Marcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFPE |
Texto Completo: | https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/37843 |
Resumo: | O grupo willistoni de Drosophila é composto por espécies muito abundantes nas comunidades neotropicais da família Drosophilidae. O grupo inclui 24 espécies, sendo seis delas pertencentes ao subgrupo willistoni, constituído por espécies crípticas, semiespécies ou subespécies. Diversos estudos podem ser encontrados para Drosophila paulistorum, que é considerada uma superespécie, composta por seis subespécies (Amazônica, Andino-Brasileira, Centro-Americana, Interior, Orinocana e Transicional). Os estudos acerca das divergências evolutivas entre estas subespécies são realizados há décadas. As abordagens comportamentais (isolamento reprodutivo), de variações dos caracteres morfológicos taxonômicos, dos padrões diferenciados dos cromossomos, da sequencias de nucleotídeo de genes, e efeito de endossimbiontes, ilustram bem a importância de D. paulistorum para os estudos evolutivos. Nesse contexto, foi objetivo deste trabalho estabelecer marcadores moleculares para auxiliar em futuras investigações das subespécies de D. paulistorum, com enfoque em populações naturais, recentemente coletadas em florestas úmidas do Brasil. Diante dos resultados de sequenciamento, Drosophila equinoxialis foi também incluída nas análises dos genes COI, COII, Ankyrin e PlexinB, e na caracterização inicial do endossimbionte Wolbachia pipientis. Diante da variabilidade encontrada nas espécies aqui estudadas, os resultados sugerem que diferentes genes são úteis para a diferenciação de diferentes níveis taxonômicos (espécies e subespécies), tomando como referência as amostras de indivíduos recentemente coletados em florestas úmidas do Brasil. |
id |
UFPE_fc41cf150a69326636eb5bce59bd5c5c |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ufpe.br:123456789/37843 |
network_acronym_str |
UFPE |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFPE |
repository_id_str |
2221 |
spelling |
COSTA, Ana Patrícia dahttp://lattes.cnpq.br/1406355214534504http://lattes.cnpq.br/6223762316743262ROHDE, Claudia2020-09-08T17:12:49Z2020-09-08T17:12:49Z2019-08-28COSTA, Ana Patrícia da. Marcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical. 2019. Dissertação (Mestrado em Saúde Humana e Meio Ambiente) - Universidade Federal de Pernambuco, Vitória de Santo Antão, 2019.https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/37843O grupo willistoni de Drosophila é composto por espécies muito abundantes nas comunidades neotropicais da família Drosophilidae. O grupo inclui 24 espécies, sendo seis delas pertencentes ao subgrupo willistoni, constituído por espécies crípticas, semiespécies ou subespécies. Diversos estudos podem ser encontrados para Drosophila paulistorum, que é considerada uma superespécie, composta por seis subespécies (Amazônica, Andino-Brasileira, Centro-Americana, Interior, Orinocana e Transicional). Os estudos acerca das divergências evolutivas entre estas subespécies são realizados há décadas. As abordagens comportamentais (isolamento reprodutivo), de variações dos caracteres morfológicos taxonômicos, dos padrões diferenciados dos cromossomos, da sequencias de nucleotídeo de genes, e efeito de endossimbiontes, ilustram bem a importância de D. paulistorum para os estudos evolutivos. Nesse contexto, foi objetivo deste trabalho estabelecer marcadores moleculares para auxiliar em futuras investigações das subespécies de D. paulistorum, com enfoque em populações naturais, recentemente coletadas em florestas úmidas do Brasil. Diante dos resultados de sequenciamento, Drosophila equinoxialis foi também incluída nas análises dos genes COI, COII, Ankyrin e PlexinB, e na caracterização inicial do endossimbionte Wolbachia pipientis. Diante da variabilidade encontrada nas espécies aqui estudadas, os resultados sugerem que diferentes genes são úteis para a diferenciação de diferentes níveis taxonômicos (espécies e subespécies), tomando como referência as amostras de indivíduos recentemente coletados em florestas úmidas do Brasil.FACEPEThe willistoni group of Drosophila is composed of very abundant species in the neotropical communities of the family Drosophilidae. The group includes 24 species, six of which belonging willistoni subgroup and consists of cryptic, semi-species or subspecies. Several studies can be found for Drosophila paulistorum, which is considered a superspecies, composed of six subspecies (Amazonian, AndeanBrazilian, Central American, Interior, Orinocana and Transitional). Studies on the evolutionary divergences between the subspecies have been conducted for decades. Behavioral approaches (reproductive isolation), variations in taxonomic morphological characters, differentiated chromosome patterns, nucleotide gene sequences, and endosymbionte effects illustrate the importance of D. paulistorum for evolutionary studies. In this context, the objective of this work was to establish molecular markers to assist in future investigations of D. paulistorum subspecies, focusing on natural populations recently collected from Brazilian rainforests. Given the sequencing results, Drosophila equinoxialis was also included in the analysis of the COI, COII, Ankyrin and PlexinB genes, and in the initial characterization of the endosymbiont Wolbachia pipientis. Given the variability found in the species studied here, the results suggest that different genes are useful for the differentiation of different taxonomic levels (species and subspecies), taking as reference the samples of individuals recently collected in Brazilian rainy forests.porUniversidade Federal de PernambucoPrograma de Pós Graduação em Saúde Humana e Meio AmbienteUFPEBrasilAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazilhttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/info:eu-repo/semantics/embargoedAccessEspeciação GenéticaDrosophilaFloresta ÚmidaMarcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região NeotropicalMarcadores genéticos para diferenciação das subespécies de Drosophila paulistorum (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropicalinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesismestradoreponame:Repositório Institucional da UFPEinstname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)instacron:UFPETEXTDISSERTAÇÃO Ana Patrícia da Costa.pdf.txtDISSERTAÇÃO Ana Patrícia da Costa.pdf.txtExtracted texttext/plain102659https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/37843/4/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Ana%20Patr%c3%adcia%20da%20Costa.pdf.txtfdd157606a03a8481dadb6a77f529755MD54THUMBNAILDISSERTAÇÃO Ana Patrícia da Costa.pdf.jpgDISSERTAÇÃO Ana Patrícia da Costa.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1226https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/37843/5/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Ana%20Patr%c3%adcia%20da%20Costa.pdf.jpg2530586970b5e9fecde2b43319281c7bMD55CC-LICENSElicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-8811https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/37843/2/license_rdfe39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34MD52LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82310https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/37843/3/license.txtbd573a5ca8288eb7272482765f819534MD53ORIGINALDISSERTAÇÃO Ana Patrícia da Costa.pdfDISSERTAÇÃO Ana Patrícia da Costa.pdfapplication/pdf1713227https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/37843/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Ana%20Patr%c3%adcia%20da%20Costa.pdf0464c24207648e4b1ed62c7bce2626b9MD51123456789/378432020-09-09 15:44:57.986oai:repositorio.ufpe.br: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ório InstitucionalPUBhttps://repositorio.ufpe.br/oai/requestattena@ufpe.bropendoar:22212020-09-09T18:44:57Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Marcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical |
dc.title.alternative.pt_BR.fl_str_mv |
Marcadores genéticos para diferenciação das subespécies de Drosophila paulistorum (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical |
title |
Marcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical |
spellingShingle |
Marcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical COSTA, Ana Patrícia da Especiação Genética Drosophila Floresta Úmida |
title_short |
Marcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical |
title_full |
Marcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical |
title_fullStr |
Marcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical |
title_full_unstemmed |
Marcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical |
title_sort |
Marcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical |
author |
COSTA, Ana Patrícia da |
author_facet |
COSTA, Ana Patrícia da |
author_role |
author |
dc.contributor.authorLattes.pt_BR.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/1406355214534504 |
dc.contributor.advisorLattes.pt_BR.fl_str_mv |
http://lattes.cnpq.br/6223762316743262 |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
COSTA, Ana Patrícia da |
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv |
ROHDE, Claudia |
contributor_str_mv |
ROHDE, Claudia |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Especiação Genética Drosophila Floresta Úmida |
topic |
Especiação Genética Drosophila Floresta Úmida |
description |
O grupo willistoni de Drosophila é composto por espécies muito abundantes nas comunidades neotropicais da família Drosophilidae. O grupo inclui 24 espécies, sendo seis delas pertencentes ao subgrupo willistoni, constituído por espécies crípticas, semiespécies ou subespécies. Diversos estudos podem ser encontrados para Drosophila paulistorum, que é considerada uma superespécie, composta por seis subespécies (Amazônica, Andino-Brasileira, Centro-Americana, Interior, Orinocana e Transicional). Os estudos acerca das divergências evolutivas entre estas subespécies são realizados há décadas. As abordagens comportamentais (isolamento reprodutivo), de variações dos caracteres morfológicos taxonômicos, dos padrões diferenciados dos cromossomos, da sequencias de nucleotídeo de genes, e efeito de endossimbiontes, ilustram bem a importância de D. paulistorum para os estudos evolutivos. Nesse contexto, foi objetivo deste trabalho estabelecer marcadores moleculares para auxiliar em futuras investigações das subespécies de D. paulistorum, com enfoque em populações naturais, recentemente coletadas em florestas úmidas do Brasil. Diante dos resultados de sequenciamento, Drosophila equinoxialis foi também incluída nas análises dos genes COI, COII, Ankyrin e PlexinB, e na caracterização inicial do endossimbionte Wolbachia pipientis. Diante da variabilidade encontrada nas espécies aqui estudadas, os resultados sugerem que diferentes genes são úteis para a diferenciação de diferentes níveis taxonômicos (espécies e subespécies), tomando como referência as amostras de indivíduos recentemente coletados em florestas úmidas do Brasil. |
publishDate |
2019 |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2019-08-28 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2020-09-08T17:12:49Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2020-09-08T17:12:49Z |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.citation.fl_str_mv |
COSTA, Ana Patrícia da. Marcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical. 2019. Dissertação (Mestrado em Saúde Humana e Meio Ambiente) - Universidade Federal de Pernambuco, Vitória de Santo Antão, 2019. |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/37843 |
identifier_str_mv |
COSTA, Ana Patrícia da. Marcadores genéticos para diferenciação intraespecífica das subespécies de Drosophila paulistorum e D. equinoxialis (Diptera, Drosophilidae) com ocorrência em florestas úmidas da região Neotropical. 2019. Dissertação (Mestrado em Saúde Humana e Meio Ambiente) - Universidade Federal de Pernambuco, Vitória de Santo Antão, 2019. |
url |
https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/37843 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ info:eu-repo/semantics/embargoedAccess |
rights_invalid_str_mv |
Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ |
eu_rights_str_mv |
embargoedAccess |
dc.publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Pernambuco |
dc.publisher.program.fl_str_mv |
Programa de Pós Graduação em Saúde Humana e Meio Ambiente |
dc.publisher.initials.fl_str_mv |
UFPE |
dc.publisher.country.fl_str_mv |
Brasil |
publisher.none.fl_str_mv |
Universidade Federal de Pernambuco |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFPE instname:Universidade Federal de Pernambuco (UFPE) instacron:UFPE |
instname_str |
Universidade Federal de Pernambuco (UFPE) |
instacron_str |
UFPE |
institution |
UFPE |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFPE |
collection |
Repositório Institucional da UFPE |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/37843/4/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Ana%20Patr%c3%adcia%20da%20Costa.pdf.txt https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/37843/5/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Ana%20Patr%c3%adcia%20da%20Costa.pdf.jpg https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/37843/2/license_rdf https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/37843/3/license.txt https://repositorio.ufpe.br/bitstream/123456789/37843/1/DISSERTA%c3%87%c3%83O%20Ana%20Patr%c3%adcia%20da%20Costa.pdf |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
fdd157606a03a8481dadb6a77f529755 2530586970b5e9fecde2b43319281c7b e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 bd573a5ca8288eb7272482765f819534 0464c24207648e4b1ed62c7bce2626b9 |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFPE - Universidade Federal de Pernambuco (UFPE) |
repository.mail.fl_str_mv |
attena@ufpe.br |
_version_ |
1802310678045786112 |