Caracterização e dinâmica evolutiva do satelitoma de Dichotomius schiffleri (coleoptera: scarabaeidae) e mapeamento cromossômico de DNAsat em espécies do grupo D. sericeus

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: COSTA, Moara Rodrigues
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPE
dARK ID: ark:/64986/001300000gfgx
Texto Completo: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/34137
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O satelitoma foi sequenciado na plataforma Illumina Hiseq2000. Os DNAsat foram identificados no RepeatExplorer e caracterizados no Geneious 4.5.8. A HC foi localizada por bandeamento C e o mapeamento cromossômico dos DNAsat por hibridização in situ fluorescente. Em D. schiffleri foram identificadas 26 famílias DNAsat distribuídas em quatro superfamílias (SF), sendo a SF01 a mais diversa e abundante. Essas famílias demonstraram variação no tamanho dos monômeros e a maior riqueza em AT descrita em DNAsat identificados em Coleoptera. Além disso, o mapeamento cromossômico demonstrou que esses DNAsat são abundantes em regiões pericentroméricas, ricas em HC, demonstrando um eficaz processo de equilocalidade da heterocromatina e sugerindo o papel dessas sequências no cariótipo da espécie. Apenas uma família sofreu intersticialização, estando localizada na eucromatina. A hibridização heteróloga das duas famílias mais abundantes em outras espécies do grupo D. sericeus revelaram ancestralidade comum e variação interespecífica na localização dessas sequências. Esses dados representam a primeira descrição do DNAsat em Scarabaeidae e sugere o papel dessas sequências na manutenção da arquitetura da HC em D. schiffleri.CNPqThe satellite DNA (satDNA) – highly repetitive sequences in tandem – presents rapid evolutionary dynamics and it is the major component of constitutive heterochromatin (CH). In this study, the characterization and chromosomal mapping of satDNA was performed in D. schiffleri, aiming to analyze the organization and distribution of these sequences and their relation with the variation observed in the HC of this genus. Additionally, it the heterologous mapping of the two most abundant satDNA families was performed in order to investigate the conservation of these sequences in sericeus group. The satelitome was sequenced on the Illumina Hiseq2000 platform. DNAsat were identified in RepeatExplorer and characterized in Geneious 4.5.8. The CH was localized by C-banding and chromosome mapping by fluorescence in situ hybridization. In D. schiffleri, 26 satDNA families were found distributed in four superfamilies (SFs), with SF01 being the most diverse and abundant. These families showed great variation of the monomers size and the largest richness of AT described in Coleoptera. In addition, chromosomal mapping demonstrated that satDNA are abundant in region with richness for CH pericentromeric regions, demonstrating an efficient equilocality of heterochromatin process and suggesting the role of these sequences in the karyotype of D. schiffleri. Only one family suffered interstitialization, being located in euchromatin. The heterologous hybridization of two most abundant families revealed common ancestry and interspecific variation in the location of these sequences. These data represent the first description of satDNA in Scarabaeidae and suggest the role of these sequences in the maintenance of CH architecture in D. schiffleri.porUniversidade Federal de PernambucoPrograma de Pos Graduacao em GeneticaUFPEBrasilAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessDichotomius schiffleriMapeamento heterólogoHeterocromatina constitutivaCaracterização e dinâmica evolutiva do satelitoma de Dichotomius schiffleri (coleoptera: scarabaeidae) e mapeamento cromossômico de DNAsat em espécies do grupo D. sericeusinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesismestradoreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPETHUMBNAILDISSERTAÇÃO Moara Rodrigues Costa.pdf.jpgDISSERTAÇÃO Moara Rodrigues Costa.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1218https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/34137/5/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Moara%20Rodrigues%20Costa.pdf.jpgf1df39334af193ca3383e0af892264b1MD55ORIGINALDISSERTAÇÃO Moara Rodrigues Costa.pdfDISSERTAÇÃO Moara Rodrigues Costa.pdfapplication/pdf1133083https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/34137/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Moara%20Rodrigues%20Costa.pdfd194eab019d70705e8a29ed23c19c1ceMD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; 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