Conhecendo a população de Bemisia tabaci do Rio Grande do Sul e o primeiro relato da ocorrência de Tomato severe rugose virus (ToSRV) em pepino

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Neves, Carolina Garcia
Data de Publicação: 2017
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca
Texto Completo: http://guaiaca.ufpel.edu.br/handle/prefix/4656
Resumo: Nos últimos 20, a emergência de doenças causadas por begomovírus vem ocasionando sérios problemas em uma variedade de culturas hortícolas em várias partes do mundo. Além de fatores climáticos e mudanças nos modos de cultivo, a emergência desses vírus está relacionada com o aumento e a prevalência do inseto vetor, mosca branca (Bemisia tabaci). O objetivo desse trabalho foi conhecer a população de B. tabaci do Rio Grande do Sul e caracterizar molecularmente um isolado de begomovírus associado ao pepino. Para conhecer a população de B. tabaci, foram realizadas coletas em várias regiões do estado. A extração de DNA total foi feita individualmente para cada adulto coletado, após foi realizada a PCR para identificação da espécie de mosca branca. Para os 51 indivíduos que apresentaram resultado positivo para B. tabaci foi realizada a digestão com a enzima de restrição TaqI, a fim de identificar as espécies do complexo B. tabaci. Foram encontradas três espécies pertencentes a esse complexo: Middle East-Asia Minor 1 (MEAM1), New World (NW) e Mediterranean (MED). A espécie predominante foi a MEAM1 encontrada nas cidades de Bom Princípio, Caxias do Sul e Feliz, seguida da espécie NW encontrada em Cruzeiro do Sul e Lajeado. A espécie MED ocorreu em menor percentagem que as outras e foi encontrada nas cidades de Barra do Quaraí, Bom Princípio e Feliz. Para a caracterização molecular do begomovírus associado ao pepino, foram coletadas plantas onde as moscas brancas eram encontradas. Foi realizada a extração de DNA total de 35 amostras de plantas e submetidas à amplificação por PCR. Das 35 amostras apenas 7 apresentaram resultado positivo para begomovírus. As amostras que apresentaram resultado positivo foram utilizadas na amplificação por RCA e digeridas com enzimas de restrição. Para a clonagem, apenas a amostra de pepino foi utilizada. Após o sequenciamento foi verificada a presença de Tomato severe rugose virus (ToSRV). Este é o primeiro relato de ToSRV infectando pepino.
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Para conhecer a população de B. tabaci, foram realizadas coletas em várias regiões do estado. A extração de DNA total foi feita individualmente para cada adulto coletado, após foi realizada a PCR para identificação da espécie de mosca branca. Para os 51 indivíduos que apresentaram resultado positivo para B. tabaci foi realizada a digestão com a enzima de restrição TaqI, a fim de identificar as espécies do complexo B. tabaci. Foram encontradas três espécies pertencentes a esse complexo: Middle East-Asia Minor 1 (MEAM1), New World (NW) e Mediterranean (MED). A espécie predominante foi a MEAM1 encontrada nas cidades de Bom Princípio, Caxias do Sul e Feliz, seguida da espécie NW encontrada em Cruzeiro do Sul e Lajeado. A espécie MED ocorreu em menor percentagem que as outras e foi encontrada nas cidades de Barra do Quaraí, Bom Princípio e Feliz. Para a caracterização molecular do begomovírus associado ao pepino, foram coletadas plantas onde as moscas brancas eram encontradas. Foi realizada a extração de DNA total de 35 amostras de plantas e submetidas à amplificação por PCR. Das 35 amostras apenas 7 apresentaram resultado positivo para begomovírus. As amostras que apresentaram resultado positivo foram utilizadas na amplificação por RCA e digeridas com enzimas de restrição. Para a clonagem, apenas a amostra de pepino foi utilizada. Após o sequenciamento foi verificada a presença de Tomato severe rugose virus (ToSRV). Este é o primeiro relato de ToSRV infectando pepino.Over the past 20 years, the emergence of diseases caused by begomoviruses has been causing serious problems in a variety of horticultural crops in various parts of the world. In addition to climatic factors and changes in cultivation modes, the emergence of these viruses is related to the increase and prevalence of insect vector, whitefly (Bemisia tabaci). The aim of this work was to know the population of B. tabaci of Rio Grande do Sul and molecularly characterize a begomovirus isolate associated with cucumber. In order to know the population of B. tabaci, collections were realized in several regions of the state. The total DNA extraction was realized individually for each adult collected, after the PCR was performed to identify the whitefly species. For the 51 individuals who had positive results for B. tabaci was realized digestion with the restriction enzyme TaqI, in order to identify the species of the complex B. tabaci. Three species belonging to this complex were found: Middle East-Asia Minor 1 (MEAM1), New World (NW) and Mediterranean (MED). The predominant species was MEAM1 found in the cities of Bom Princípio, Caxias do Sul and Feliz, followed by NW species found in Cruzeiro do Sul and Lajeado. For the molecular characterization of begomovirus associated with cucumber, plants were collected where the white flies were found. Total DNA extraction from 35 plant samples was performed and submitted to PCR. Of 35 samples, only 7 presented showed positive results for begomovirus. Samples that showed a positive result were used in amplification by RCA and digested with restriction enzymes. For cloning, only the cucumber sample was used. After the sequence analysis the presence of Tomato severe rugose virus (ToSRV) was verified. This is the first report of ToSRV infecting cucumber.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESporUniversidade Federal de PelotasPrograma de Pós-Graduação em FitossanidadeUFPelBrasilFaculdade de Agronomia Eliseu MacielCNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIAMosca brancaMEDBegomovirus - caracterizaçãoWhiteflyCucumis sativusConhecendo a população de Bemisia tabaci do Rio Grande do Sul e o primeiro relato da ocorrência de Tomato severe rugose virus (ToSRV) em pepinoKnowing the population of Bemisia tabaci of Rio Grande do Sul and the first report of the occurrence of Tomato severe rugose virus (ToSRV) in cucumberinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesishttp://lattes.cnpq.br/5917436331410328http://lattes.cnpq.br/2475361685792241Souza Júnior, Ismail Teodoro dehttp://lattes.cnpq.br/5835311752212225Barros, Danielle Ribeiro deNeves, Carolina Garciainfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFPel - Guaiacainstname:Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)instacron:UFPELTEXTDissertação_Carolina Garcia Neves.pdf.txtDissertação_Carolina Garcia Neves.pdf.txtExtracted texttext/plain107700http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/4656/3/Disserta%c3%a7%c3%a3o_Carolina%20Garcia%20Neves.pdf.txtd09390099a0e141d1b009437aa7c0b1aMD53open accessTHUMBNAILDissertação_Carolina Garcia Neves.pdf.jpgDissertação_Carolina Garcia Neves.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1226http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/4656/4/Disserta%c3%a7%c3%a3o_Carolina%20Garcia%20Neves.pdf.jpg3473414e31c0f1f897224a544796de18MD54open accessORIGINALDissertação_Carolina Garcia Neves.pdfDissertação_Carolina Garcia Neves.pdfapplication/pdf1173474http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/4656/1/Disserta%c3%a7%c3%a3o_Carolina%20Garcia%20Neves.pdf73a0bbc73790fbf544ff046be10b7c3cMD51open accessLICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-867http://guaiaca.ufpel.edu.br/xmlui/bitstream/prefix/4656/2/license.txtfbd6c74465857056e3ca572d7586661bMD52open accessprefix/46562023-07-13 03:44:10.135open accessoai:guaiaca.ufpel.edu.br:prefix/4656VG9kb3Mgb3MgaXRlbnMgZGVzc2EgY29tdW5pZGFkZSBzZWd1ZW0gYSBsaWNlbsOnYSBDcmVhdGl2ZSBDb21tb25zLg==Repositório InstitucionalPUBhttp://repositorio.ufpel.edu.br/oai/requestrippel@ufpel.edu.br || repositorio@ufpel.edu.br || aline.batista@ufpel.edu.bropendoar:2023-07-13T06:44:10Repositório Institucional da UFPel - Guaiaca - Universidade Federal de Pelotas (UFPEL)false
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