Análise filogenética de Rhinocryptidae revisitada: testando o monofiletismo dos gêneros Pteroptochos e Scelorchilus
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Data de Publicação: | 2020 |
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Resumo: | Rhinocryptidae é uma família de aves composta por indivíduos de pequeno a médio porte, dividida em 12 gêneros e aproximadamente 60 espécies restritas à região Neotropical. Normalmente são animais tímidos, de hábitos terrícolas e dieta onívora, que vivem em áreas florestais ou de mata aberta. São reconhecidos como um agrupamento monofilético por diversos estudos filogenéticos. O objetivo desse trabalho consistiu em apresentar uma hipótese filogenética para Rhinocryptidae, com enfoque nos gêneros Pteroptochos e Scelorchilus baseada em caracteres morfológicos. Foram analisados esqueletos e siringes dos 12 gêneros que compõem a família, tratados como grupo interno no estudo. Representando o grupo externo, foram incluídas 16 espécies representantes dos demais táxons que constituem a infraordem Furnariides, a saber: Conopophagidae, Dendrocolaptidae, Formicaridae, Furnariidae, Grallaridae, Melanopareiidae, Scleruridae e Thamnophilidae, além de um representante da infraordem Tyrannides, consistindo no enraizamento da filogenia. A partir desse exame morfológico foi gerada uma matriz com 43 espécies e 91 caracteres, a qual foi submetida análises diferentes que tiveram como critério o princípio da parcimônia. Oito diferentes abordagens foram utilizadas, valendo-se da capacidade de buscas proporcionada pelas “novas tecnologias” contidas no Software TNT. Em todos os resultados o monofiletismo dos rinocriptídeos foi recuperado, com índice de Goodman-Bremer variando de 3 a 8 e Bootstrap acima dos 90%, apoiando filogenias já publicadas. A posição de Liosceles na base da filogenia foi novamente afirmada, condição essa que levou alguns autores a sugerir que o gênero fosse classificado em uma subfamília (Lioscelinae) e os demais representantes de Rhinocryptidae em outra (Rhinocryptinae). A proximidade dos gêneros Eleoscytalopus + Merulaxis, Teledromas + Rhinocrypta e Eugralla + Myornis + Scytalopus obteve alto suporte, assim como Pteroptochos + Scelorchilus. As duas espécies de Scelorchilus foram recuperadas como espécies-irmãs em todas as topologias encontradas, porém o mesmo não ocorreu com Pteroptochos, que demonstrou três possíveis arranjos para o clado. Apesar das incongruências apresentadas internamente, as cinco espécies se mostraram consistentes como um agrupamento monofilético. Os resultados encontrados sugerem fortemente que a abordagem da matriz e a ordenação ou não de caracteres multiestados influenciam na topologia final das filogenias, assim como em seu número de passos. |
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2021-10-26T21:04:55Z2021-10-262021-10-26T21:04:55Z2020-02-28RAMOS, Jeferson Vidart. Análise filogenética de Rhinocryptidae revisitada: testando o monofiletismo dos gêneros Pteroptochos e Scelorchilus. 2020. 75f. Dissertação (Mestrado em Biologia Animal) – Instituto de Biologia, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2020.http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/8042Rhinocryptidae é uma família de aves composta por indivíduos de pequeno a médio porte, dividida em 12 gêneros e aproximadamente 60 espécies restritas à região Neotropical. Normalmente são animais tímidos, de hábitos terrícolas e dieta onívora, que vivem em áreas florestais ou de mata aberta. São reconhecidos como um agrupamento monofilético por diversos estudos filogenéticos. O objetivo desse trabalho consistiu em apresentar uma hipótese filogenética para Rhinocryptidae, com enfoque nos gêneros Pteroptochos e Scelorchilus baseada em caracteres morfológicos. 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A posição de Liosceles na base da filogenia foi novamente afirmada, condição essa que levou alguns autores a sugerir que o gênero fosse classificado em uma subfamília (Lioscelinae) e os demais representantes de Rhinocryptidae em outra (Rhinocryptinae). A proximidade dos gêneros Eleoscytalopus + Merulaxis, Teledromas + Rhinocrypta e Eugralla + Myornis + Scytalopus obteve alto suporte, assim como Pteroptochos + Scelorchilus. As duas espécies de Scelorchilus foram recuperadas como espécies-irmãs em todas as topologias encontradas, porém o mesmo não ocorreu com Pteroptochos, que demonstrou três possíveis arranjos para o clado. Apesar das incongruências apresentadas internamente, as cinco espécies se mostraram consistentes como um agrupamento monofilético. Os resultados encontrados sugerem fortemente que a abordagem da matriz e a ordenação ou não de caracteres multiestados influenciam na topologia final das filogenias, assim como em seu número de passos.Rhinocryptidae is a family of birds composed of small to medium-sized individuals, divided into 12 genera and approximately 60 species restricted to the Neotropical region. They are usually shy animals, with terrestrial habits and an omnivorous diet,living in forest or open forest areas. They are recognized as a monophyletic group by several phylogenetic studies. The aim of this work was to present a phylogenetic hypothesis for Rhinocryptidae, focusing on the genera Pteroptochos and Scelorchilus based on morphological characters. Skeletons and syringes of the 12 genera that are included in the family were analyzed, treated as an internal group in the study. For the outgroup, 16 species representing the other families that makeup the Infraorder Furnariides were included, namely: Conopophagidae, Dendrocolaptidae, Formicariidae, Furnariidae, Grallariidae, Melanopareiidae, Scleruridae and Thamnophilidae, in addition to a representative of the infraorder Tyranni for rooting the phylogeny. From this morphological examination, a matrix with 43 species and 91 characters was generated, which was submitted to different analyzes based on the principle of parsimony. Eight different approaches were used, taking advantage of the search capabilities provided by the “new technologies” contained in the TNT Software. In all results, Rhinocryptidae monophyly was recovered, with Goodman-Bremer index ranging from 3 to 8 and Bootstrap above 90%, supporting phylogenies already published. Liosceles position on the basis of phylogeny was again affirmed, a condition that led some authors to suggest that the genus be classified in one subfamily (Lioscelinae) and the other representatives of Rhinocryptidae in another (Rhinocryptinae). The proximity of the genera Eleoscytalopus + Merulaxis, Teledromas + Rhinocrypta and Eugralla + Myornis + Scytalopus obtained high support, as well as Pteroptochos + Scelorchilus. The two species of Scelorchilus were recovered as sister species in all topologies found, but the same did not happen with Pteroptochos, which demonstrated three possible arrangements for the clade. Despite the incongruences presented internally, the five species proved to be consistent as a monophyletic cluster. The results found strongly suggest that the approach of partitioning the matrix and the ordering or not of multistate characters influence the final topology of the phylogenies, as well as their number of steps.Sem bolsaporUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em Biologia AnimalUFPelBrasilInstituto de BiologiaCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::ZOOLOGIA::MORFOLOGIA DOS GRUPOS RECENTESAves neotropicaisExame morfológicoFurnariidesNeotropicals birdsMorphological examinationAnálise filogenética de Rhinocryptidae revisitada: testando o monofiletismo dos gêneros Pteroptochos e ScelorchilusPhylogenetic analysis of Rhinocryptidae revisited: testing the monophyly of the genera Pteroptochos and Scelorchilusinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://lattes.cnpq.br/0379617784406958http://lattes.cnpq.br/3625095609728602Maurício, Giovanni NachtigallRamos, Jeferson VidartRAMOS, Jeferson Vidart. Análise filogenética de Rhinocryptidae revisitada: testando o monofiletismo dos gêneros Pteroptochos e Scelorchilus. 2020. 75f. Dissertação (Mestrado em Biologia Animal) – Instituto de Biologia, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2020.info:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELTEXTdissertacao_jeferson_ramos.pdf.txtdissertacao_jeferson_ramos.pdf.txtExtracted texttext/plain118791http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8042/6/dissertacao_jeferson_ramos.pdf.txtf3aeb75de9231fa8094c7afd59385313MD56open accessTHUMBNAILdissertacao_jeferson_ramos.pdf.jpgdissertacao_jeferson_ramos.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1194http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8042/7/dissertacao_jeferson_ramos.pdf.jpga2b63e9ea181490b53c88b8a2329c60dMD57open accessORIGINALdissertacao_jeferson_ramos.pdfdissertacao_jeferson_ramos.pdfapplication/pdf6281086http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8042/1/dissertacao_jeferson_ramos.pdf811c0dfd5db5298764947830bf27642fMD51open accessCC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8042/2/license_url4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2fMD52open accesslicense_textlicense_texttext/html; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8042/3/license_textd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53open accesslicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8042/4/license_rdfd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81866http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8042/5/license.txt43cd690d6a359e86c1fe3d5b7cba0c9bMD55open accessprefix/80422023-07-13 07:37:47.368open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br: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ório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2023-07-13T10:37:47Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false |
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