Fungos endofíticos de Aristolochia triangularis (cipó-mil-homens) com potencial no controle biológico das doenças do morangueiro
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Data de Publicação: | 2017 |
Tipo de documento: | Dissertação |
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Texto Completo: | https://hdl.handle.net/1884/60650 |
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Stuart, Andressa Katiski da CostaStuart, Rodrigo MakowieckyUniversidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Microbiologia, Parasitologia e PatologiaPimentel, Ida Chapaval2019-05-09T11:22:39Z2019-05-09T11:22:39Z2017https://hdl.handle.net/1884/60650Orientadora : Profª Drª Ida Chapaval PimentelCoorientadora : Profª Drª Rodrigo Makowiecky StuartDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ciencias Biológicas (Microbiologia, Parasitologia e Patologia Básica). Defesa: Curitiba, 22/02/2017Inclui referências : f. 55-74Resumo: A cultura do morango é uma das mais importantes ao redor do mundo, tanto por sua relevância econômica como pela geração de empregos. Os frutos desta cultura são muito sensíveis, tornando comum o aparecimento de fungos fitopatogênico na pré e pós-colheita. Dois dos principais fungos fitopatogênicos que assolam esta cultura são o Botrytis cinerea (Pers.), causador do mofo cinzento e o Rhizopus stolonifer (Ehrenb.), causador da podridão do Rhizopus. Por serem doenças de fácil disseminação e difícil controle, acabam gerando a aplicação indiscriminada de agroquímicos, que causam danos ao bioma onde são aplicados e problemas à saúde do consumidor, tornando necessária a utilização de metodologias alternativas para controle destes patógenos, como o controle biológico. Um dos principais agentes de biocontrole são os fungos endofíticos, que apresentam imenso potencial para produzir metabólitos secundários, similares ou iguais à sua planta hospedeira, e quando isolados de plantas medicinais podem demonstrar diversas aplicações na indústria e medicina. A planta Aristolochia triangularis é amplamente utilizada na medicina popular como antiinflamatória, antimicrobiana, antimicobacteriana, dentre outras aplicações. Neste trabalho, buscamos isolar fungos endofíticos de A. triangularis e testar o potencial dos isolados em promover o controle biológico de B. cinerea e R. stolonifer e sua capacidade de produzir metabólitos secundários bioativos. Este é o primeiro relato de fungos endofíticos desta planta, o que torna este trabalho inédito neste contexto. Foram 263 fungos isolados do cipó, caule, fruto, folhas jovens e folhas maduras. A técnica de ARDRA foi realizada buscando um agrupamento molecular dos isolados, para tal foram utilizadas as enzimas de restrição Mbo I e Hae III. Um total de 26 padrões de haplótipos diferentes foram gerados, demonstrando grande diversidade molecular. 10% dos fungos de cada haplótipo, 50 no total, foram aleatoriamente selecionados e submetidos à sequenciamento do gene ITS. Foi detectada similaridade com os gêneros Colletotrichum, Fusarium, Xylaria, Trichoderma, Nectria, Phomopsis, Stenocarpella, Phylosticta, Ascochyta, Neurospora, Yarrowia, Gibberela e Botryosphaeria. O cálculo do índice de Shannon foi baseado no número de gêneros presentes em cada parte da planta. O cipó demonstrou maior diversidade (H': 1.4402), seguido pelo fruto (H': 1.0035), caule (H': 0.7889), folhas maduras (H': 0.2378) e folhas jovens (H': 0.2074). Após identificação dos gêneros e para avaliar seu potencial no biocontrole de B. cinerea e R. stolonifer, os 50 fungos sequenciados foram submetidos ao teste de cultura pareada. Destes, 13 isolados, pertencentes aos gêneros Trichoderma, Colletotrichum, Botryosphaeria, Stenocarpella, Nectria, Phomopsis e Gibberella, controlaram o crescimento de B. cinerea e 7 isolados, pertencentes aos gêneros Trichoderma, Botryosphaeria, Nectria, Phomopsis e Gibberella, controlaram o crescimento de R. stolonifer. Isto demonstra que os fungos isolados de A. triangularis são capazes de promover o antagonismo destes patógenos in vitro. Os 263 isolados foram submetidos à PCR para avaliação da presença do gene PKS I, que está intimamente relacionado à produção de metabólitos secundários bioativos em microrganismos. Sessenta e seis apresentaram a presença do gene e destes, seis promoveram o biocontrole in vitro de B. cinerea e R. stolonifer, podendo o biocontrole visualizado estar relacionado à produção de metabólitos secundários. Palavras-chave: Biocontrole. Endófitos. ARDRA. PKS I. Metabólitos secundários. Fragaria x ananassa Duchesne. Botrytis cinerea. Rhizopus stolonifer.Abstract: The strawberry culture is one of the most important cultures around the world. Its fruit is sensitive and susceptible to several pre- and post-harvest fungal diseases. Grey mold, caused by Botrytis cinerea (Pers.), and Rhizopus rot, caused by Rhizopus stolonifer (Ehreb.), are the most important strawberry diseases, due to their easy spread and difficult control. These and other factors lead to indiscriminate agrochemical applications, causing negative environmental impacts and health damage. Thus, alternative methods to control these pathogens are required, as biological control, which is based on using an organism to control the population density of another organism. One of the most representative group of biocontrol agents is the group of endophytic fungi. These organisms are capable to produce several bioactive metabolites and metabolites that are similar to those produced by their hosts. Therefore, the isolation of endophytic fungi from medicinal plants is an excellent strategy to find those fungi that are producers of bioactive metabolites. In this work, we evaluate the presence of endophytic fungi in the medicinal plant Aristolochia triangularis. This plant posses antiinflamatory, antimicrobial, antimycobacterium activities, among others. This is the first report of endophytic fungi isolated from A. triangularis. The total of 263 endophytes were isolated from fruit, vine, stem, young and mature leaves. These isolates were submitted to ARDRA technique, using Mbo I and Hae III restriction enzymes, to form groups based on genotypes differences. A total of 26 haplotypes were identified and 10% of the isolates of each haplotype, 50 in total, were selected for ITS sequencing. We found similarity with Colletotrichum, Fusarium, Xylaria, Trichoderma, Nectria, Phomopsis, Stenocarpella, Phylosticta, Ascochyta, Neurospora, Yarrowia, Gibberella and Botryosphaeria genus. Shennon diversity index was based on sequencing analysis and showed greater diversity on vine (H': 1.4402), followed by fruit (H': 1.0035), stem (H': 0.7889), mature leaves (H': 0.2378) and young leaves (H': 0.2074). After identification, we proceded the antagonism test in order to evaluate the capability of those 50 endophytes to promote the biological control of B. cinerea and R. stolonifer. Thirteen isolates distributed on Trichoderma, Colletotrichum, Botryosphaeria, Stenocarpella, Nectria, Phomopsis and Gibberella genus, showed activity against B. cinerea. Seven isolates distributed on Trichoderma, Botryosphaeria, Nectria, Phomopsis and Gibgerella genus showed activity against R. stolonifer. These data show that endophytic fungi isolated from A. triangularis are capable of promoting the biological control of these strawberry pathogens. All the 263 isolates were tested for the presence of PKS I gene, wich is related to the biochemical pathway responsible for producing bioactive compounds in fungi. Of these, 66 showed the presence of PKS I gene, and 6 were related to those that promoted in vitro biocontrol of strawberry diseases. The presence of PKS I gene, indicated that these isolates may produce several bioactive compounds that could be related to the biological control observed. Key-words: Biocontrol. Endophytes. ARDRA. PKS I. Secondary metabolites. Fragaria x ananassa Duchesne. Botrytis cinerea. Rhizopus stolonifer.68 f. : il. algumas color., grafs., tabs.application/pdfDisponível em formato digitalMicrobiologiaParasitologiaEndófitosMetabólitos secundáriosMorangoFungos endofíticos de Aristolochia triangularis (cipó-mil-homens) com potencial no controle biológico das doenças do morangueiroinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - D - ANDRESSA KATISKI DA COSTA STUART.pdfapplication/pdf3364954https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/60650/1/R%20-%20D%20-%20ANDRESSA%20KATISKI%20DA%20COSTA%20STUART.pdf29da872275a6001df481beca6a7ecb55MD51open access1884/606502019-05-09 08:22:39.442open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/60650Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082019-05-09T11:22:39Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false |
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