Meta-análise de Locos de Caracteres Quantitativos (QTL) para resistência à Magnaporthe oryzae em trigo
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Data de Publicação: | 2021 |
Tipo de documento: | Dissertação |
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Título da fonte: | Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca |
Texto Completo: | http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/7630 |
Resumo: | Datada há quase 10 mil anos, a história do trigo (Triticum aestivum L.) acompanha a da humanidade, sendo um alimento fundamental na cadeia alimentícia. Apesar de largamente produzido, diversos problemas ocorrem no seu cultivo e o principal obstáculo, em diversas regiões produtoras, é a incidência do patógeno Magnaporthe oryzae. A tática mais pertinente para contornar esse entrave é o uso de estratégias genéticas desenvolvidas pelo melhoramento genético, onde o uso de mapeamento genético é uma opção promissora e tem sido utilizado no estudo de doenças no trigo. Porém, o que se produziu para esta moléstia, até o momento, são genótipos com no máximo resistência moderada, os quais já se tem relatado perda de resistência quando submetido a raças mais agressivas. Assim, foi realizado uma meta-análise para consolidar Locos de Caracteres Quantitativos da brusone no trigo e elucidar características genéticas deste cereal, que possam ser úteis ao melhorista durante o processo de seleção de constituições genéticas com resistência à brusone. Utilizando mapas de marcadores moleculares SNP, DART e SSR, foram aplicadas análises estatísticas com o pacote LPmerge para a criação de um mapa consensual para cada cromossomo. Dentre os 30 QTL de linhagens únicas revisados, 29 QTL foram projetados num total de 86.912 marcadores abrangidos entre os cromossomos 1A, 2A, 2B, 3A, 4A, 4D, 5A, 5B, 6A e 7B. Alguns QTL se destacam por atuarem na resistência à moléstia em dois estadios de desenvolvimento da planta, na fase de plântula e espigamento, o caso do QTL21 no cromossomo 4B, QTL24 no 5A e QTL27 no 6A. O cromossomo 2A apresentou os QTL mais promissores, sendo QTL5, QTL6, QTL7, QTL8 e QTL9 |
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2021-06-08T19:08:42Z2021-06-082021-06-08T19:08:42Z2021-02-26Conte, Giordano Gelain. Meta-análise de Locos de Caracteres Quantitativos (QTL) para resistência à Magnaporthe oryzae em trigo. 2020. 51f. Dissertação de Mestrado – Programa de Pós-Graduação em Agronomia, Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2020http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/7630Datada há quase 10 mil anos, a história do trigo (Triticum aestivum L.) acompanha a da humanidade, sendo um alimento fundamental na cadeia alimentícia. Apesar de largamente produzido, diversos problemas ocorrem no seu cultivo e o principal obstáculo, em diversas regiões produtoras, é a incidência do patógeno Magnaporthe oryzae. A tática mais pertinente para contornar esse entrave é o uso de estratégias genéticas desenvolvidas pelo melhoramento genético, onde o uso de mapeamento genético é uma opção promissora e tem sido utilizado no estudo de doenças no trigo. Porém, o que se produziu para esta moléstia, até o momento, são genótipos com no máximo resistência moderada, os quais já se tem relatado perda de resistência quando submetido a raças mais agressivas. Assim, foi realizado uma meta-análise para consolidar Locos de Caracteres Quantitativos da brusone no trigo e elucidar características genéticas deste cereal, que possam ser úteis ao melhorista durante o processo de seleção de constituições genéticas com resistência à brusone. Utilizando mapas de marcadores moleculares SNP, DART e SSR, foram aplicadas análises estatísticas com o pacote LPmerge para a criação de um mapa consensual para cada cromossomo. Dentre os 30 QTL de linhagens únicas revisados, 29 QTL foram projetados num total de 86.912 marcadores abrangidos entre os cromossomos 1A, 2A, 2B, 3A, 4A, 4D, 5A, 5B, 6A e 7B. Alguns QTL se destacam por atuarem na resistência à moléstia em dois estadios de desenvolvimento da planta, na fase de plântula e espigamento, o caso do QTL21 no cromossomo 4B, QTL24 no 5A e QTL27 no 6A. O cromossomo 2A apresentou os QTL mais promissores, sendo QTL5, QTL6, QTL7, QTL8 e QTL9Dated almost 10,000 years ago, the history of wheat (Triticum aestivum L.) follows that of humanity, being a fundamental food in the food chain. Although widely produced, several problems occur in its cultivation and the main obstacle, in several producing regions, is the incidence of the pathogen Magnaporthe oryzae. The current approach to overcome this obstacle is the use of genetic strategies developed by genetic breeding, where the use of genetic mapping is a promising option and has been used in the study of wheat diseases. However, what has been produced for this disease so far, are genotypes with at most moderate resistance, which have already been reported loss of resistance when subjected to more aggressive breeds. Thus, a meta-analysis was performed to consolidate Quantitative Trait Loci to wheat blast and highlight genetic characteristics of this cereal, that could be useful for breeders during the selection process of genetic plants with resistance to wheat blast. Using SNP, DART and SSR molecular marker maps, statistical analysis was applied with the LPmerge package to create a consensual map for each chromosome. Among the 30 QTL of unique lines reviewed, 29 QTL were designed covering 86,912 markers between chromosomes 1A, 2A, 2B, 3A, 4A, 4D, 5A, 5B, 6A and 7B. Some QTL stand out for acting in the resistance to the disease in two stages of the wheat plant development, in the seedling and heading phase, the case of QTL21 on chromosome 4B, QTL24 on 5A and QTL27 on 6A. Chromosome 2A showed the most promising QTL, being QTL5, QTL6, QTL7, QTL8 and QTL9.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESporUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em AgronomiaUFPelBrasilFaculdade de Agronomia Eliseu MacielCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIABrusonerTriticum aestivumMarcadorWheat blastTriticum aestivumMarkerMeta-análise de Locos de Caracteres Quantitativos (QTL) para resistência à Magnaporthe oryzae em trigoConte, Giordano Gelain. Meta-analysis for Quantitative Trait Loci (QTL) for resistance to Magnaporthe oryzae in wheatinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://lattes.cnpq.br/1622605924329072http://lattes.cnpq.br/2717555680999191Venske, Eduardohttp://lattes.cnpq.br/8953935036814149Oliveira, Antônio Costa deConte, Giordano Gelaininfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELTEXTGiordano_Gelain_Conte.pdf.txtGiordano_Gelain_Conte.pdf.txtExtracted texttext/plain81707http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/7630/6/Giordano_Gelain_Conte.pdf.txt094ed78fa1f70350d3dbcebb82b66346MD56open accessTHUMBNAILGiordano_Gelain_Conte.pdf.jpgGiordano_Gelain_Conte.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1247http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/7630/7/Giordano_Gelain_Conte.pdf.jpg9de4d13d52ca11d488741ed492192633MD57open accessORIGINALGiordano_Gelain_Conte.pdfGiordano_Gelain_Conte.pdfapplication/pdf2974772http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/7630/1/Giordano_Gelain_Conte.pdfa628239920916e9a14ebc2967d114337MD51open accessCC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/7630/2/license_url4afdbb8c545fd630ea7db775da747b2fMD52open accesslicense_textlicense_texttext/html; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/7630/3/license_textd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53open accesslicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/7630/4/license_rdfd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-867http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/7630/5/license.txtfbd6c74465857056e3ca572d7586661bMD55open accessprefix/76302023-07-13 05:10:50.421open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/7630VG9kb3Mgb3MgaXRlbnMgZGVzc2EgY29tdW5pZGFkZSBzZWd1ZW0gYSBsaWNlbsOnYSBDcmVhdGl2ZSBDb21tb25zLg==Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2023-07-13T08:10:50Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false |
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Datada há quase 10 mil anos, a história do trigo (Triticum aestivum L.) acompanha a da humanidade, sendo um alimento fundamental na cadeia alimentícia. Apesar de largamente produzido, diversos problemas ocorrem no seu cultivo e o principal obstáculo, em diversas regiões produtoras, é a incidência do patógeno Magnaporthe oryzae. A tática mais pertinente para contornar esse entrave é o uso de estratégias genéticas desenvolvidas pelo melhoramento genético, onde o uso de mapeamento genético é uma opção promissora e tem sido utilizado no estudo de doenças no trigo. Porém, o que se produziu para esta moléstia, até o momento, são genótipos com no máximo resistência moderada, os quais já se tem relatado perda de resistência quando submetido a raças mais agressivas. Assim, foi realizado uma meta-análise para consolidar Locos de Caracteres Quantitativos da brusone no trigo e elucidar características genéticas deste cereal, que possam ser úteis ao melhorista durante o processo de seleção de constituições genéticas com resistência à brusone. Utilizando mapas de marcadores moleculares SNP, DART e SSR, foram aplicadas análises estatísticas com o pacote LPmerge para a criação de um mapa consensual para cada cromossomo. Dentre os 30 QTL de linhagens únicas revisados, 29 QTL foram projetados num total de 86.912 marcadores abrangidos entre os cromossomos 1A, 2A, 2B, 3A, 4A, 4D, 5A, 5B, 6A e 7B. Alguns QTL se destacam por atuarem na resistência à moléstia em dois estadios de desenvolvimento da planta, na fase de plântula e espigamento, o caso do QTL21 no cromossomo 4B, QTL24 no 5A e QTL27 no 6A. O cromossomo 2A apresentou os QTL mais promissores, sendo QTL5, QTL6, QTL7, QTL8 e QTL9 |
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