Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFPE |
dARK ID: | ark:/64986/001300000gx7s |
Texto Completo: | https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/38073 |
Resumo: | A eletroforese em gel de poliacrilamida representa uma técnica valiosa para separação e caracterização dos fragmentos de DNA. Esta metodologia pode ser aplicada após a reação em cadeia da polimerase (PCR) para caracterizar marcadores genéticos, como Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). O principal objetivo neste trabalho foi implementar a metodologia para melhorar a definição dos padrões e da variabilidade dentro e entre populações brasileiras de Drosophila willistoni. Pertencente ao gênero Drosophila Fallen 1823, D. willistoni é a espécie de drosofilídeo que possui a maior distribuição geográfica, versatilidade ecológica, e capacidade de explorar diversos tipos de habitats, tais como matas, formações abertas e cidades. A metodologia aqui testada consistiu-se na separação de fragmentos ISSR com o uso dos primers 844 (CT8RC) e 868 (GAA6). A eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE) foi feita na concentração de 6%, com 1 mm de espessura, não desnaturante, e com revelação em Nitrato de Prata. Os resultados permitiram o reconhecimento de fragmentos polimórficos nas populações de D. willistoni estudadas. A metodologia foi também testada para definição de padrões espécie-específicos do elemento transponível P em duas espécies crípticas a D. willistoni. Os resultados confirmam a hipótese de que a PAGE é eficaz para visualização, definição de padrões para espécies e de populações de Drosophila, abrindo perspectivas para mais estudos acerca dos padrões genéticos de espécies neotropicais. |
id |
UFPE_91b2fbe2cf11b1bac22a7a5ceeb57ccf |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufpe.br:123456789/38073 |
network_acronym_str |
UFPE |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFPE |
repository_id_str |
2221 |
spelling |
SILVA, Anadeje Celerino dos Santoshttp://lattes.cnpq.br/4737468964817426http://lattes.cnpq.br/6223762316743262ROHDE, Cláudia2020-09-23T21:02:34Z2020-09-23T21:02:34Z2019-09-16SILVA, Anadeje Celerino dos Santos. Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila. 2019. Dissertação (Mestrado em Saúde Humana e Meio Ambiente) – Universidade Federal de Pernambuco, Vitória de Santo Antão, 2019.https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/38073ark:/64986/001300000gx7sA eletroforese em gel de poliacrilamida representa uma técnica valiosa para separação e caracterização dos fragmentos de DNA. Esta metodologia pode ser aplicada após a reação em cadeia da polimerase (PCR) para caracterizar marcadores genéticos, como Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). O principal objetivo neste trabalho foi implementar a metodologia para melhorar a definição dos padrões e da variabilidade dentro e entre populações brasileiras de Drosophila willistoni. Pertencente ao gênero Drosophila Fallen 1823, D. willistoni é a espécie de drosofilídeo que possui a maior distribuição geográfica, versatilidade ecológica, e capacidade de explorar diversos tipos de habitats, tais como matas, formações abertas e cidades. A metodologia aqui testada consistiu-se na separação de fragmentos ISSR com o uso dos primers 844 (CT8RC) e 868 (GAA6). A eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE) foi feita na concentração de 6%, com 1 mm de espessura, não desnaturante, e com revelação em Nitrato de Prata. Os resultados permitiram o reconhecimento de fragmentos polimórficos nas populações de D. willistoni estudadas. A metodologia foi também testada para definição de padrões espécie-específicos do elemento transponível P em duas espécies crípticas a D. willistoni. Os resultados confirmam a hipótese de que a PAGE é eficaz para visualização, definição de padrões para espécies e de populações de Drosophila, abrindo perspectivas para mais estudos acerca dos padrões genéticos de espécies neotropicais.CAPESPolyacrylamide gel electrophoresis represents a valuable technique for separation and characterization of DNA fragments. This methodology can be applied after polymerase chain reaction (PCR) to characterize genetic markers such as Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). The main objective of this work was to implement the methodology to improve the definition of patterns and variability within and among Brazilian populations of Drosophila willistoni. Belonging to the genus Drosophila Fallen 1823, D. willistoni is the species of drosophilid that has the largest geographical distribution, ecological versatility, and the ability to explore diverse habitat types such as forests, open formations, and cities. The methodology tested here was the separation of ISSR fragments using primers 844 (CT8RC) and 868 (GAA6). Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) was performed at a concentration of 6%, 1 mm thick, nondenaturing, and Silver Nitrate staining. The results allowed the recognition of polymorphic fragments in the D. willistoni populations studied. The methodology was also tested to define species-specific patterns of the transposable element P in two cryptic species to D. willistoni. The results confirm the hypothesis that PAGE is effective for visualization, pattern setting for Drosophila species and populations, opening perspectives for further studies on the genetic patterns of Neotropical species.porUniversidade Federal de PernambucoPrograma de Pos Graduacao em Saude Humana e Meio AmbienteUFPEBrasilAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessDrosophilaPadrões PolimórficosEspeciação GenéticaSubgrupo willistoniEletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de DrosophilaUtilização da eletroforese em gel de poliacrilamida como mecanismo de análise dos fragmentos obtidos pelo marcador Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) em Drosophila willistoniinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesismestradoreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPEORIGINALDISSERTAÇÃO Anadeje Celerino dos Santos Silva.pdfDISSERTAÇÃO Anadeje Celerino dos Santos Silva.pdfapplication/pdf1395256https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Anadeje%20Celerino%20dos%20Santos%20Silva.pdf2594319b329951788c4a952b33c1c7b2MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/2/license_rdfe39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82310https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/3/license.txtbd573a5ca8288eb7272482765f819534MD53TEXTDISSERTAÇÃO Anadeje Celerino dos Santos Silva.pdf.txtDISSERTAÇÃO Anadeje Celerino dos Santos Silva.pdf.txtExtracted texttext/plain80933https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/4/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Anadeje%20Celerino%20dos%20Santos%20Silva.pdf.txtb65bcf6d189fe5766a31b6a897aaff7fMD54THUMBNAILDISSERTAÇÃO Anadeje Celerino dos Santos Silva.pdf.jpgDISSERTAÇÃO Anadeje Celerino dos Santos Silva.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1317https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/5/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Anadeje%20Celerino%20dos%20Santos%20Silva.pdf.jpg5c4e0095e27c8b8324b537d960ca69a9MD55123456789/380732020-09-24 02:14:55.263oai:repositorio.ufpe.br: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ório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212020-09-24T05:14:55Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila |
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv |
Utilização da eletroforese em gel de poliacrilamida como mecanismo de análise dos fragmentos obtidos pelo marcador Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) em Drosophila willistoni |
title |
Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila |
spellingShingle |
Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila SILVA, Anadeje Celerino dos Santos Drosophila Padrões Polimórficos Especiação Genética Subgrupo willistoni |
title_short |
Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila |
title_full |
Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila |
title_fullStr |
Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila |
title_full_unstemmed |
Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila |
title_sort |
Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila |
author |
SILVA, Anadeje Celerino dos Santos |
author_facet |
SILVA, Anadeje Celerino dos Santos |
author_role |
author |
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/4737468964817426 |
dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/6223762316743262 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
SILVA, Anadeje Celerino dos Santos |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
ROHDE, Cláudia |
contributor_str_mv |
ROHDE, Cláudia |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Drosophila Padrões Polimórficos Especiação Genética Subgrupo willistoni |
topic |
Drosophila Padrões Polimórficos Especiação Genética Subgrupo willistoni |
description |
A eletroforese em gel de poliacrilamida representa uma técnica valiosa para separação e caracterização dos fragmentos de DNA. Esta metodologia pode ser aplicada após a reação em cadeia da polimerase (PCR) para caracterizar marcadores genéticos, como Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). O principal objetivo neste trabalho foi implementar a metodologia para melhorar a definição dos padrões e da variabilidade dentro e entre populações brasileiras de Drosophila willistoni. Pertencente ao gênero Drosophila Fallen 1823, D. willistoni é a espécie de drosofilídeo que possui a maior distribuição geográfica, versatilidade ecológica, e capacidade de explorar diversos tipos de habitats, tais como matas, formações abertas e cidades. A metodologia aqui testada consistiu-se na separação de fragmentos ISSR com o uso dos primers 844 (CT8RC) e 868 (GAA6). A eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE) foi feita na concentração de 6%, com 1 mm de espessura, não desnaturante, e com revelação em Nitrato de Prata. Os resultados permitiram o reconhecimento de fragmentos polimórficos nas populações de D. willistoni estudadas. A metodologia foi também testada para definição de padrões espécie-específicos do elemento transponível P em duas espécies crípticas a D. willistoni. Os resultados confirmam a hipótese de que a PAGE é eficaz para visualização, definição de padrões para espécies e de populações de Drosophila, abrindo perspectivas para mais estudos acerca dos padrões genéticos de espécies neotropicais. |
publishDate |
2019 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2019-09-16 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2020-09-23T21:02:34Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2020-09-23T21:02:34Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
SILVA, Anadeje Celerino dos Santos. Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila. 2019. Dissertação (Mestrado em Saúde Humana e Meio Ambiente) – Universidade Federal de Pernambuco, Vitória de Santo Antão, 2019. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/38073 |
dc.identifier.dark.fl_str_mv |
ark:/64986/001300000gx7s |
identifier_str_mv |
SILVA, Anadeje Celerino dos Santos. Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila. 2019. Dissertação (Mestrado em Saúde Humana e Meio Ambiente) – Universidade Federal de Pernambuco, Vitória de Santo Antão, 2019. ark:/64986/001300000gx7s |
url |
https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/38073 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ info:eu-repo/semantics/openAccess |
rights_invalid_str_mv |
Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Pernambuco |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pos Graduacao em Saude Humana e Meio Ambiente |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFPE |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Pernambuco |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFPE instname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE) instacron:UFPE |
instname_str |
Universidade Federal de Pernambuco (UFPE) |
instacron_str |
UFPE |
institution |
UFPE |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFPE |
collection |
Repositório Institucional da UFPE |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Anadeje%20Celerino%20dos%20Santos%20Silva.pdf https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/2/license_rdf https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/3/license.txt https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/4/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Anadeje%20Celerino%20dos%20Santos%20Silva.pdf.txt https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/5/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Anadeje%20Celerino%20dos%20Santos%20Silva.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
2594319b329951788c4a952b33c1c7b2 e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 bd573a5ca8288eb7272482765f819534 b65bcf6d189fe5766a31b6a897aaff7f 5c4e0095e27c8b8324b537d960ca69a9 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE) |
repository.mail.fl_str_mv |
attena@ufpe.br |
_version_ |
1815172822511648768 |