Delineamento de esquemas de seleção genômica para resistência ao carrapato bovino
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Data de Publicação: | 2015 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca |
Texto Completo: | http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/8859 |
Resumo: | O objetivo deste trabalho foi analisar os ganhos genéticos obtidos por meio de diferentes estratégias de inclusão da resistência ao carrapato (CARR) usando valores genômicos em índices de seleção (IS) e verificar o custo da incorporação da seleção genômica em programas de melhoramento. Além de CARR, foram consideradas as características atualmente integrantes do Índice Delta G (IDG) usadas no melhoramento das raças Hereford e Braford, as quais são: ganho de peso do nascimento ao desmame (GPND), conformação na desmama (CD), precocidade na desmama (PD), musculatura na desmama (MD), ganho de peso pós-desmama (GPPD), conformação no sobreano (CS), precocidade no sobreano (PS), musculatura no sobreano (MS) e perímetro escrotal (PE). O ganho genético por geração (ΔG) foi avaliado usando nove diferentes IS, com o atual IDG e oito alternativas incluindo CARR no IDG com peso relativo de 10%, 50% ou 100%, e empregando valor genético tradicional (EBV) ou genômico (GEBV). Outras sete estratégias para seleção com inclusão de genotipagem seletiva foram também consideradas, selecionando e genotipando todos ou parte dos animais à desmama ou ao sobreano. A acurácia do GEBV (rMG) variou de 0,1 a 0,9. Mudanças na acurácia do índice ( IH R ) alterando rMG foram maiores para os cenários que incluíram todas as características com GEBV no índice (0,16 a 0,96), em comparação com cenários onde apenas CARR foi considerada com GEBV (0,37 a 0,82). Contando carrapatos e usando EBV para selecionar para CARR resultaria no mesmo ΔG de um GEBV com rMG=0,44, no entanto o animal teria de ser exposto ao parasita para obter a informação fenotípica. Por outro lado, uso de GEBV para CARR com rMG ≥ 0,5 resultaria em valores elevados para IH R variando de 0,50 a 0,93, sem os riscos do parasitismo. Os ganhos totais aumentaram e as diferenças em relação ao cenário base foram ampliadas quando o peso relativo em CARR foi de 50%. Maior diferença foi observada para ΔG entre o cenário controle (IDG) e o cenário utilizando EBV com peso de 100% para CARR, quando comparado o IDG e os cenários com 10 e 50% que continham somente EBV. Devido à baixa correlação com outras características do IDG, progresso genético substancial para CARR somente seria alcançado quando é o foco principal da seleção, com pelo menos 50% de peso relativo, usando GEBV para CARR (ΔG =37,40) ou todas características com GEBV (ΔG =42,00). A seleção sem a genotipagem dos animas, embora tenha um ganho total menor (59,50), o retorno em ganho genético (RG) por real investido é maior (RG=0,005) em função do custo menor (R$ 221,00 reais) do que genotipando todos os animais, que apresenta um RG de 0,001 e custo de R$ 694,00 reais para aumentar um desvio padrão genético. Para seleção com foco em CARR, os índices com informação de GEBV e peso de 50% apresentam melhores resultados enfatizando a característica, quando o objetivo é obter animais resistentes ao parasitismo. Quanto a genotipagem seletiva, a estratégia com maior ganho genético e menor custo para aumentar um DP e maior retorno em ganho genético é o que utiliza peso de 100% para CARR genotipando 25% dos machos ao sobreano. |
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2022-12-28T14:52:00Z2022-12-282022-12-28T14:52:00Z2015-02-24REIS, Ândrea Plotzki. Delineamento de esquemas de seleção genômica para resistência ao carrapato bovino. 2015. 78 f. Dissertação (Mestrado) - Programa de Pós Graduação em Zootecnia. Faculdade de Agronomia Eliseu Maciel, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas, 2015.http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/8859O objetivo deste trabalho foi analisar os ganhos genéticos obtidos por meio de diferentes estratégias de inclusão da resistência ao carrapato (CARR) usando valores genômicos em índices de seleção (IS) e verificar o custo da incorporação da seleção genômica em programas de melhoramento. Além de CARR, foram consideradas as características atualmente integrantes do Índice Delta G (IDG) usadas no melhoramento das raças Hereford e Braford, as quais são: ganho de peso do nascimento ao desmame (GPND), conformação na desmama (CD), precocidade na desmama (PD), musculatura na desmama (MD), ganho de peso pós-desmama (GPPD), conformação no sobreano (CS), precocidade no sobreano (PS), musculatura no sobreano (MS) e perímetro escrotal (PE). O ganho genético por geração (ΔG) foi avaliado usando nove diferentes IS, com o atual IDG e oito alternativas incluindo CARR no IDG com peso relativo de 10%, 50% ou 100%, e empregando valor genético tradicional (EBV) ou genômico (GEBV). Outras sete estratégias para seleção com inclusão de genotipagem seletiva foram também consideradas, selecionando e genotipando todos ou parte dos animais à desmama ou ao sobreano. A acurácia do GEBV (rMG) variou de 0,1 a 0,9. 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Devido à baixa correlação com outras características do IDG, progresso genético substancial para CARR somente seria alcançado quando é o foco principal da seleção, com pelo menos 50% de peso relativo, usando GEBV para CARR (ΔG =37,40) ou todas características com GEBV (ΔG =42,00). A seleção sem a genotipagem dos animas, embora tenha um ganho total menor (59,50), o retorno em ganho genético (RG) por real investido é maior (RG=0,005) em função do custo menor (R$ 221,00 reais) do que genotipando todos os animais, que apresenta um RG de 0,001 e custo de R$ 694,00 reais para aumentar um desvio padrão genético. Para seleção com foco em CARR, os índices com informação de GEBV e peso de 50% apresentam melhores resultados enfatizando a característica, quando o objetivo é obter animais resistentes ao parasitismo. Quanto a genotipagem seletiva, a estratégia com maior ganho genético e menor custo para aumentar um DP e maior retorno em ganho genético é o que utiliza peso de 100% para CARR genotipando 25% dos machos ao sobreano.The objective of this study were compare the gains from the inclusion of genomic values in the selection index (IS) and check the cost benefit of the incorporation of genomic selection in Delta G Hereford and Braford breeding program, adding the trait count of ticks (CARR) using IS. Besides CARR, traits already considered in Delta G Index (IDG) were evaluated: pre-weaning gain (GPND), weaning conformation (CD), weaning precocity (PD), weaning muscling (MD), post-weaning gain (GPPD), yearling conformation (CS), yearling precocity (PS), yearling muscling (MS) and scrotal circumference (PE). Genetic gain per generation (ΔG) was evaluated using nine different SI, the current IDG and eight alternatives that included RES in the IDG with 10%, 50% or 100% relative weight, using traditional (EBV) or genomic (GEBV) breeding values. For selection with selective genotyping, seven strategies were considered with relative weight in CARR 0%, 50% or 100% using EBV or GEBV, selecting and genotyping all or part of animals weaning and yearling. Accuracy of GEBV (rMG) ranged from 0.1 to 0.9. Changes in the accuracy of the IS ( IH R )changing rMG were higher for scenarios involving GEBV with all the traits in the index (0.16 to 0.96), compared to scenarios where only CARR was considered to GEBV (0.37 to 0.82). Counting ticks and using EBV to select for RES would result in the same ΔG of a GEBV with rMG=0.44, but animal would have to be exposed to parasite to obtain the phenotypic information. On the other hand, use of GEBV for RES with rMG ≥ 0.5 would result in higher values for IH R ranging from 0.50 to 0.93, without the risks of parasitism. Total gains increased and the differences from baseline were expanded when the relative weight by CARR was 50%. Higher differences were observed between the control scenario and the scenario using EBV with 100% weight for CARR, when compared to the control and the scenarios with 10 and 50% containing only EBV. Due to the low correlation with other traits of IDG, the substantial genetic progress for CARR would only be achieved when the main focus of selection, 50% CARR GEBV (ΔG = 37.40) or all traits with GEBV (ΔG = 42.00 ). The selection without genotyping of the animals, the return on genetic gain (RG) is greater (RG = 0.004) with lower cost (R $ 221.00 reais) genotyping that all animals (RG = 0.001 and cost R$ 694, 00 reais) to increase a genetic standard deviation. In the study, for selection focused on CARR indexes with GEBV information with 50% weight outperform emphasizing the trait, when the goal is to get animals resistant to parasitism. The selective genotyping, the strategy with greater genetic gain and lower cost to increase a DP and mair return in genetic gain is using 100% weight for genotyping CARR 25% of male yearling.porUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em ZootecniaUFPelBrasilFaculdade de Agronomia Eliseu MacielCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIABovinos de corteBrafordGenotipagem seletivaHerefordSeleção genômicaBeef cattleGenomic selectionSelective genotypingDelineamento de esquemas de seleção genômica para resistência ao carrapato bovinoGenomics inclusion in different scenarios of selection index and selective genotyping for cattle tick resistanceinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://lattes.cnpq.br/3952089156033112http://lattes.cnpq.br/5739317705056424Boligon, Arione Augustihttp://lattes.cnpq.br/5203662694720338Dionello, Nelson José Laurinohttp://lattes.cnpq.br/2694556140624639Cardoso, Fernando FloresReis, Ândrea Plotzkiinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELTEXTDissertacao_ANDREA PLOTZKI REIS.pdf.txtDissertacao_ANDREA PLOTZKI REIS.pdf.txtExtracted texttext/plain137027http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8859/6/Dissertacao_ANDREA%20PLOTZKI%20REIS.pdf.txt68f2c86586876eb081d44d8eebb48e79MD56open accessTHUMBNAILDissertacao_ANDREA PLOTZKI REIS.pdf.jpgDissertacao_ANDREA PLOTZKI REIS.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1258http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8859/7/Dissertacao_ANDREA%20PLOTZKI%20REIS.pdf.jpgd1a1762b897066878b57518927b196abMD57open accessORIGINALDissertacao_ANDREA PLOTZKI REIS.pdfDissertacao_ANDREA PLOTZKI REIS.pdfapplication/pdf1284675http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8859/1/Dissertacao_ANDREA%20PLOTZKI%20REIS.pdfd635a7d98e9eb1169638769ba709927cMD51open accessCC-LICENSElicense_urllicense_urltext/plain; charset=utf-849http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8859/2/license_url924993ce0b3ba389f79f32a1b2735415MD52open accesslicense_textlicense_texttext/html; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8859/3/license_textd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD53open accesslicense_rdflicense_rdfapplication/rdf+xml; charset=utf-80http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8859/4/license_rdfd41d8cd98f00b204e9800998ecf8427eMD54open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-867http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/8859/5/license.txtfbd6c74465857056e3ca572d7586661bMD55open accessprefix/88592023-07-13 04:01:20.661open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/8859VG9kb3Mgb3MgaXRlbnMgZGVzc2EgY29tdW5pZGFkZSBzZWd1ZW0gYSBsaWNlbsOnYSBDcmVhdGl2ZSBDb21tb25zLg==Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2023-07-13T07:01:20Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false |
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