Gene pelB em isolados de Colletotrichum gloeosporioides provenientes de vários hospedeiros
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Data de Publicação: | 2008 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFPE |
Texto Completo: | https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/441 |
Resumo: | Colletotrichum gloeosporioides é um importante patógeno de diversas plantas de grande importância econômica. Na fase necrotrófica de infecção por espécies de Colletotrichum as enzimas degradadoras de parede celular de plantas, como pectato liase (PL), tem um claro aumento na expressão. Um gene pelB que expressa uma PL, foi identificado em isolados de C. gloeosporioides, patógenos de abacate. Vários estudos moleculares identificaram certa especialização de isolados de C. gloeosporioides quanto ao hospedeiro, no entanto não existem estudos sobre a presença deste gene em isolados de outros hospedeiros que não o abacate, nem em outras espécies de Colletotrichum. Os objetivos deste trabalho foram analisar a variação genética, a presença do gene pelB e comparar os produtos de amplificação em isolados de diferentes hospedeiros de C. gloeosporioides. O uso do iniciador espécie-específico CgInt confirmou a identidade dos isolados de C. gloeosporioides oriundos da Micoteca- URM. A detecção da variabilidade genética foi realizada utilizando iniciadores (GTG)5, (GACA)4 e M13, e a partir dos dados obtidos foi gerado dendrograma pelo método de agrupamento UPGMA. Os iniciadores para o gene pelB foram desenhados a partir de seqüências selecionadas do GenBank utilizando programa Primer 3, selecionados para temperatura de anelamento de 60° C e produtos de amplificação de tamanho aproximado de 600 pb. Os iniciadores de ISSR mostraram-se eficientes em demonstrar a variabilidade genética dos isolados de Colletotrichum e de discriminar as espécies C. gloeosporioides, C. acutatum e C. sublineolum. O gene pelB está presente nas espécies C. acutatum e C. sublineolum, além de C. gloeosporioides. A restrição dos fragmentos amplificados deste gene com a enzima MspI não evidenciou diferenças na estrutura do gene pelB entre os isolados de diferentes hospedeiros de C. gloeosporioides e C. acutatum e C. sublineolum |
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Vieira de Medeiros, LílianTinti de Oliveira, Neiva 2014-06-12T15:02:45Z2014-06-12T15:02:45Z2008-01-31Vieira de Medeiros, Lílian; Tinti de Oliveira, Neiva. Gene pelB em isolados de Colletotrichum gloeosporioides provenientes de vários hospedeiros. 2008. Dissertação (Mestrado). Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2008.https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/441Colletotrichum gloeosporioides é um importante patógeno de diversas plantas de grande importância econômica. Na fase necrotrófica de infecção por espécies de Colletotrichum as enzimas degradadoras de parede celular de plantas, como pectato liase (PL), tem um claro aumento na expressão. Um gene pelB que expressa uma PL, foi identificado em isolados de C. gloeosporioides, patógenos de abacate. Vários estudos moleculares identificaram certa especialização de isolados de C. gloeosporioides quanto ao hospedeiro, no entanto não existem estudos sobre a presença deste gene em isolados de outros hospedeiros que não o abacate, nem em outras espécies de Colletotrichum. Os objetivos deste trabalho foram analisar a variação genética, a presença do gene pelB e comparar os produtos de amplificação em isolados de diferentes hospedeiros de C. gloeosporioides. O uso do iniciador espécie-específico CgInt confirmou a identidade dos isolados de C. gloeosporioides oriundos da Micoteca- URM. A detecção da variabilidade genética foi realizada utilizando iniciadores (GTG)5, (GACA)4 e M13, e a partir dos dados obtidos foi gerado dendrograma pelo método de agrupamento UPGMA. 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A restrição dos fragmentos amplificados deste gene com a enzima MspI não evidenciou diferenças na estrutura do gene pelB entre os isolados de diferentes hospedeiros de C. gloeosporioides e C. acutatum e C. sublineolumConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoporUniversidade Federal de PernambucoAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessColletotrichumCgInt/ITS4ISSRgene pelBpectato liaseGene pelB em isolados de Colletotrichum gloeosporioides provenientes de vários hospedeirosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPETHUMBNAILLVM.pdf.jpgLVM.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1172https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/441/4/LVM.pdf.jpgca101709442641f0a7db5a51d4a3ffe1MD54LICENSElicense.txttext/plain1748https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/441/1/license.txt8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33MD51ORIGINALLVM.pdfLVM.pdfapplication/pdf2595886https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/441/2/LVM.pdf0146656b9ac6b14b6cefa8f851a9a3a6MD52TEXTLVM.pdf.txtLVM.pdf.txtExtracted texttext/plain150340https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/441/3/LVM.pdf.txtbf2c797ed9220ebb10dcd80911783cc3MD53123456789/4412019-10-25 20:04:37.708oai:repositorio.ufpe.br:123456789/441Tk9URTogUExBQ0UgWU9VUiBPV04gTElDRU5TRSBIRVJFClRoaXMgc2FtcGxlIGxpY2Vuc2UgaXMgcHJvdmlkZWQgZm9yIGluZm9ybWF0aW9uYWwgcHVycG9zZXMgb25seS4KCk5PTi1FWENMVVNJVkUgRElTVFJJQlVUSU9OIExJQ0VOU0UKCkJ5IHNpZ25pbmcgYW5kIHN1Ym1pdHRpbmcgdGhpcyBsaWNlbnNlLCB5b3UgKHRoZSBhdXRob3Iocykgb3IgY29weXJpZ2h0Cm93bmVyKSBncmFudHMgdG8gRFNwYWNlIFVuaXZlcnNpdHkgKERTVSkgdGhlIG5vbi1leGNsdXNpdmUgcmlnaHQgdG8gcmVwcm9kdWNlLAp0cmFuc2xhdGUgKGFzIGRlZmluZWQgYmVsb3cpLCBhbmQvb3IgZGlzdHJpYnV0ZSB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gKGluY2x1ZGluZwp0aGUgYWJzdHJhY3QpIHdvcmxkd2lkZSBpbiBwcmludCBhbmQgZWxlY3Ryb25pYyBmb3JtYXQgYW5kIGluIGFueSBtZWRpdW0sCmluY2x1ZGluZyBidXQgbm90IGxpbWl0ZWQgdG8gYXVkaW8gb3IgdmlkZW8uCgpZb3UgYWdyZWUgdGhhdCBEU1UgbWF5LCB3aXRob3V0IGNoYW5naW5nIHRoZSBjb250ZW50LCB0cmFuc2xhdGUgdGhlCnN1Ym1pc3Npb24gdG8gYW55IG1lZGl1bSBvciBmb3JtYXQgZm9yIHRoZSBwdXJwb3NlIG9mIHByZXNlcnZhdGlvbi4KCllvdSBhbHNvIGFncmVlIHRoYXQgRFNVIG1heSBrZWVwIG1vcmUgdGhhbiBvbmUgY29weSBvZiB0aGlzIHN1Ym1pc3Npb24gZm9yCnB1cnBvc2VzIG9mIHNlY3VyaXR5LCBiYWNrLXVwIGFuZCBwcmVzZXJ2YXRpb24uCgpZb3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgdGhlIHN1Ym1pc3Npb24gaXMgeW91ciBvcmlnaW5hbCB3b3JrLCBhbmQgdGhhdCB5b3UgaGF2ZQp0aGUgcmlnaHQgdG8gZ3JhbnQgdGhlIHJpZ2h0cyBjb250YWluZWQgaW4gdGhpcyBsaWNlbnNlLiBZb3UgYWxzbyByZXByZXNlbnQKdGhhdCB5b3VyIHN1Ym1pc3Npb24gZG9lcyBub3QsIHRvIHRoZSBiZXN0IG9mIHlvdXIga25vd2xlZGdlLCBpbmZyaW5nZSB1cG9uCmFueW9uZSdzIGNvcHlyaWdodC4KCklmIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uIGNvbnRhaW5zIG1hdGVyaWFsIGZvciB3aGljaCB5b3UgZG8gbm90IGhvbGQgY29weXJpZ2h0LAp5b3UgcmVwcmVzZW50IHRoYXQgeW91IGhhdmUgb2J0YWluZWQgdGhlIHVucmVzdHJpY3RlZCBwZXJtaXNzaW9uIG9mIHRoZQpjb3B5cmlnaHQgb3duZXIgdG8gZ3JhbnQgRFNVIHRoZSByaWdodHMgcmVxdWlyZWQgYnkgdGhpcyBsaWNlbnNlLCBhbmQgdGhhdApzdWNoIHRoaXJkLXBhcnR5IG93bmVkIG1hdGVyaWFsIGlzIGNsZWFybHkgaWRlbnRpZmllZCBhbmQgYWNrbm93bGVkZ2VkCndpdGhpbiB0aGUgdGV4dCBvciBjb250ZW50IG9mIHRoZSBzdWJtaXNzaW9uLgoKSUYgVEhFIFNVQk1JU1NJT04gSVMgQkFTRUQgVVBPTiBXT1JLIFRIQVQgSEFTIEJFRU4gU1BPTlNPUkVEIE9SIFNVUFBPUlRFRApCWSBBTiBBR0VOQ1kgT1IgT1JHQU5JWkFUSU9OIE9USEVSIFRIQU4gRFNVLCBZT1UgUkVQUkVTRU5UIFRIQVQgWU9VIEhBVkUKRlVMRklMTEVEIEFOWSBSSUdIVCBPRiBSRVZJRVcgT1IgT1RIRVIgT0JMSUdBVElPTlMgUkVRVUlSRUQgQlkgU1VDSApDT05UUkFDVCBPUiBBR1JFRU1FTlQuCgpEU1Ugd2lsbCBjbGVhcmx5IGlkZW50aWZ5IHlvdXIgbmFtZShzKSBhcyB0aGUgYXV0aG9yKHMpIG9yIG93bmVyKHMpIG9mIHRoZQpzdWJtaXNzaW9uLCBhbmQgd2lsbCBub3QgbWFrZSBhbnkgYWx0ZXJhdGlvbiwgb3RoZXIgdGhhbiBhcyBhbGxvd2VkIGJ5IHRoaXMKbGljZW5zZSwgdG8geW91ciBzdWJtaXNzaW9uLgo=Repositório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212019-10-25T23:04:37Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false |
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