Relações filogenéticas dos gêneros Lecanora Ach. e Neoprotoparmelia Garima Singh, Lumbsch & I. Schimitt (Lecanorales, Ascomycota liquenizados)
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Data de Publicação: | 2019 |
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Resumo: | Lecanorales, considerada a maior ordem de fungos liquenizados, possui uma classificação controversa, com uma enorme variedade de caracteres morfológicos e representantes em todos os ecossistemas terrestres. Lecanoraceae e Parmeliaceae estão entre as principais famílias desta ordem, e ambas têm sido amplamente estudadas. Lecanoraceae abriga 25 gêneros, sendo Lecanora seu principal representante, com 550 espécies. Parmeliaceae foi, recentemente, subdividida em duas subfamílias: Parmelioideae e Protoparmelioideae, com o objetivo de classificar melhor os fungos liquenizados tropicais e subtropicais que estão agora no gênero Neoprotoparmelia. A pluralidade de critérios taxonômicos sempre dificultou a classificação desses grupos. Por outro lado, a combinação de caracteres morfológicos, químicos e moleculares das regiões ITS e mtSSU (rDNA) tem resolvido muitos problemas nessas classificações. No presente estudo, foi extraído o DNA genômico de amostras frescas de Lecanora e Neoprotoparmelia, amplificadas as regiões ITS e mtSSU e, posteriormente, os produtos enviados para sequenciamento. Foram obtidas 41 sequências de Lecanora e 16 de Neoprotopormelia da região ITS, e 29 da região mtSSU de Lecanora. As sequências formaram novos clados e linhagens diferentes das existentes. Os espécimes identificados como Lecanora tropica, Lecanora spec. nov. LAS128, Lecanora spec. nov. LAS129 e L. subalbellina LAS130 agruparam com clados preexistentes. Dezesseis espécies novas foram descritas, nove novos registros e três novas combinações. Dezoito metabólitos foram identificados e foram eficazes na determinação das espécies. Esses resultados demonstram a importância da combinação de vários critérios taxonômicos na identificação e classificação dos fungos liquenizados. |
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SANTOS, Lidiane Alves doshttp://lattes.cnpq.br/0802685182305749http://lattes.cnpq.br/3801791273361463CÁCERES, Marcela Eugênia da SilvaLÜCKING, Robert Karl2019-12-12T13:16:13Z2019-12-12T13:16:13Z2019-02-21SANTOS, Lidiane Alves dos. Relações filogenéticas dos gêneros Lecanora Ach. e Neoprotoparmelia Garima Singh, Lumbsch & I. Schimitt (Lecanorales, Ascomycota liquenizados). 2019. Dissertação (Mestrado em Biologia de Fungos) – Universidade Federal de Pernambuco, Recife, 2019.https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/35704ark:/64986/0013000005g23Lecanorales, considerada a maior ordem de fungos liquenizados, possui uma classificação controversa, com uma enorme variedade de caracteres morfológicos e representantes em todos os ecossistemas terrestres. Lecanoraceae e Parmeliaceae estão entre as principais famílias desta ordem, e ambas têm sido amplamente estudadas. Lecanoraceae abriga 25 gêneros, sendo Lecanora seu principal representante, com 550 espécies. Parmeliaceae foi, recentemente, subdividida em duas subfamílias: Parmelioideae e Protoparmelioideae, com o objetivo de classificar melhor os fungos liquenizados tropicais e subtropicais que estão agora no gênero Neoprotoparmelia. A pluralidade de critérios taxonômicos sempre dificultou a classificação desses grupos. Por outro lado, a combinação de caracteres morfológicos, químicos e moleculares das regiões ITS e mtSSU (rDNA) tem resolvido muitos problemas nessas classificações. No presente estudo, foi extraído o DNA genômico de amostras frescas de Lecanora e Neoprotoparmelia, amplificadas as regiões ITS e mtSSU e, posteriormente, os produtos enviados para sequenciamento. Foram obtidas 41 sequências de Lecanora e 16 de Neoprotopormelia da região ITS, e 29 da região mtSSU de Lecanora. As sequências formaram novos clados e linhagens diferentes das existentes. Os espécimes identificados como Lecanora tropica, Lecanora spec. nov. LAS128, Lecanora spec. nov. 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The plurality of taxonomic criteria has always made it difficult to classify these groups. On the other hand, the combination of morphological, chemical and molecular characters of the ITS and mtSSU (rDNA) regions has solved many problems in these classifications. In the present study, the genomic DNA was extracted from fresh samples of Lecanora and Neoprotoparmelia, amplified the ITS and mtSSU regions and, later, the products sent for sequencing. 41 Lecanora and 16 Neoprotopormelia sequences were obtained from the ITS region and 29 from the mtSSU region of Lecanora. The sequences formed new clades and lineages different from the existing ones. Specimens identified as Lecanora tropica, L. spec. nov. L S128, L. spec. nov. LAS129 and L. subalbellina LAS130 grouped with preexisting clades. Sixteen are new species, nine new records and three new combinations. Eighteen metabolites were identified and were effective in determining the speci. These results demonstrate the importance of combining several taxonomic criteria in the identification and classification of lichenized fungi.porUniversidade Federal de PernambucoPrograma de Pos Graduacao em Biologia de FungosUFPEBrasilAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/openAccessFungos liquenizadosFilogeniaMetabólitos secundáriosRelações filogenéticas dos gêneros Lecanora Ach. e Neoprotoparmelia Garima Singh, Lumbsch & I. Schimitt (Lecanorales, Ascomycota liquenizados)info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesismestradoreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPETEXTDISSERTAÇÃO Lidiane Alves dos Santos.pdf.txtDISSERTAÇÃO Lidiane Alves dos Santos.pdf.txtExtracted texttext/plain94898https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/35704/4/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Lidiane%20Alves%20dos%20Santos.pdf.txt1a402a8f001c90d66b8f43a77dda0ce2MD54THUMBNAILDISSERTAÇÃO Lidiane Alves dos Santos.pdf.jpgDISSERTAÇÃO Lidiane Alves dos Santos.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1302https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/35704/5/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Lidiane%20Alves%20dos%20Santos.pdf.jpgf9e5ce6515bff29aa98b9ccf85ba6282MD55CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/35704/2/license_rdfe39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82310https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/35704/3/license.txtbd573a5ca8288eb7272482765f819534MD53ORIGINALDISSERTAÇÃO Lidiane Alves dos Santos.pdfDISSERTAÇÃO Lidiane Alves dos Santos.pdfapplication/pdf1701892https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/35704/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Lidiane%20Alves%20dos%20Santos.pdf0169b709bfeece937ba679cda9712ae7MD51123456789/357042019-12-13 02:16:27.885oai:repositorio.ufpe.br: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ório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212019-12-13T05:16:27Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false |
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