Análise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicos

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: MATA SUCRE, Yennifer Carolina
Data de Publicação: 2020
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPE
Texto Completo: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/38611
Resumo: MATA SUCRE, Yennifer Carolina, também é conhecida em citações bibliográficas por: Mata-Sucre, Yennifer
id UFPE_3a39a5da145b436980c4566a329f79f6
oai_identifier_str oai:repositorio.ufpe.br:123456789/38611
network_acronym_str UFPE
network_name_str Repositório Institucional da UFPE
repository_id_str 2221
spelling MATA SUCRE, Yennifer Carolinahttp://lattes.cnpq.br/4362443080153184http://lattes.cnpq.br/3626102935973855SOUZA, Luiz Gustavo2020-11-11T14:31:36Z2020-11-11T14:31:36Z2020-02-18MATA SUCRE, Yennifer Carolina. Análise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicos. 2020. Dissertação (Mestrado em Biologia Vegetal) - Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2020.https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/38611MATA SUCRE, Yennifer Carolina, também é conhecida em citações bibliográficas por: Mata-Sucre, YenniferO grupo Caesalpinia é composto por 27 gêneros e 225 espécies. Apresenta distribuição pantropical em florestas tropicais sazonalmente secas (do inglês SDTF), principalmente no continente americano. Cariotipicamente o grupo é caracterizado pela estabilidade numérica (2n = 24), porém apresenta uma alta diversidade na quantidade e distribuição de bandas heterocromáticas. Neste trabalho, a caracterização do grupo foi expandida para 12 novas espécies, as quais mostraram bandas pericentroméricas CMA+/DAPI- e CMA0/DAPI- associadas com as suas distribuições geográficas. Além disso, foi demonstrado estatisticamente uma autocorrelação da intensidade CMA/DAPI ao longo do cromossomo, tamanho do genoma e a distribuição geográfica (latitude) no grupo. Embora, o retrotransposons LTR Ty3/Gypsy da linhagem Tekay, seja um dos principais componentes da heterocromatina CMA+ pericentromerica nas espécies de Caesalpinia do Nordeste brasileiro (Cenostigma microphyllum, Libidibia ferrea e Paubrasilia echinata), nossos resultados demonstram que não é o elemento mais abundante em Erythrostemon hughesii. De fato, E. hughesii (uma espécie sem bandas CMA+ pericentromericas) tem uma baixa proporção de retrotransposons Ty3/Gypsy-Tekay e uma elevada abundância de sequências de DNA satélites na heterochromatina. Isso demonstra que as bandas de heterocromatina CMA+ são altamente polimórficas no grupo Caesalpinia e representa um hotspot de sequências repetitivas. Os resultados do presente trabalho corroboram a importância das análises citogenômicas no grupo Caesalpinia para a caracterização cromossômica, assim como a importância do uso de sequências repetitivas nos métodos comparativos.PAEC-OEA-GCUBThe Caesalpinia group is formed by 27 genera and 225 species with pantropical distribution in seasonally dry tropical forests (SDTF), mainly in the American continent. Karyotypically the group is characterized by numerical stability (2n = 24), however was observed a high diversity in the amount and distribution of heterochromatin bands. In this work, the characterization of the group was expanded to 12 new species, which showed pericentromeric CMA+/DAPI- and CMA0/DAPI- bands, associated with their geographic distributions. In addition, was statistically demonstrated a self-correlation of CMA / DAPI intensity along the chromosome, genome size and geographical distribution (latitude) of the group. Although the retrotransposons LTR Ty3 / Gypsy of the Tekay lineage, being one of the main components of the heterochromatin CMA+ pericentromeric in the Northeast Brazil Caesalpinia species (Cenostigma microphyllum, Libidibia ferrea and Paubrasilia echinata), our results demonstrate that it is not the most abundant element in Erythrostemon hughesii. In fact, E. hughesii (a species without CMA+ pericentromeric bands) has a low proportion of Ty3 / Gypsy-Tekay retrotransposons and a high abundance of satellite DNA sequences in their heterochromatin. This demonstrates that the CMA+ heterochromatin bands are highly polymorphic in the Caesalpinia group and represent a hotspot of repetitive sequences. The results of the present study corroborate the importance of cytogenomic analyzes in the Caesalpinia group for chromosome characterization, as well as the importance of using repetitive sequences in comparative methods.porUniversidade Federal de PernambucoPrograma de Pos Graduacao em Biologia VegetalUFPEBrasilAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessCaesalpiniaEvolução do genomaFilogenéticaAnálise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicosAnálise da evolução da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genômicosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesismestradoreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPETEXTDISSERTAÇÃO Yennifer Carolina Mata Sucre.pdf.txtDISSERTAÇÃO Yennifer Carolina Mata Sucre.pdf.txtExtracted texttext/plain231940https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38611/4/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Yennifer%20Carolina%20Mata%20Sucre.pdf.txt23318c43665f6a091408d6539ac3ae52MD54THUMBNAILDISSERTAÇÃO Yennifer Carolina Mata Sucre.pdf.jpgDISSERTAÇÃO Yennifer Carolina Mata Sucre.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1197https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38611/5/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Yennifer%20Carolina%20Mata%20Sucre.pdf.jpgf318f38d6c549fc8a9d906ec65d13b25MD55ORIGINALDISSERTAÇÃO Yennifer Carolina Mata Sucre.pdfDISSERTAÇÃO Yennifer Carolina Mata Sucre.pdfapplication/pdf3485923https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38611/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Yennifer%20Carolina%20Mata%20Sucre.pdf9ce75ea667a43d7b58d58e896c65ff26MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38611/2/license_rdfe39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82310https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38611/3/license.txtbd573a5ca8288eb7272482765f819534MD53123456789/386112020-11-12 02:16:11.56oai:repositorio.ufpe.br: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ório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212020-11-12T05:16:11Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Análise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicos
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv Análise da evolução da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genômicos
title Análise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicos
spellingShingle Análise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicos
MATA SUCRE, Yennifer Carolina
Caesalpinia
Evolução do genoma
Filogenética
title_short Análise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicos
title_full Análise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicos
title_fullStr Análise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicos
title_full_unstemmed Análise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicos
title_sort Análise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicos
author MATA SUCRE, Yennifer Carolina
author_facet MATA SUCRE, Yennifer Carolina
author_role author
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4362443080153184
dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/3626102935973855
dc.contributor.author.fl_str_mv MATA SUCRE, Yennifer Carolina
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv SOUZA, Luiz Gustavo
contributor_str_mv SOUZA, Luiz Gustavo
dc.subject.por.fl_str_mv Caesalpinia
Evolução do genoma
Filogenética
topic Caesalpinia
Evolução do genoma
Filogenética
description MATA SUCRE, Yennifer Carolina, também é conhecida em citações bibliográficas por: Mata-Sucre, Yennifer
publishDate 2020
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2020-11-11T14:31:36Z
dc.date.available.fl_str_mv 2020-11-11T14:31:36Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2020-02-18
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv MATA SUCRE, Yennifer Carolina. Análise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicos. 2020. Dissertação (Mestrado em Biologia Vegetal) - Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2020.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/38611
identifier_str_mv MATA SUCRE, Yennifer Carolina. Análise da diversificação da heterocromatina do grupo Caesalpinia (Leguminosae) baseado em dados citomoleculares e genomicos. 2020. Dissertação (Mestrado em Biologia Vegetal) - Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2020.
url https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/38611
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pernambuco
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pos Graduacao em Biologia Vegetal
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFPE
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pernambuco
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPE
instname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
instacron:UFPE
instname_str Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
instacron_str UFPE
institution UFPE
reponame_str Repositório Institucional da UFPE
collection Repositório Institucional da UFPE
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38611/4/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Yennifer%20Carolina%20Mata%20Sucre.pdf.txt
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38611/5/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Yennifer%20Carolina%20Mata%20Sucre.pdf.jpg
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38611/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Yennifer%20Carolina%20Mata%20Sucre.pdf
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38611/2/license_rdf
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38611/3/license.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv 23318c43665f6a091408d6539ac3ae52
f318f38d6c549fc8a9d906ec65d13b25
9ce75ea667a43d7b58d58e896c65ff26
e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34
bd573a5ca8288eb7272482765f819534
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
repository.mail.fl_str_mv attena@ufpe.br
_version_ 1802310735333687296

Registros relacionados