Avaliação molecular da variabilidade genética do banco ativo de germoplasma de melancia do Nordeste brasileiro

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Luciene da Silva, Maria
Data de Publicação: 2010
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPE
Texto Completo: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/6172
Resumo: Com o objetivo de estudar a variabilidade genética entre os acessos de melancia do Banco Ativo de Germoplasma de Cucurbitáceas para o Nordeste Brasileiro (Petrolina PE, Brasil), um levantamento no acervo resultou na localização de 753 acessos (agricultura tradicional, espécies do centro de origem e variedades comerciais) e 300 linhagens (produtos do melhoramento) com dados de passaporte. Destes, 291 foram avaliados quanto à variabilidade genética, com 16 primers DAF e 11 primers ISSR, incluindo dois acessos de melão (Cucumis melo) como grupo externo. Os dados foram analisados no programa NTSYS para a estimativa do coeficiente de similaridade de Jaccard e na obtenção dos dendrogramas pelo método UPGMA. As análises dos dados dos marcadores DAF e ISSR revelaram altos índices de polimorfismo (65,3% e 76,9%, respectivamente). Os marcadores DAF foram pouco informativos na separação dos acessos em grupos, não correspondendo com a taxonomia do gênero Cucumis e Citrullus, porém indicam que há variabilidade expressiva entre os acessos coletados na agricultura tradicional do Nordeste brasileiro, inclusive, mostrando divergência entre os grupos de linhagens analisadas. Os marcadores ISSR revelaram boa precisão na separação das diferentes espécies, sendo determinantes na identificação de polimorfismo e agrupamento dos acessos e linhagens de melancia. Constatou-se grande porcentagem de variação dentro dos quatro conjuntos de germoplasma do banco (76,7%), inclusive identificando que os produtos do melhoramento apresentaram 87,4% de variação dentro dos três grupos de linhagens. Esses resultados indicam que o banco agrega germoplasma muito promissor para dar suporte a programas de melhoramento de melancia no Nordeste Brasileiro. Espacialmente, a maior porcentagem de variação foi encontrada nos acessos coletados dentro de cada Estado (86,1%) e de municípios (76,2%) ou grupos de municípios próximos (73,1%) indicando que há necessidade imperiosa de continuar o resgate de germoplasma de melancia da agricultura tradicional nos Estados e municípios ou grupos de municípios não contemplados nesta pesquisa
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Os dados foram analisados no programa NTSYS para a estimativa do coeficiente de similaridade de Jaccard e na obtenção dos dendrogramas pelo método UPGMA. As análises dos dados dos marcadores DAF e ISSR revelaram altos índices de polimorfismo (65,3% e 76,9%, respectivamente). Os marcadores DAF foram pouco informativos na separação dos acessos em grupos, não correspondendo com a taxonomia do gênero Cucumis e Citrullus, porém indicam que há variabilidade expressiva entre os acessos coletados na agricultura tradicional do Nordeste brasileiro, inclusive, mostrando divergência entre os grupos de linhagens analisadas. Os marcadores ISSR revelaram boa precisão na separação das diferentes espécies, sendo determinantes na identificação de polimorfismo e agrupamento dos acessos e linhagens de melancia. Constatou-se grande porcentagem de variação dentro dos quatro conjuntos de germoplasma do banco (76,7%), inclusive identificando que os produtos do melhoramento apresentaram 87,4% de variação dentro dos três grupos de linhagens. Esses resultados indicam que o banco agrega germoplasma muito promissor para dar suporte a programas de melhoramento de melancia no Nordeste Brasileiro. Espacialmente, a maior porcentagem de variação foi encontrada nos acessos coletados dentro de cada Estado (86,1%) e de municípios (76,2%) ou grupos de municípios próximos (73,1%) indicando que há necessidade imperiosa de continuar o resgate de germoplasma de melancia da agricultura tradicional nos Estados e municípios ou grupos de municípios não contemplados nesta pesquisaCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorporUniversidade Federal de PernambucoAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessBanco de germoplasmaCitrullusDivergência genéticaMarcadores DAFISSRAvaliação molecular da variabilidade genética do banco ativo de germoplasma de melancia do Nordeste brasileiroinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPEORIGINALarquivo893_1.pdfapplication/pdf4194750https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/6172/1/arquivo893_1.pdfdb25c32a6384a62bbed9cd11a9087dcbMD51LICENSElicense.txttext/plain1748https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/6172/2/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD52TEXTarquivo893_1.pdf.txtarquivo893_1.pdf.txtExtracted texttext/plain309049https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/6172/3/arquivo893_1.pdf.txt3675af83cfc162a3ffdd893d0be1be0fMD53THUMBNAILarquivo893_1.pdf.jpgarquivo893_1.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1560https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/6172/4/arquivo893_1.pdf.jpg634f6afaafcb4c792e50e228849b0248MD54123456789/61722019-10-25 02:19:51.567oai:repositorio.ufpe.br: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Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212019-10-25T05:19:51Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false
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