Validação da expressão de miRNAs circulantes em soro de pacientes com demências neurodegenerativas
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Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFPR |
Texto Completo: | https://hdl.handle.net/1884/62176 |
Resumo: | Orientador: Prof. Dr. Ricardo L. R. de Souza |
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Signorini-Souza, Isadora de Lourdes, 1992-Batistela, Meire Silva, 1986-Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em GenéticaSouza, Ricardo Lehtonen Rodrigues de, 1970-2019-09-30T18:18:12Z2019-09-30T18:18:12Z2019https://hdl.handle.net/1884/62176Orientador: Prof. Dr. Ricardo L. R. de SouzaCoorientadora: Dra. Meire Silva BatistelaDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa : Curitiba, 25/03/2019Inclui referências: p. 58-68Resumo: A Doença de Alzheimer (DA), Doença de Parkinson com Demência (PDD) e Demência dos Corpos de Lewy (LBD) são patologias neurodegenerativas causadas pelo acúmulo cerebral de proteínas tóxicas. Os miRNAs são pequenos RNAs não-codificadores que regulam a expressão gênica pós-transcricional, também envolvidos em doenças neurodegenerativas. Em um estudo anterior do nosso grupo, usando sequenciamento de nova geração, encontramos 278 miRNAs no soro cuja expressão diferiu entre essas três demências. O presente estudo teve como objetivo validar as diferenças observadas anteriormente por meio de amplificação quantitativa com sondas de hidrólise (tempo real) a partir de RNA retrotranscrito de DNA (RT-qPCR). Para este fim, a expressão dos miR-125a-5p, miR-30d- 5p e miR-342-3p foi avaliada no soro de 17 amostras de idosos sem demência, 40 pacientes com DA, 7 com LBD e 10 com PDD, comparado à expressão de miR-16, como controle endógeno. O miR-125a-5p foi 2,7 vezes mais expresso no soro de pacientes com DA em comparação com controles idosos (p = 9.217e-05). Este microRNA apresenta uma boa opção de biomarcador para DA, com um valor de 0,82 (IC 95% = 0,71-0,92) para a área sob a curva ROC. Bases de dados como microrna.org permitiram a identificação de possíveis genes alvos para o miR-125a-5p (ERBB2, ERBB3, ARID3B, TP53, VEGFA e BAK1), cujos produtos desempenham um papel importante na regulação da homeostase do sistema nervoso central. Palavras Chaves: Doença de Alzheimer; Doença de Parkinson com Demência; Demência com Corpos de Lewy; biomarcadores; miRNA circulante; analises in silico.Abstract: The Alzheimer's Disease (AD), Parkinson's Disease with Dementia (PDD) and Lewy Bodies Dementia (LBD) are neurodegenerative pathologies caused by brain accumulation of toxic proteins. miRNAs are small non-coding RNAs that regulate post-transcriptional gene expression, also involved in neurodegenerative diseases. In a previous study of our group, using next generation sequencing, we found 278 miRNAs in serum whose expression differed among these three dementias. The present study aimed to validate the previously observed differences by means of quantitative amplification with hydrolysis probes (real time) from DNA retrotranscribed RNA (RT-qPCR). To this end, the expression of miR-125a-5p, miR-30d-5p and miR-342-3p was evaluated in serum of 17 samples from elderly subjects without dementia, 40 patients with AD, 7 with LBD and 10 with PDD , compared to miR-16 expression, as endogenous control. Results: MiR-125a-5p was 2.7-fold more expressed in serum of patients with AD, compared to elderly controls (p = 9,217e-05). This microRNA presents a good biomarker option for AD, with a value of 0.82 (95%CI=0.71-0.92) for the area under the ROC curve. Databases as Microrna.org allowed the identification of possible target genes for miR-125a-5p (ERBB2, ERBB3, ARID3B, TP53, VEGFA and BAK1), whose products play an important role in the regulation of homeostasis of the nervous system. Keywords: Alzheimer's disease; Parkinson's Disease with Dementia; Dementia with Lewy Bodies; biomarkers; circulating miRNA; analyzes in silico.77 p. : il. (algumas color.).application/pdfAlzheimer, Doença deParkinson, Doença deBiomarcadoresMicroRNAsDoenças NeurodegenerativasGenéticaValidação da expressão de miRNAs circulantes em soro de pacientes com demências neurodegenerativasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - D - ISADORA DE LOURDES SIGNORINI SOUZA.pdfapplication/pdf5706541https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/62176/1/R%20-%20D%20-%20ISADORA%20DE%20LOURDES%20SIGNORINI%20SOUZA.pdf25989e593db3042773dba28d54101431MD51open access1884/621762019-09-30 15:18:12.557open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/62176Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082019-09-30T18:18:12Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false |
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