Identificação de sequências homólogas de aquaporinas no genoma de aveia cultivar Barbarasul
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Data de Publicação: | 2011 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca |
Texto Completo: | http://repositorio.ufpel.edu.br/handle/ri/1294 |
Resumo: | Oats (Avena sativa L.) are a winter cereal used for both humans and livestock, giving a great importance on the world stage. In the post-genomic era new sequenced genomes can be used to derive functions of organisms from the knowledge of these systems. In this work were apply this approach to the analysis of gene family of aquaporins in oats. The aquaporins are major intrinsic proteins (MIP) that have been characterized as facilitating the water flow. They are also known as water channels, glycerol facilitators and aquaglyceroporins, recent data suggest that they facilitate the movement of other molecular low weight metabolites. The presence of these genes is importance for the development and adaptation of plants, however, until now there are not studies reporting the identification of aquaporins in the oat genome. In this report we identified two sequences identified as potential aquaporins present in the genome of oat. Considering the number of aquaporin genes present in genome of rice, Arabidopsis, maize and wheat and the complexity of its polyploid genome, it is estimated that oats may have around 20 or more copies of these genes in each genome. Given the growing problems of flooding and drought, the need for cultivation in areas affected by salinity and the proven role of MIPs on plant response to stresses related to water availability, the investigations of these genes are essential in oats too. However a greater number of these genes can be identified in the future, this study was an important step in its characterization. |
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2014-08-20T13:32:58Z2011-09-142014-08-20T13:32:58Z2011-05-26SILVEIRA, Carla Ferreira. Identification of homologous sequences of aquaporins in oat genome cv. Barbarasul. 2011. 52 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2011.http://repositorio.ufpel.edu.br/handle/ri/1294Oats (Avena sativa L.) are a winter cereal used for both humans and livestock, giving a great importance on the world stage. In the post-genomic era new sequenced genomes can be used to derive functions of organisms from the knowledge of these systems. In this work were apply this approach to the analysis of gene family of aquaporins in oats. The aquaporins are major intrinsic proteins (MIP) that have been characterized as facilitating the water flow. They are also known as water channels, glycerol facilitators and aquaglyceroporins, recent data suggest that they facilitate the movement of other molecular low weight metabolites. The presence of these genes is importance for the development and adaptation of plants, however, until now there are not studies reporting the identification of aquaporins in the oat genome. In this report we identified two sequences identified as potential aquaporins present in the genome of oat. Considering the number of aquaporin genes present in genome of rice, Arabidopsis, maize and wheat and the complexity of its polyploid genome, it is estimated that oats may have around 20 or more copies of these genes in each genome. Given the growing problems of flooding and drought, the need for cultivation in areas affected by salinity and the proven role of MIPs on plant response to stresses related to water availability, the investigations of these genes are essential in oats too. However a greater number of these genes can be identified in the future, this study was an important step in its characterization.A aveia (Avena sativa L.) é um cereal de inverno utilizado tanto para a alimentação humana quanto animal, apresentando uma grande importância no cenário mundial. Na era pós-genômica novos genomas sequenciados podem ser utilizados para inferir funções de organismos a partir do conhecimento de outros sistemas. Neste trabalho foi aplicada essa abordagem à análise de genes da familia das aquaporinas em aveia. As aquaporinas são proteínas intrínsecas de membrana (MIP) que têm sido caracterizadas como facilitadoras do fluxo de água. São também conhecidas como canais de água, glicerol facilitadores e aquagliceroporinas. Dados recentes sugerem que elas facilitam a circulação de outros metabólitos de baixo peso molecular. A presença dos genes que codificam essas proteínas é de suma importância para o desenvolvimento e adaptação das plantas, contudo, até hoje não existiam estudos relatando a identificação de genes de aquaporinas no genoma da aveia. O sequenciamento e caracterização in silico das sequências obtidas neste trabalho propõem a presença de genes que codificam prováveis aquaporinas. Foram identificadas duas sequências como prováveis aquaporinas presentes no genoma da aveia. Considerando o número de genes de aquaporinas presentes no genoma do arroz, Arabidopsis, milho e trigo e a complexidade de seu genoma poliplóide, estimase que a aveia possua mais cópias desses genes. Tendo em vista os crescentes problemas de alagamento e/ou seca, a necessidade de cultivo em áreas afetadas pela salinidade, e o comprovado papel das MIPs na resposta das plantas a estresses relacionados com a disponibilidade de água, as investigações desses genes em aveia são essenciais. Contudo um número maior desses genes poderão ser identificados e caracterizados, esse estudo representa uma etapa importante para sua caracterização.application/pdfporUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em BiotecnologiaUFPelBRBiotecnologiaBiotecnologiaAvena sativaÁguaPós-genômicaGenômica comparativaAveiaBiotechnologyAvena sativaWaterPost-genomicComparative genomicOatsCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA VEGETALIdentificação de sequências homólogas de aquaporinas no genoma de aveia cultivar BarbarasulIdentification of homologous sequences of aquaporins in oat genome cv. Barbarasulinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://lattes.cnpq.br/2198424311102211http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.do?id=K4780819H4Chaves, Ana Lúcia Soareshttp://lattes.cnpq.br/1775478697053083Oliveira, Antônio Costa deSilveira, Carla Ferreirainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELORIGINALdissertacao_carla_silveira.pdfapplication/pdf1301704http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/123456789/1294/1/dissertacao_carla_silveira.pdfe35505f057e1acb40d6e79b4da74308dMD51open accessTEXTdissertacao_carla_silveira.pdf.txtdissertacao_carla_silveira.pdf.txtExtracted Texttext/plain84933http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/123456789/1294/2/dissertacao_carla_silveira.pdf.txt86aa8596a345b4416a852c4a5839da69MD52open accessTHUMBNAILdissertacao_carla_silveira.pdf.jpgdissertacao_carla_silveira.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1371http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/123456789/1294/3/dissertacao_carla_silveira.pdf.jpg916e744928bcfc8aab3fd50b39aacb2cMD53open access123456789/12942019-08-23 09:25:01.301open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:123456789/1294Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2019-08-23T12:25:01Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false |
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