Análise in silico da Expressão Diferencial de Transcritos SuperSAGE de Proteínas Quinases em Cana-de-Açúcar em Resposta ao Déficit Hídrico

• Autor(a) principal: Correia, Carolina Neves
• Data de Publicação: 2013
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFPE
• Texto Completo: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/13108
• topic: Quinase; Transcrição diferencial; Cana-de-açúcar; Supressão de rega

Estudos de expressão gênica diferencial associados a perfis metabólicos de plantas submetidas a um estresse alvo são abordagens valiosas na compreensão da tolerância vegetal. Por sua vez, proteínas quinases são importantes componentes da sinalização celular, catalisando a transferência do grupo fosfato de uma molécula de ATP para um substrato, em processo chamado fosforilação, com participação ativa na aclimatação às mudanças ambientais. O presente trabalho teve como objetivo comparar in silico perfis de transcrição, de unitags SuperSAGE diferencialmente expressas e anotadas como prováveis quinases, de genótipos de cana-de-açúcar tolerantes e sensíveis ao déficit hídrico (24 h de supressão de rega). Para tanto, sequências expressas (EST) de gramíneas, de diversos bancos de dados públicos, similares às unitags (análises BLASTn), foram caracterizadas em termos de Ontologia Gênica, que conjuntamente com as anotações das EST permitiram identificar e classificar as quinases em famílias. Através dos respectivos números de Classificação Enzimática (EC), mapas metabólicos foram gerados, permitindo comparar os grupos de genótipos contrastantes (tolerantes e sensíveis ao estresse). Foram observadas 539 prováveis quinases, que distribuídas em 41 famílias e em 18 vias metabólicas, quando associadas às unitags, permitiram discuti-las com base em oito classes hierárquicas funcionais. Importantes diferenças na expressão desses transcritos mapeados como quinases, entre os grupos de genótipos tolerantes e sensíveis, após 24 h de supressão de rega, foram observadas neste trabalho, contribuindo para um melhor entendimento da percepção do estresse aplicado, podendo ser útil ao melhoramento genético da cana-de-açúcar.