Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: SILVA, Anadeje Celerino dos Santos
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPE
dARK ID: ark:/64986/001300000gx7s
Texto Completo: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/38073
Resumo: A eletroforese em gel de poliacrilamida representa uma técnica valiosa para separação e caracterização dos fragmentos de DNA. Esta metodologia pode ser aplicada após a reação em cadeia da polimerase (PCR) para caracterizar marcadores genéticos, como Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). O principal objetivo neste trabalho foi implementar a metodologia para melhorar a definição dos padrões e da variabilidade dentro e entre populações brasileiras de Drosophila willistoni. Pertencente ao gênero Drosophila Fallen 1823, D. willistoni é a espécie de drosofilídeo que possui a maior distribuição geográfica, versatilidade ecológica, e capacidade de explorar diversos tipos de habitats, tais como matas, formações abertas e cidades. A metodologia aqui testada consistiu-se na separação de fragmentos ISSR com o uso dos primers 844 (CT8RC) e 868 (GAA6). A eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE) foi feita na concentração de 6%, com 1 mm de espessura, não desnaturante, e com revelação em Nitrato de Prata. Os resultados permitiram o reconhecimento de fragmentos polimórficos nas populações de D. willistoni estudadas. A metodologia foi também testada para definição de padrões espécie-específicos do elemento transponível P em duas espécies crípticas a D. willistoni. Os resultados confirmam a hipótese de que a PAGE é eficaz para visualização, definição de padrões para espécies e de populações de Drosophila, abrindo perspectivas para mais estudos acerca dos padrões genéticos de espécies neotropicais.
id UFPE_91b2fbe2cf11b1bac22a7a5ceeb57ccf
oai_identifier_str oai:repositorio.ufpe.br:123456789/38073
network_acronym_str UFPE
network_name_str Repositório Institucional da UFPE
repository_id_str 2221
spelling SILVA, Anadeje Celerino dos Santoshttp://lattes.cnpq.br/4737468964817426http://lattes.cnpq.br/6223762316743262ROHDE, Cláudia2020-09-23T21:02:34Z2020-09-23T21:02:34Z2019-09-16SILVA, Anadeje Celerino dos Santos. Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila. 2019. Dissertação (Mestrado em Saúde Humana e Meio Ambiente) – Universidade Federal de Pernambuco, Vitória de Santo Antão, 2019.https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/38073ark:/64986/001300000gx7sA eletroforese em gel de poliacrilamida representa uma técnica valiosa para separação e caracterização dos fragmentos de DNA. Esta metodologia pode ser aplicada após a reação em cadeia da polimerase (PCR) para caracterizar marcadores genéticos, como Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). O principal objetivo neste trabalho foi implementar a metodologia para melhorar a definição dos padrões e da variabilidade dentro e entre populações brasileiras de Drosophila willistoni. Pertencente ao gênero Drosophila Fallen 1823, D. willistoni é a espécie de drosofilídeo que possui a maior distribuição geográfica, versatilidade ecológica, e capacidade de explorar diversos tipos de habitats, tais como matas, formações abertas e cidades. A metodologia aqui testada consistiu-se na separação de fragmentos ISSR com o uso dos primers 844 (CT8RC) e 868 (GAA6). A eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE) foi feita na concentração de 6%, com 1 mm de espessura, não desnaturante, e com revelação em Nitrato de Prata. Os resultados permitiram o reconhecimento de fragmentos polimórficos nas populações de D. willistoni estudadas. A metodologia foi também testada para definição de padrões espécie-específicos do elemento transponível P em duas espécies crípticas a D. willistoni. Os resultados confirmam a hipótese de que a PAGE é eficaz para visualização, definição de padrões para espécies e de populações de Drosophila, abrindo perspectivas para mais estudos acerca dos padrões genéticos de espécies neotropicais.CAPESPolyacrylamide gel electrophoresis represents a valuable technique for separation and characterization of DNA fragments. This methodology can be applied after polymerase chain reaction (PCR) to characterize genetic markers such as Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). The main objective of this work was to implement the methodology to improve the definition of patterns and variability within and among Brazilian populations of Drosophila willistoni. Belonging to the genus Drosophila Fallen 1823, D. willistoni is the species of drosophilid that has the largest geographical distribution, ecological versatility, and the ability to explore diverse habitat types such as forests, open formations, and cities. The methodology tested here was the separation of ISSR fragments using primers 844 (CT8RC) and 868 (GAA6). Polyacrylamide gel electrophoresis (PAGE) was performed at a concentration of 6%, 1 mm thick, nondenaturing, and Silver Nitrate staining. The results allowed the recognition of polymorphic fragments in the D. willistoni populations studied. The methodology was also tested to define species-specific patterns of the transposable element P in two cryptic species to D. willistoni. The results confirm the hypothesis that PAGE is effective for visualization, pattern setting for Drosophila species and populations, opening perspectives for further studies on the genetic patterns of Neotropical species.porUniversidade Federal de PernambucoPrograma de Pos Graduacao em Saude Humana e Meio AmbienteUFPEBrasilAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessDrosophilaPadrões PolimórficosEspeciação GenéticaSubgrupo willistoniEletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de DrosophilaUtilização da eletroforese em gel de poliacrilamida como mecanismo de análise dos fragmentos obtidos pelo marcador Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) em Drosophila willistoniinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesismestradoreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPEORIGINALDISSERTAÇÃO Anadeje Celerino dos Santos Silva.pdfDISSERTAÇÃO Anadeje Celerino dos Santos Silva.pdfapplication/pdf1395256https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Anadeje%20Celerino%20dos%20Santos%20Silva.pdf2594319b329951788c4a952b33c1c7b2MD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/2/license_rdfe39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82310https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/3/license.txtbd573a5ca8288eb7272482765f819534MD53TEXTDISSERTAÇÃO Anadeje Celerino dos Santos Silva.pdf.txtDISSERTAÇÃO Anadeje Celerino dos Santos Silva.pdf.txtExtracted texttext/plain80933https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/4/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Anadeje%20Celerino%20dos%20Santos%20Silva.pdf.txtb65bcf6d189fe5766a31b6a897aaff7fMD54THUMBNAILDISSERTAÇÃO Anadeje Celerino dos Santos Silva.pdf.jpgDISSERTAÇÃO Anadeje Celerino dos Santos Silva.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1317https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/5/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Anadeje%20Celerino%20dos%20Santos%20Silva.pdf.jpg5c4e0095e27c8b8324b537d960ca69a9MD55123456789/380732020-09-24 02:14:55.263oai:repositorio.ufpe.br:123456789/38073TGljZW7Dp2EgZGUgRGlzdHJpYnVpw6fDo28gTsOjbyBFeGNsdXNpdmEKClRvZG8gZGVwb3NpdGFudGUgZGUgbWF0ZXJpYWwgbm8gUmVwb3NpdMOzcmlvIEluc3RpdHVjaW9uYWwgKFJJKSBkZXZlIGNvbmNlZGVyLCDDoCBVbml2ZXJzaWRhZGUgRmVkZXJhbCBkZSBQZXJuYW1idWNvIChVRlBFKSwgdW1hIExpY2Vuw6dhIGRlIERpc3RyaWJ1acOnw6NvIE7Do28gRXhjbHVzaXZhIHBhcmEgbWFudGVyIGUgdG9ybmFyIGFjZXNzw612ZWlzIG9zIHNldXMgZG9jdW1lbnRvcywgZW0gZm9ybWF0byBkaWdpdGFsLCBuZXN0ZSByZXBvc2l0w7NyaW8uCgpDb20gYSBjb25jZXNzw6NvIGRlc3RhIGxpY2Vuw6dhIG7Do28gZXhjbHVzaXZhLCBvIGRlcG9zaXRhbnRlIG1hbnTDqW0gdG9kb3Mgb3MgZGlyZWl0b3MgZGUgYXV0b3IuCl9fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fX19fXwoKTGljZW7Dp2EgZGUgRGlzdHJpYnVpw6fDo28gTsOjbyBFeGNsdXNpdmEKCkFvIGNvbmNvcmRhciBjb20gZXN0YSBsaWNlbsOnYSBlIGFjZWl0w6EtbGEsIHZvY8OqIChhdXRvciBvdSBkZXRlbnRvciBkb3MgZGlyZWl0b3MgYXV0b3JhaXMpOgoKYSkgRGVjbGFyYSBxdWUgY29uaGVjZSBhIHBvbMOtdGljYSBkZSBjb3B5cmlnaHQgZGEgZWRpdG9yYSBkbyBzZXUgZG9jdW1lbnRvOwpiKSBEZWNsYXJhIHF1ZSBjb25oZWNlIGUgYWNlaXRhIGFzIERpcmV0cml6ZXMgcGFyYSBvIFJlcG9zaXTDs3JpbyBJbnN0aXR1Y2lvbmFsIGRhIFVGUEU7CmMpIENvbmNlZGUgw6AgVUZQRSBvIGRpcmVpdG8gbsOjbyBleGNsdXNpdm8gZGUgYXJxdWl2YXIsIHJlcHJvZHV6aXIsIGNvbnZlcnRlciAoY29tbyBkZWZpbmlkbyBhIHNlZ3VpciksIGNvbXVuaWNhciBlL291IGRpc3RyaWJ1aXIsIG5vIFJJLCBvIGRvY3VtZW50byBlbnRyZWd1ZSAoaW5jbHVpbmRvIG8gcmVzdW1vL2Fic3RyYWN0KSBlbSBmb3JtYXRvIGRpZ2l0YWwgb3UgcG9yIG91dHJvIG1laW87CmQpIERlY2xhcmEgcXVlIGF1dG9yaXphIGEgVUZQRSBhIGFycXVpdmFyIG1haXMgZGUgdW1hIGPDs3BpYSBkZXN0ZSBkb2N1bWVudG8gZSBjb252ZXJ0w6otbG8sIHNlbSBhbHRlcmFyIG8gc2V1IGNvbnRlw7pkbywgcGFyYSBxdWFscXVlciBmb3JtYXRvIGRlIGZpY2hlaXJvLCBtZWlvIG91IHN1cG9ydGUsIHBhcmEgZWZlaXRvcyBkZSBzZWd1cmFuw6dhLCBwcmVzZXJ2YcOnw6NvIChiYWNrdXApIGUgYWNlc3NvOwplKSBEZWNsYXJhIHF1ZSBvIGRvY3VtZW50byBzdWJtZXRpZG8gw6kgbyBzZXUgdHJhYmFsaG8gb3JpZ2luYWwgZSBxdWUgZGV0w6ltIG8gZGlyZWl0byBkZSBjb25jZWRlciBhIHRlcmNlaXJvcyBvcyBkaXJlaXRvcyBjb250aWRvcyBuZXN0YSBsaWNlbsOnYS4gRGVjbGFyYSB0YW1iw6ltIHF1ZSBhIGVudHJlZ2EgZG8gZG9jdW1lbnRvIG7Do28gaW5mcmluZ2Ugb3MgZGlyZWl0b3MgZGUgb3V0cmEgcGVzc29hIG91IGVudGlkYWRlOwpmKSBEZWNsYXJhIHF1ZSwgbm8gY2FzbyBkbyBkb2N1bWVudG8gc3VibWV0aWRvIGNvbnRlciBtYXRlcmlhbCBkbyBxdWFsIG7Do28gZGV0w6ltIG9zIGRpcmVpdG9zIGRlCmF1dG9yLCBvYnRldmUgYSBhdXRvcml6YcOnw6NvIGlycmVzdHJpdGEgZG8gcmVzcGVjdGl2byBkZXRlbnRvciBkZXNzZXMgZGlyZWl0b3MgcGFyYSBjZWRlciDDoApVRlBFIG9zIGRpcmVpdG9zIHJlcXVlcmlkb3MgcG9yIGVzdGEgTGljZW7Dp2EgZSBhdXRvcml6YXIgYSB1bml2ZXJzaWRhZGUgYSB1dGlsaXrDoS1sb3MgbGVnYWxtZW50ZS4gRGVjbGFyYSB0YW1iw6ltIHF1ZSBlc3NlIG1hdGVyaWFsIGN1am9zIGRpcmVpdG9zIHPDo28gZGUgdGVyY2Vpcm9zIGVzdMOhIGNsYXJhbWVudGUgaWRlbnRpZmljYWRvIGUgcmVjb25oZWNpZG8gbm8gdGV4dG8gb3UgY29udGXDumRvIGRvIGRvY3VtZW50byBlbnRyZWd1ZTsKZykgU2UgbyBkb2N1bWVudG8gZW50cmVndWUgw6kgYmFzZWFkbyBlbSB0cmFiYWxobyBmaW5hbmNpYWRvIG91IGFwb2lhZG8gcG9yIG91dHJhIGluc3RpdHVpw6fDo28gcXVlIG7Do28gYSBVRlBFLCBkZWNsYXJhIHF1ZSBjdW1wcml1IHF1YWlzcXVlciBvYnJpZ2HDp8O1ZXMgZXhpZ2lkYXMgcGVsbyByZXNwZWN0aXZvIGNvbnRyYXRvIG91IGFjb3Jkby4KCkEgVUZQRSBpZGVudGlmaWNhcsOhIGNsYXJhbWVudGUgbyhzKSBub21lKHMpIGRvKHMpIGF1dG9yIChlcykgZG9zIGRpcmVpdG9zIGRvIGRvY3VtZW50byBlbnRyZWd1ZSBlIG7Do28gZmFyw6EgcXVhbHF1ZXIgYWx0ZXJhw6fDo28sIHBhcmEgYWzDqW0gZG8gcHJldmlzdG8gbmEgYWzDrW5lYSBjKS4KRepositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212020-09-24T05:14:55Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv Utilização da eletroforese em gel de poliacrilamida como mecanismo de análise dos fragmentos obtidos pelo marcador Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) em Drosophila willistoni
title Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila
spellingShingle Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila
SILVA, Anadeje Celerino dos Santos
Drosophila
Padrões Polimórficos
Especiação Genética
Subgrupo willistoni
title_short Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila
title_full Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila
title_fullStr Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila
title_full_unstemmed Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila
title_sort Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila
author SILVA, Anadeje Celerino dos Santos
author_facet SILVA, Anadeje Celerino dos Santos
author_role author
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/4737468964817426
dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv http://lattes.cnpq.br/6223762316743262
dc.contributor.author.fl_str_mv SILVA, Anadeje Celerino dos Santos
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv ROHDE, Cláudia
contributor_str_mv ROHDE, Cláudia
dc.subject.por.fl_str_mv Drosophila
Padrões Polimórficos
Especiação Genética
Subgrupo willistoni
topic Drosophila
Padrões Polimórficos
Especiação Genética
Subgrupo willistoni
description A eletroforese em gel de poliacrilamida representa uma técnica valiosa para separação e caracterização dos fragmentos de DNA. Esta metodologia pode ser aplicada após a reação em cadeia da polimerase (PCR) para caracterizar marcadores genéticos, como Inter Simple Sequence Repeats (ISSR). O principal objetivo neste trabalho foi implementar a metodologia para melhorar a definição dos padrões e da variabilidade dentro e entre populações brasileiras de Drosophila willistoni. Pertencente ao gênero Drosophila Fallen 1823, D. willistoni é a espécie de drosofilídeo que possui a maior distribuição geográfica, versatilidade ecológica, e capacidade de explorar diversos tipos de habitats, tais como matas, formações abertas e cidades. A metodologia aqui testada consistiu-se na separação de fragmentos ISSR com o uso dos primers 844 (CT8RC) e 868 (GAA6). A eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE) foi feita na concentração de 6%, com 1 mm de espessura, não desnaturante, e com revelação em Nitrato de Prata. Os resultados permitiram o reconhecimento de fragmentos polimórficos nas populações de D. willistoni estudadas. A metodologia foi também testada para definição de padrões espécie-específicos do elemento transponível P em duas espécies crípticas a D. willistoni. Os resultados confirmam a hipótese de que a PAGE é eficaz para visualização, definição de padrões para espécies e de populações de Drosophila, abrindo perspectivas para mais estudos acerca dos padrões genéticos de espécies neotropicais.
publishDate 2019
dc.date.issued.fl_str_mv 2019-09-16
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2020-09-23T21:02:34Z
dc.date.available.fl_str_mv 2020-09-23T21:02:34Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.citation.fl_str_mv SILVA, Anadeje Celerino dos Santos. Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila. 2019. Dissertação (Mestrado em Saúde Humana e Meio Ambiente) – Universidade Federal de Pernambuco, Vitória de Santo Antão, 2019.
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/38073
dc.identifier.dark.fl_str_mv ark:/64986/001300000gx7s
identifier_str_mv SILVA, Anadeje Celerino dos Santos. Eletroforese em gel de poliacrilamida como uma ferramenta importante na análise da diversidade genética do subrupo willistoni de Drosophila. 2019. Dissertação (Mestrado em Saúde Humana e Meio Ambiente) – Universidade Federal de Pernambuco, Vitória de Santo Antão, 2019.
ark:/64986/001300000gx7s
url https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/38073
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pernambuco
dc.publisher.program.fl_str_mv Programa de Pos Graduacao em Saude Humana e Meio Ambiente
dc.publisher.initials.fl_str_mv UFPE
dc.publisher.country.fl_str_mv Brasil
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pernambuco
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPE
instname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
instacron:UFPE
instname_str Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
instacron_str UFPE
institution UFPE
reponame_str Repositório Institucional da UFPE
collection Repositório Institucional da UFPE
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Anadeje%20Celerino%20dos%20Santos%20Silva.pdf
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/2/license_rdf
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/3/license.txt
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/4/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Anadeje%20Celerino%20dos%20Santos%20Silva.pdf.txt
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/38073/5/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Anadeje%20Celerino%20dos%20Santos%20Silva.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 2594319b329951788c4a952b33c1c7b2
e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34
bd573a5ca8288eb7272482765f819534
b65bcf6d189fe5766a31b6a897aaff7f
5c4e0095e27c8b8324b537d960ca69a9
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
repository.mail.fl_str_mv attena@ufpe.br
_version_ 1815172822511648768