Análises fisiológicas e avaliações moleculares em cana-de-açúcar em resposta ao déficit hídrico

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: ALMEIDA, Clébia Maria Alves de
Data de Publicação: 2012
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPE
Texto Completo: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/12622
Resumo: A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) tem considerável importância para a economia do Brasil, sobretudo para a região Nordeste. Dos fatores ambientais que limitam a produtividade dessa cultura, o déficit hídrico é considerado um dos mais importantes. A descoberta de proteínas que respondem ao déficit hídrico pode ser importante para os programas de melhoramento genético da cana-de-açúcar, uma vez que estas proteínas podem aumentar a tolerância a esse tipo de estresse. Dessa forma, o objetivo geral deste projeto foi comparar as variedades RB 72910, RB 931011 e RB 867515 submetidas a estresse hídrico utilizando uma abordagem proteômica. Inicialmente a variedade, não comercial, RB 72910 foi utilizada na construção de uma biblioteca de cDNA por meio da técnica de hibridização subtrativa por supressão (SSH) com o objetivo de isolar genes de defesa relacionados a estresses abiótico. Dos 122 clones obtidos, 40 clones mostraram similaridade com sequências depositadas em bancos de dados, 37 genes envolvidos em mecanismos de defesa, 24 foram similares a proteínas com função desconhecida e 21 clones foram associados ao desenvolvimento e manutenção celular. O gene que codifica para trealose-6-fosfato sintase, envolvido na resposta à seca, teve sua expressão confirmada por PCR quantitativo na variedade RB 72910. O padrão de expressão de proteínas foi avaliado por eletroforese bidimensional (2-DE). As plantas de cana foram submetidas à restrição de água durante 30 dias até atingir condições de déficit hídrico severo (20% de umidade gravitacional do solo). Sete proteínas tiveram sua expressão aumentada nas plantas tratadas em relação ao tratamento controle, enquanto três foram diminuídas Para comparar o perfil de expressão de proteínas das três variedades, foram utilizadas as técnicas 2-DE e espectrometria de massas (MALDI-TOF-MS/MS). Vinte plantas de cada variedade foram cultivadas em vasos (30 L) em casa de vegetação por três meses, sendo submetidas ao déficit hídrico por supressão da irrigação durante o terceiro mês. As análises revelaram mudanças significativas na intensidade de 53 spots de proteínas, as quais tiveram suas expressões aumentadas ou diminuídas em resposta à seca. Para a variedade RB 72910 foram seqüenciadas 4 proteínas que apresentaram aumento de expressão nas plantas submetidas ao déficit hídrico: ubiqitina, ácido indol-3- acético 34, NADH plastoquinona oxidoredutase e trealose-6-fosfato sintase. Para a variedade RB 931011 foram seqüenciadas 5 proteínas: aceto lactato sintase, fatores responsivos ao etileno e trealose-6-fosfato sintase. Para a RB 867515 foram seqüenciadas 6 proteínas: proteína do fotossistema I ycf4, proteínas de senescência foliar, citocinina oxidase, NADH dehidrogenase subunidade F, metionina amino peptidase e proteína de transporte ATPase Ca2+. Em plantas, o acúmulo de trealose está relacionado com a tolerância à seca. Sendo assim a trealose-6-fosfato sintase constitui uma possível candidata para a transformação genética para obtenção de plantas mais tolerantes ao déficit hídrico ou para a sua utilização como biomarcador em cana-de-açúcar.
id UFPE_b1a98c33ccfbb59c0f661a85c92caadd
oai_identifier_str oai:repositorio.ufpe.br:123456789/12622
network_acronym_str UFPE
network_name_str Repositório Institucional da UFPE
repository_id_str 2221
spelling ALMEIDA, Clébia Maria Alves deCORREIA, Maria Tereza dos SantosSILVA, Márcia Vanusa da2015-03-13T19:03:26Z2015-03-13T19:03:26Z2012-02-14https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/12622A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) tem considerável importância para a economia do Brasil, sobretudo para a região Nordeste. Dos fatores ambientais que limitam a produtividade dessa cultura, o déficit hídrico é considerado um dos mais importantes. A descoberta de proteínas que respondem ao déficit hídrico pode ser importante para os programas de melhoramento genético da cana-de-açúcar, uma vez que estas proteínas podem aumentar a tolerância a esse tipo de estresse. Dessa forma, o objetivo geral deste projeto foi comparar as variedades RB 72910, RB 931011 e RB 867515 submetidas a estresse hídrico utilizando uma abordagem proteômica. Inicialmente a variedade, não comercial, RB 72910 foi utilizada na construção de uma biblioteca de cDNA por meio da técnica de hibridização subtrativa por supressão (SSH) com o objetivo de isolar genes de defesa relacionados a estresses abiótico. Dos 122 clones obtidos, 40 clones mostraram similaridade com sequências depositadas em bancos de dados, 37 genes envolvidos em mecanismos de defesa, 24 foram similares a proteínas com função desconhecida e 21 clones foram associados ao desenvolvimento e manutenção celular. O gene que codifica para trealose-6-fosfato sintase, envolvido na resposta à seca, teve sua expressão confirmada por PCR quantitativo na variedade RB 72910. O padrão de expressão de proteínas foi avaliado por eletroforese bidimensional (2-DE). As plantas de cana foram submetidas à restrição de água durante 30 dias até atingir condições de déficit hídrico severo (20% de umidade gravitacional do solo). Sete proteínas tiveram sua expressão aumentada nas plantas tratadas em relação ao tratamento controle, enquanto três foram diminuídas Para comparar o perfil de expressão de proteínas das três variedades, foram utilizadas as técnicas 2-DE e espectrometria de massas (MALDI-TOF-MS/MS). Vinte plantas de cada variedade foram cultivadas em vasos (30 L) em casa de vegetação por três meses, sendo submetidas ao déficit hídrico por supressão da irrigação durante o terceiro mês. As análises revelaram mudanças significativas na intensidade de 53 spots de proteínas, as quais tiveram suas expressões aumentadas ou diminuídas em resposta à seca. Para a variedade RB 72910 foram seqüenciadas 4 proteínas que apresentaram aumento de expressão nas plantas submetidas ao déficit hídrico: ubiqitina, ácido indol-3- acético 34, NADH plastoquinona oxidoredutase e trealose-6-fosfato sintase. Para a variedade RB 931011 foram seqüenciadas 5 proteínas: aceto lactato sintase, fatores responsivos ao etileno e trealose-6-fosfato sintase. Para a RB 867515 foram seqüenciadas 6 proteínas: proteína do fotossistema I ycf4, proteínas de senescência foliar, citocinina oxidase, NADH dehidrogenase subunidade F, metionina amino peptidase e proteína de transporte ATPase Ca2+. Em plantas, o acúmulo de trealose está relacionado com a tolerância à seca. Sendo assim a trealose-6-fosfato sintase constitui uma possível candidata para a transformação genética para obtenção de plantas mais tolerantes ao déficit hídrico ou para a sua utilização como biomarcador em cana-de-açúcar.FACEPE; EMBRAPAporUniversidade Federal de PernambucoAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessSaccharum officinarumestresse hídricoeletroforese bidimensionalAnálises fisiológicas e avaliações moleculares em cana-de-açúcar em resposta ao déficit hídricoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPETHUMBNAILclebia almeida_tese.pdf.jpgclebia almeida_tese.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1272https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/12622/5/clebia%20almeida_tese.pdf.jpgdc6d4c2a8bf58c1716e556602544ccefMD55ORIGINALclebia almeida_tese.pdfclebia almeida_tese.pdfapplication/pdf1062339https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/12622/1/clebia%20almeida_tese.pdf83d2e479419c76959eec81539c16d8edMD51CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-81232https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/12622/2/license_rdf66e71c371cc565284e70f40736c94386MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82311https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/12622/3/license.txt4b8a02c7f2818eaf00dcf2260dd5eb08MD53TEXTclebia almeida_tese.pdf.txtclebia almeida_tese.pdf.txtExtracted texttext/plain142303https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/12622/4/clebia%20almeida_tese.pdf.txt698b8fab2b926e14f6b8e06801565d5eMD54123456789/126222019-10-25 05:27:27.555oai:repositorio.ufpe.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212019-10-25T08:27:27Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Análises fisiológicas e avaliações moleculares em cana-de-açúcar em resposta ao déficit hídrico
title Análises fisiológicas e avaliações moleculares em cana-de-açúcar em resposta ao déficit hídrico
spellingShingle Análises fisiológicas e avaliações moleculares em cana-de-açúcar em resposta ao déficit hídrico
ALMEIDA, Clébia Maria Alves de
Saccharum officinarum
estresse hídrico
eletroforese bidimensional
title_short Análises fisiológicas e avaliações moleculares em cana-de-açúcar em resposta ao déficit hídrico
title_full Análises fisiológicas e avaliações moleculares em cana-de-açúcar em resposta ao déficit hídrico
title_fullStr Análises fisiológicas e avaliações moleculares em cana-de-açúcar em resposta ao déficit hídrico
title_full_unstemmed Análises fisiológicas e avaliações moleculares em cana-de-açúcar em resposta ao déficit hídrico
title_sort Análises fisiológicas e avaliações moleculares em cana-de-açúcar em resposta ao déficit hídrico
author ALMEIDA, Clébia Maria Alves de
author_facet ALMEIDA, Clébia Maria Alves de
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv ALMEIDA, Clébia Maria Alves de
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv CORREIA, Maria Tereza dos Santos
dc.contributor.advisor-co1.fl_str_mv SILVA, Márcia Vanusa da
contributor_str_mv CORREIA, Maria Tereza dos Santos
SILVA, Márcia Vanusa da
dc.subject.por.fl_str_mv Saccharum officinarum
estresse hídrico
eletroforese bidimensional
topic Saccharum officinarum
estresse hídrico
eletroforese bidimensional
description A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) tem considerável importância para a economia do Brasil, sobretudo para a região Nordeste. Dos fatores ambientais que limitam a produtividade dessa cultura, o déficit hídrico é considerado um dos mais importantes. A descoberta de proteínas que respondem ao déficit hídrico pode ser importante para os programas de melhoramento genético da cana-de-açúcar, uma vez que estas proteínas podem aumentar a tolerância a esse tipo de estresse. Dessa forma, o objetivo geral deste projeto foi comparar as variedades RB 72910, RB 931011 e RB 867515 submetidas a estresse hídrico utilizando uma abordagem proteômica. Inicialmente a variedade, não comercial, RB 72910 foi utilizada na construção de uma biblioteca de cDNA por meio da técnica de hibridização subtrativa por supressão (SSH) com o objetivo de isolar genes de defesa relacionados a estresses abiótico. Dos 122 clones obtidos, 40 clones mostraram similaridade com sequências depositadas em bancos de dados, 37 genes envolvidos em mecanismos de defesa, 24 foram similares a proteínas com função desconhecida e 21 clones foram associados ao desenvolvimento e manutenção celular. O gene que codifica para trealose-6-fosfato sintase, envolvido na resposta à seca, teve sua expressão confirmada por PCR quantitativo na variedade RB 72910. O padrão de expressão de proteínas foi avaliado por eletroforese bidimensional (2-DE). As plantas de cana foram submetidas à restrição de água durante 30 dias até atingir condições de déficit hídrico severo (20% de umidade gravitacional do solo). Sete proteínas tiveram sua expressão aumentada nas plantas tratadas em relação ao tratamento controle, enquanto três foram diminuídas Para comparar o perfil de expressão de proteínas das três variedades, foram utilizadas as técnicas 2-DE e espectrometria de massas (MALDI-TOF-MS/MS). Vinte plantas de cada variedade foram cultivadas em vasos (30 L) em casa de vegetação por três meses, sendo submetidas ao déficit hídrico por supressão da irrigação durante o terceiro mês. As análises revelaram mudanças significativas na intensidade de 53 spots de proteínas, as quais tiveram suas expressões aumentadas ou diminuídas em resposta à seca. Para a variedade RB 72910 foram seqüenciadas 4 proteínas que apresentaram aumento de expressão nas plantas submetidas ao déficit hídrico: ubiqitina, ácido indol-3- acético 34, NADH plastoquinona oxidoredutase e trealose-6-fosfato sintase. Para a variedade RB 931011 foram seqüenciadas 5 proteínas: aceto lactato sintase, fatores responsivos ao etileno e trealose-6-fosfato sintase. Para a RB 867515 foram seqüenciadas 6 proteínas: proteína do fotossistema I ycf4, proteínas de senescência foliar, citocinina oxidase, NADH dehidrogenase subunidade F, metionina amino peptidase e proteína de transporte ATPase Ca2+. Em plantas, o acúmulo de trealose está relacionado com a tolerância à seca. Sendo assim a trealose-6-fosfato sintase constitui uma possível candidata para a transformação genética para obtenção de plantas mais tolerantes ao déficit hídrico ou para a sua utilização como biomarcador em cana-de-açúcar.
publishDate 2012
dc.date.issued.fl_str_mv 2012-02-14
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-03-13T19:03:26Z
dc.date.available.fl_str_mv 2015-03-13T19:03:26Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/12622
url https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/12622
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil
http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/
eu_rights_str_mv openAccess
dc.publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pernambuco
publisher.none.fl_str_mv Universidade Federal de Pernambuco
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPE
instname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
instacron:UFPE
instname_str Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
instacron_str UFPE
institution UFPE
reponame_str Repositório Institucional da UFPE
collection Repositório Institucional da UFPE
bitstream.url.fl_str_mv https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/12622/5/clebia%20almeida_tese.pdf.jpg
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/12622/1/clebia%20almeida_tese.pdf
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/12622/2/license_rdf
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/12622/3/license.txt
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/12622/4/clebia%20almeida_tese.pdf.txt
bitstream.checksum.fl_str_mv dc6d4c2a8bf58c1716e556602544ccef
83d2e479419c76959eec81539c16d8ed
66e71c371cc565284e70f40736c94386
4b8a02c7f2818eaf00dcf2260dd5eb08
698b8fab2b926e14f6b8e06801565d5e
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)
repository.mail.fl_str_mv attena@ufpe.br
_version_ 1802310613629665280