Homoplasy everywhere, coming fron the andes:phylogenetic relationships and historical Biogeography of solanum Brevantherum (Seithe) Solanaceae
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Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da Universidade Federal do Oeste do Pará (UFOPA) |
Texto Completo: | https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/handle/123456789/448 |
Resumo: | O soerguimento dos Andes desempenhou um papel determinante na diversificação de plantas neotropicais. Padrões de divergência entre plantas têm sido abordados para entender as causas e processos envolvidos no diversidade de espécies que encontramos hoje. No entanto, o estudo da distribuição de espécies através dos escalas geográficos e de tempo geológico continua a ser complexo. Nesse trabalho nós usamos a seção Brevantherum do gênero Solanum (Solanaceae) como modelo para entender padrões da história biogeográfica de plantas neotropicais, devido a sua ampla distribuição geográfica e ao caráter comum das espécies entre as regiões. Geramos sequências de dois marcadores nucleares e um plastidial (ITS, waxy, trnT-F) para inferir relações filogenéticas sob as abordagens Bayesiana e de Máxima Verossimilhança. Em seguida, estimamos a idade das principais divisões e a área ancestral das linhagens. Por fim, simulamos os principais processos que conduzem o grupo à sua distribuição atual, utilizando mapeamento biogeográfico estocástico e reconstruindo a evolução de caracteres taxonômicos relevantes. Os resultados mostraram o não monofiletismo da seção Brevantherum como previamente reconhecida e evidenciaram o estado homoplásico de caracteres tradicionalmente usados para sua circunscrição. Análises de tempo de divergência sugerem que os dois clados principais encontrados na seção Brevantherum divergiram em torno de 4,5 Mya no |
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GIACOMIN, Leandro LacerdaANDRÉ, ThiagoDURAN, Juan David Tovar2021-03-09T20:26:42Z2021-03-09T20:26:42Z2019-06DURAN, Juan David. Homoplasy everywhere, coming fron the andes:phylogenetic relationships and historical Biogeography of solanum Brevantherum (Seithe) Solanaceae. Orientador: Leandro Lacerda Giacomin. Coorientador: Thiago André. 2019. 92f. Dissertação (Mestrado em Biodiversidade) - Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade. Universidade Federal do Oeste do Pará. Santarém, 2019. Disponível em: https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/handle/123456789/448 Acesso em:https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/handle/123456789/448O soerguimento dos Andes desempenhou um papel determinante na diversificação de plantas neotropicais. Padrões de divergência entre plantas têm sido abordados para entender as causas e processos envolvidos no diversidade de espécies que encontramos hoje. No entanto, o estudo da distribuição de espécies através dos escalas geográficos e de tempo geológico continua a ser complexo. Nesse trabalho nós usamos a seção Brevantherum do gênero Solanum (Solanaceae) como modelo para entender padrões da história biogeográfica de plantas neotropicais, devido a sua ampla distribuição geográfica e ao caráter comum das espécies entre as regiões. Geramos sequências de dois marcadores nucleares e um plastidial (ITS, waxy, trnT-F) para inferir relações filogenéticas sob as abordagens Bayesiana e de Máxima Verossimilhança. Em seguida, estimamos a idade das principais divisões e a área ancestral das linhagens. Por fim, simulamos os principais processos que conduzem o grupo à sua distribuição atual, utilizando mapeamento biogeográfico estocástico e reconstruindo a evolução de caracteres taxonômicos relevantes. Os resultados mostraram o não monofiletismo da seção Brevantherum como previamente reconhecida e evidenciaram o estado homoplásico de caracteres tradicionalmente usados para sua circunscrição. Análises de tempo de divergência sugerem que os dois clados principais encontrados na seção Brevantherum divergiram em torno de 4,5 Mya noAndean uplift played a determinant role in neotropical plant diversification. Patterns of divergence in plants have long been studied in order to understand the causes and processes involved in the accumulation of species. However, the study of species distribution through geological times remains complex. We used Solanum sect. Brevantherum (Solanaceae) as a model here, due to its broad geographic distribution across the Neotropics. We generated sequences from two nuclear and one plastid marker (ITS, waxy, trnT-F) to infer phylogenetic relationships under Bayesian and Maximum likelihood approaches. We estimated the age of main splits and the ancestral areas of the main lineages. Finally, we simulated the main processes driving the current distribution of the group using biogeographic stochastic mapping and inferred ancestral character states of relevant morphological characters. Results show the non-monophyly of the sect. Brevantherum as previously recognized and high level of homoplasy in morphological characters traditionally used to circumscribe the section. Divergence time analyses suggest that the two main clades found in sect. BrevantherumUniversidade Federal do Oeste do ParáPrograma de Pós-Graduação em BiodiversidadeUFOPABRASILINSTITUTO DE CIÊNCIAS E TECNOLOGIA DAS ÁGUASAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United Stateshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/info:eu-repo/semantics/openAccessGEOCIÊNCIAS; RECURSOS NATURAISBIODIVERSIDADESISTEMÁTICA E EVOLUÇÃOAmérica do SulDispersãoEvoluçãoHomoplasy everywhere, coming fron the andes:phylogenetic relationships and historical Biogeography of solanum Brevantherum (Seithe) Solanaceaeinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da Universidade Federal do Oeste do Pará (UFOPA)instname:Universidade Federal do Oeste do Pará (UFOPA)instacron:UFOPAORIGINALDissertação_HomoplasyEverywhereComing.pdfDissertação_HomoplasyEverywhereComing.pdfapplication/pdf5778965https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/bitstream/123456789/448/1/Disserta%c3%a7%c3%a3o_HomoplasyEverywhereComing.pdf60288897ca466d563fb062ee5127613eMD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/bitstream/123456789/448/2/license_rdf9868ccc48a14c8d591352b6eaf7f6239MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81748https://repositorio.ufopa.edu.br/jspui/bitstream/123456789/448/3/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD53123456789/4482021-03-09 17:29:06.539oai:repositorio.ufopa.edu.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufopa.edu.br/oai/requestopendoar:2024-06-12T15:04:19.896865Repositório Institucional da Universidade Federal do Oeste do Pará (UFOPA) - Universidade Federal do Oeste do Pará (UFOPA)false |
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