Amplificação isotérmica mediada por Loop: Uma técnica rápida e eficiente para a detecção de Trialeourodes vaporariorum e Sclerotinia sclerotiorum em sementes de soja

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Neves, Carolina Garcia
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca
Texto Completo: http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/8140
Resumo: A demanda por alimentos está cada vez maior devido às grandes transformações que o mundo vem passando. O Brasil é destaque na produção e exportação de alimentos e a cada ano que passa a produção de grãos vem batendo recorde. Porém, as perdas causadas por doenças e pragas são um grande limitante da produtividade e, para evitar estes prejuízos, precisamos realizar o controle de forma rápida e eficiente. O primeiro passo para o sucesso no controle de doenças é a detecção da praga/patógeno na área de cultivo e essa deve ser precoce e correta. A amplificação isotérmica mediada por loop é uma técnica molecular que vem sendo utilizada em diversos campos biológicos. Não necessita de equipamentos sofisticados para sua aplicação e por isso pode ser empregada no campo ou em laboratório. Além disso, a visualização dos resultados pode ser feita diretamente a olho nu através da mudança de cor da reação. Nesse estudo utilizamos a técnica para realizar a rápida identificação da mosca branca Trialeurodes vaporariorum, com ou sem extração de DNA. Nosso resultado demonstrou que para a identificação são necessários apenas 60 minutos de incubação, sendo dispensável a etapa de extração de DNA. Também, foi desenvolvido um teste LAMP para detecção de Sclerotinia sclerotiorum em sementes de soja. Nesse estudo, nossos resultados demonstram que com um potencial de inóculo de 48 horas, é possível detectar o patógeno quando apenas 1% das sementes de soja estão infectadas com o fungo. Ambos os trabalhos fornecem resultados valiosos para as áreas de entomologia e fitopatologia. E demonstram a versatilidade da técnica que pode ser aplicada com diferentes materiais biológicos.
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A amplificação isotérmica mediada por loop é uma técnica molecular que vem sendo utilizada em diversos campos biológicos. Não necessita de equipamentos sofisticados para sua aplicação e por isso pode ser empregada no campo ou em laboratório. Além disso, a visualização dos resultados pode ser feita diretamente a olho nu através da mudança de cor da reação. Nesse estudo utilizamos a técnica para realizar a rápida identificação da mosca branca Trialeurodes vaporariorum, com ou sem extração de DNA. Nosso resultado demonstrou que para a identificação são necessários apenas 60 minutos de incubação, sendo dispensável a etapa de extração de DNA. Também, foi desenvolvido um teste LAMP para detecção de Sclerotinia sclerotiorum em sementes de soja. Nesse estudo, nossos resultados demonstram que com um potencial de inóculo de 48 horas, é possível detectar o patógeno quando apenas 1% das sementes de soja estão infectadas com o fungo. Ambos os trabalhos fornecem resultados valiosos para as áreas de entomologia e fitopatologia. E demonstram a versatilidade da técnica que pode ser aplicada com diferentes materiais biológicos.The demand for food is increasing due to the great changes that the world has been going through. Brazil stands out in the production and export of food and with each passing year the production of grains has been breaking a record. However, losses caused by diseases and pests are a major limitation of productivity and, to avoid these losses, we need to carry out the control quickly and efficiently. The first step towards successful control is the detection of the pest / pathogen in the cultivation area and this must be early and correct. Loop-mediated isothermal amplification is a molecular technique that has been used in several biological fields. It does not need sophisticated equipment for its application and therefore it can be used in the field or in the laboratory. In addition, the results can be visualized directly with the naked eye by changing the color of the reaction. In this study, we used the technique to quickly identify the whitefly Trialeurodes vaporariorum, with or without DNA extraction. Our result showed that for the identification, only 60 minutes of incubation are necessary, and the DNA extraction step is unnecessary. Also, a LAMP test was developed to detect Sclerotinia sclerotiorum in soybean seeds. In this study, our results demonstrate that with a 48-hour inoculum potential, it is possible to detect the pathogen when only 1% of soybean seeds are infected with the fungus. Both works provide valuable results for the areas of entomology and phytopathology. And they demonstrate the versatility of the technique that can be applied with different biological materials.porUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em FitossanidadeUFPelBrasilFaculdade de Agronomia Eliseu MacielCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOSSANIDADEWhite moldDiagnosisChange colorWhiteflyMosca brancaMofo brancoDiagnoseMudança de corAmplificação isotérmica mediada por Loop: Uma técnica rápida e eficiente para a detecção de Trialeourodes vaporariorum e Sclerotinia sclerotiorum em sementes de sojaLoop-mediated isothermal amplification: A fast and efficient technique for the detection of Trialeourodes vaporariorum and Sclerotinia sclerotiorum in soybean seedsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesishttp://lattes.cnpq.br/5917436331410328http://lattes.cnpq.br/2475361685792241Barros, Danielle Ribeiro deNeves, Carolina Garciainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELTEXTTese_Doutorado_Carolina_Garcia_Neves.pdf.txtTese_Doutorado_Carolina_Garcia_Neves.pdf.txtExtracted texttext/plain157028http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8140/6/Tese_Doutorado_Carolina_Garcia_Neves.pdf.txt3c307de84d9d4cee37506b9a08b51d69MD56open accessTHUMBNAILTese_Doutorado_Carolina_Garcia_Neves.pdf.jpgTese_Doutorado_Carolina_Garcia_Neves.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1241http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8140/7/Tese_Doutorado_Carolina_Garcia_Neves.pdf.jpg77f5217c22d9fc7d98ef0e112de76c77MD57open accessORIGINALTese_Doutorado_Carolina_Garcia_Neves.pdfTese_Doutorado_Carolina_Garcia_Neves.pdfapplication/pdf887680http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8140/1/Tese_Doutorado_Carolina_Garcia_Neves.pdf83e9282a13b6c15348164f70b1e17561MD51open accessCC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8140/2/license_url4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2fMD52open accesslicense_textlicense_texttext/html; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8140/3/license_textd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53open accesslicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8140/4/license_rdfd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-867http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8140/5/license.txtfbd6c74465857056e3ca572d7586661bMD55open accessprefix/81402023-07-13 06:59:36.201open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/8140VG9kb3Mgb3MgaXRlbnMgZGVzc2EgY29tdW5pZGFkZSBzZWd1ZW0gYSBsaWNlbsOnYSBDcmVhdGl2ZSBDb21tb25zLg==Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2023-07-13T09:59:36Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false
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