterada na presença de cada doença, foi utilizado o cálculo de atividade relativa da via associado ao teste estatístico Z. Para visualização dos resultados foram utilizados grafos, cujos nós representam as vias e as arestas representam as interações. Por meio do sistema computacional desenvolvido foi possível identificar as diferenças que o organismo apresenta nestas condições, permitido a sugestão de utilização desta técnica para a identificação das modificações que o organismo possa apresentar quando da utilização de um novo fármaco nanoencapsulado.Submitted by MARCIA ROVADOSCHI (marciar@unifra.br) on 2018-08-20T12:12:52Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_SylvioAndreGarciaVieira.pdf: 3455615 bytes, checksum: 2826b01774c4732fb20d76dd1dde7a09 (MD5)Made available in DSpace on 2018-08-20T12:12:52Z (GMT). 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Biociências e Nanomateriais
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