Isolamento de clones com atividade lipolítica do metagenoma de solo contaminado com gordura animal e caracterização de uma nova e eficiente lipase
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2012 |
Tipo de documento: | Tese |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFPR |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/1884/26525 |
Resumo: | Resumo: Um gene de uma nova lipase foi identificado a partir de uma biblioteca metagenomica de 500.000 clones construida com a fracao majoritariamente procariotica do DNA de um solo contaminado com gordura animal, proveniente de uma estacao de tratamento de efluentes. Na triagem inicial feita em agar contendo 1% de tributirina, 2661 dos 500.000 clones da biblioteca metagenomica apresentaram atividade. Destes, 127 apresentaram atividade em agar contendo 1% de tricaprilina, enquanto que 32 se mostraram produtores de lipases verdadeiras pela triagem em agar contendo 1% de trioleina. O clone com o maior halo de hidrolise foi caracterizado. O gene da lipase apresentou 72% de identidade com as lipases putativas CBY26912 de Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 e YE1842 da Yersinia enterocolitica subsp. Enterocolitica 8081. A lipase, denominada LipC12, apresenta uma cadeia polipeptidica de 293 aminoacidos e massa molecular de 31,2 KDa. A analise da sequencia de LipC12 revelou que ela pertence a familia I.1 das lipases bacterianas e que possui um sitio de ligacao ao ion Ca2+ formado pelos residuos Asp217 e Asp262. Este ion foi essencial para a atividade catalitica. Uma vez que LipC12 apresenta somente uma isteina em sua estrutura (Cys89), ela nao apresenta pontes dissulfeto intramoleculares. Atraves de um modelo tri-dimensional gerado por modelagem molecular, foi possivel identificar o dobramento ƒ¿/ƒÀ das hidrolases, o sitio de ligacao ao calcio e a presenca da tampa hidrofobica (lid) encobrindo o sitio catalitico. Apos clonagem no vetor pET28a(+), a enzima foi superexpressa em E. coli BL21(DE3), purificada por cromatografia de afinidade em coluna de niquel e sua identidade foi confirmada por MALDI-TOF/MS. Analises de estabilidade e atividade lipolitica foram efetuadas atraves dos metodos espectrometricos e itulometricos empregando esteres de p-nitrofenol e triacilglicerois, como substratos, respectivamente. Ensaios de estabilidade termica, dicroismo circular e fluorescencia total demonstraram que o ion calcio exerce acao protetora contra desnaturacao e agregacao da enzima. LipC12 e estavel em concentracoes de ate 3,7M de NaCl e entre 20 e 50 ‹C, com maxima atividade a 30 ‹C em 1 h de incubacao. A enzima purificada tem atividade especifica de 1722 U/mg e 1767 U/mg contra oleo de oliva e gordura de porco, respectivamente. E estavel na faixa de pH de 6 a 11 e tem atividade entre os pHs 4,5 e 10, com elevada atividade em pHs alcalinos. Alem disso, e altamente estavel em solventes organicos nas concentracoes de 15 e 30% (v/v). Essas caracteristicas sugerem que esta lipase tem potencial para ter um bom esempenho em processos biocataliticos, como reacoes de hidrolise e sintese envolvendo triacilglicerois e esteres de acido graxo de cadeia longa. |
id |
UFPR_2deb59f555ff7610d4476d465bd258b5 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:acervodigital.ufpr.br:1884/26525 |
network_acronym_str |
UFPR |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFPR |
repository_id_str |
308 |
spelling |
Glogauer, ArnaldoUniversidade Federal do Paraná. Setor de Ciencias Biológicas. Programa de Pós-Graduaçao em BioquímicaKrieger, Nadia, 1952-Pedrosa, Fábio de Oliveira, 1947-2012-01-17T09:06:14Z2012-01-17T09:06:14Z2012-01-17http://hdl.handle.net/1884/26525Resumo: Um gene de uma nova lipase foi identificado a partir de uma biblioteca metagenomica de 500.000 clones construida com a fracao majoritariamente procariotica do DNA de um solo contaminado com gordura animal, proveniente de uma estacao de tratamento de efluentes. Na triagem inicial feita em agar contendo 1% de tributirina, 2661 dos 500.000 clones da biblioteca metagenomica apresentaram atividade. Destes, 127 apresentaram atividade em agar contendo 1% de tricaprilina, enquanto que 32 se mostraram produtores de lipases verdadeiras pela triagem em agar contendo 1% de trioleina. O clone com o maior halo de hidrolise foi caracterizado. O gene da lipase apresentou 72% de identidade com as lipases putativas CBY26912 de Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 e YE1842 da Yersinia enterocolitica subsp. Enterocolitica 8081. A lipase, denominada LipC12, apresenta uma cadeia polipeptidica de 293 aminoacidos e massa molecular de 31,2 KDa. A analise da sequencia de LipC12 revelou que ela pertence a familia I.1 das lipases bacterianas e que possui um sitio de ligacao ao ion Ca2+ formado pelos residuos Asp217 e Asp262. Este ion foi essencial para a atividade catalitica. Uma vez que LipC12 apresenta somente uma isteina em sua estrutura (Cys89), ela nao apresenta pontes dissulfeto intramoleculares. Atraves de um modelo tri-dimensional gerado por modelagem molecular, foi possivel identificar o dobramento ƒ¿/ƒÀ das hidrolases, o sitio de ligacao ao calcio e a presenca da tampa hidrofobica (lid) encobrindo o sitio catalitico. Apos clonagem no vetor pET28a(+), a enzima foi superexpressa em E. coli BL21(DE3), purificada por cromatografia de afinidade em coluna de niquel e sua identidade foi confirmada por MALDI-TOF/MS. Analises de estabilidade e atividade lipolitica foram efetuadas atraves dos metodos espectrometricos e itulometricos empregando esteres de p-nitrofenol e triacilglicerois, como substratos, respectivamente. Ensaios de estabilidade termica, dicroismo circular e fluorescencia total demonstraram que o ion calcio exerce acao protetora contra desnaturacao e agregacao da enzima. LipC12 e estavel em concentracoes de ate 3,7M de NaCl e entre 20 e 50 ‹C, com maxima atividade a 30 ‹C em 1 h de incubacao. A enzima purificada tem atividade especifica de 1722 U/mg e 1767 U/mg contra oleo de oliva e gordura de porco, respectivamente. E estavel na faixa de pH de 6 a 11 e tem atividade entre os pHs 4,5 e 10, com elevada atividade em pHs alcalinos. Alem disso, e altamente estavel em solventes organicos nas concentracoes de 15 e 30% (v/v). Essas caracteristicas sugerem que esta lipase tem potencial para ter um bom esempenho em processos biocataliticos, como reacoes de hidrolise e sintese envolvendo triacilglicerois e esteres de acido graxo de cadeia longa.application/pdfTesesLipaseEnzimasEsterasesIsolamento de clones com atividade lipolítica do metagenoma de solo contaminado com gordura animal e caracterização de uma nova e eficiente lipaseinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALTese Arnaldo Glogauer 2011.pdfapplication/pdf15622352https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/26525/1/Tese%20Arnaldo%20Glogauer%202011.pdf86de87dd4b4017c9e2e037abb6f08bfbMD51open accessTEXTTese Arnaldo Glogauer 2011.pdf.txtTese Arnaldo Glogauer 2011.pdf.txtExtracted Texttext/plain173241https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/26525/2/Tese%20Arnaldo%20Glogauer%202011.pdf.txt5f72d61d19f672e09090db260e2e829aMD52open accessTHUMBNAILTese Arnaldo Glogauer 2011.pdf.jpgTese Arnaldo Glogauer 2011.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1174https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/26525/3/Tese%20Arnaldo%20Glogauer%202011.pdf.jpg725031445b000a6e8e033cb3c17ffc4cMD53open access1884/265252016-04-07 03:26:45.385open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/26525Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082016-04-07T06:26:45Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Isolamento de clones com atividade lipolítica do metagenoma de solo contaminado com gordura animal e caracterização de uma nova e eficiente lipase |
title |
Isolamento de clones com atividade lipolítica do metagenoma de solo contaminado com gordura animal e caracterização de uma nova e eficiente lipase |
spellingShingle |
Isolamento de clones com atividade lipolítica do metagenoma de solo contaminado com gordura animal e caracterização de uma nova e eficiente lipase Glogauer, Arnaldo Teses Lipase Enzimas Esterases |
title_short |
Isolamento de clones com atividade lipolítica do metagenoma de solo contaminado com gordura animal e caracterização de uma nova e eficiente lipase |
title_full |
Isolamento de clones com atividade lipolítica do metagenoma de solo contaminado com gordura animal e caracterização de uma nova e eficiente lipase |
title_fullStr |
Isolamento de clones com atividade lipolítica do metagenoma de solo contaminado com gordura animal e caracterização de uma nova e eficiente lipase |
title_full_unstemmed |
Isolamento de clones com atividade lipolítica do metagenoma de solo contaminado com gordura animal e caracterização de uma nova e eficiente lipase |
title_sort |
Isolamento de clones com atividade lipolítica do metagenoma de solo contaminado com gordura animal e caracterização de uma nova e eficiente lipase |
author |
Glogauer, Arnaldo |
author_facet |
Glogauer, Arnaldo |
author_role |
author |
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv |
Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciencias Biológicas. Programa de Pós-Graduaçao em Bioquímica Krieger, Nadia, 1952- Pedrosa, Fábio de Oliveira, 1947- |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Glogauer, Arnaldo |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Teses Lipase Enzimas Esterases |
topic |
Teses Lipase Enzimas Esterases |
description |
Resumo: Um gene de uma nova lipase foi identificado a partir de uma biblioteca metagenomica de 500.000 clones construida com a fracao majoritariamente procariotica do DNA de um solo contaminado com gordura animal, proveniente de uma estacao de tratamento de efluentes. Na triagem inicial feita em agar contendo 1% de tributirina, 2661 dos 500.000 clones da biblioteca metagenomica apresentaram atividade. Destes, 127 apresentaram atividade em agar contendo 1% de tricaprilina, enquanto que 32 se mostraram produtores de lipases verdadeiras pela triagem em agar contendo 1% de trioleina. O clone com o maior halo de hidrolise foi caracterizado. O gene da lipase apresentou 72% de identidade com as lipases putativas CBY26912 de Yersinia enterocolitica subsp. palearctica Y11 e YE1842 da Yersinia enterocolitica subsp. Enterocolitica 8081. A lipase, denominada LipC12, apresenta uma cadeia polipeptidica de 293 aminoacidos e massa molecular de 31,2 KDa. A analise da sequencia de LipC12 revelou que ela pertence a familia I.1 das lipases bacterianas e que possui um sitio de ligacao ao ion Ca2+ formado pelos residuos Asp217 e Asp262. Este ion foi essencial para a atividade catalitica. Uma vez que LipC12 apresenta somente uma isteina em sua estrutura (Cys89), ela nao apresenta pontes dissulfeto intramoleculares. Atraves de um modelo tri-dimensional gerado por modelagem molecular, foi possivel identificar o dobramento ƒ¿/ƒÀ das hidrolases, o sitio de ligacao ao calcio e a presenca da tampa hidrofobica (lid) encobrindo o sitio catalitico. Apos clonagem no vetor pET28a(+), a enzima foi superexpressa em E. coli BL21(DE3), purificada por cromatografia de afinidade em coluna de niquel e sua identidade foi confirmada por MALDI-TOF/MS. Analises de estabilidade e atividade lipolitica foram efetuadas atraves dos metodos espectrometricos e itulometricos empregando esteres de p-nitrofenol e triacilglicerois, como substratos, respectivamente. Ensaios de estabilidade termica, dicroismo circular e fluorescencia total demonstraram que o ion calcio exerce acao protetora contra desnaturacao e agregacao da enzima. LipC12 e estavel em concentracoes de ate 3,7M de NaCl e entre 20 e 50 ‹C, com maxima atividade a 30 ‹C em 1 h de incubacao. A enzima purificada tem atividade especifica de 1722 U/mg e 1767 U/mg contra oleo de oliva e gordura de porco, respectivamente. E estavel na faixa de pH de 6 a 11 e tem atividade entre os pHs 4,5 e 10, com elevada atividade em pHs alcalinos. Alem disso, e altamente estavel em solventes organicos nas concentracoes de 15 e 30% (v/v). Essas caracteristicas sugerem que esta lipase tem potencial para ter um bom esempenho em processos biocataliticos, como reacoes de hidrolise e sintese envolvendo triacilglicerois e esteres de acido graxo de cadeia longa. |
publishDate |
2012 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2012-01-17T09:06:14Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2012-01-17T09:06:14Z |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2012-01-17 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/doctoralThesis |
format |
doctoralThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/1884/26525 |
url |
http://hdl.handle.net/1884/26525 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFPR instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR) instacron:UFPR |
instname_str |
Universidade Federal do Paraná (UFPR) |
instacron_str |
UFPR |
institution |
UFPR |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFPR |
collection |
Repositório Institucional da UFPR |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/26525/1/Tese%20Arnaldo%20Glogauer%202011.pdf https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/26525/2/Tese%20Arnaldo%20Glogauer%202011.pdf.txt https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/26525/3/Tese%20Arnaldo%20Glogauer%202011.pdf.jpg |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
86de87dd4b4017c9e2e037abb6f08bfb 5f72d61d19f672e09090db260e2e829a 725031445b000a6e8e033cb3c17ffc4c |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 MD5 MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1813898847553847296 |