Citogenética molecular comparativa de tartarugas marinhas da família Cheloniidae (Reptilia, Testudines) : avaliação de variações cromossômicas microestruturais

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Machado, Caroline Regina Dias
Data de Publicação: 2021
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1884/80695
Resumo: Orientador: Prof. Dr. Marcelo Ricardo Vicari
id UFPR_2f4f1191c2a1c9b3162028181aaca42b
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/80695
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str 308
spelling Domit, CamilaPucci, Marcela BaerUniversidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em GenéticaVicari, Marcelo RicardoMachado, Caroline Regina Dias2023-01-10T13:43:39Z2023-01-10T13:43:39Z2021https://hdl.handle.net/1884/80695Orientador: Prof. Dr. Marcelo Ricardo VicariCoorientadoras: Dra. Camila Domit, Prof. Dra. Marcela Baer PucciTese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa : Curitiba, 25/08/2021Inclui referênciasÁrea de concentração: GenéticaResumo: As tartarugas marinhas pertencem à mais antiga linhagem de répteis vivos e são componentes essenciais dos ecossistemas marinhos. São reconhecidas sete linhagens vivas de tartarugas marinhas no mundo, sendo que cinco delas ocorrem no litoral brasileiro, as quais são: Dermochelys coriacea, única representante da família Dermochelydae, e as outras quatro espécies pertencem à família Cheloniidae: Chelonia mydas, Caretta caretta, Eretmochelys imbricata e Lepidochelys olivacea. O processo de hibridização entre espécies de tartarugas marinhas na costa brasileira é atípico, sendo a maior taxa de hibridização entre as espécies no mundo, ocorrendo onde áreas de alimentação e períodos reprodutivos se sobrepõem. A citogenética de tartarugas marinhas vem se mostrando um campo promissor que permanecia até pouco tempo atrás inexplorado, permitindo que inferências evolutivas sejam feitas para o grupo a partir do estudo da microestrutura cariotípica. O estabelecimento da estrutura cariotípica para as espécies e o desenvolvimento de marcadores cromossômicos espécieespecíficos permitem o reconhecimento de cariótipos híbridos e podem ser uma ferramenta auxiliar ao reconhecimento morfológico e molecular de indivíduos híbridos. Sendo assim, esse estudo tem como objetivo ampliar o conhecimento da organização cariotípica das tartarugas marinhas da família Cheloniidae que ocorrem no litoral brasileiro a partir da obtenção e caracterização de marcadores cromossômicos para avaliar variações cromossômicas microestruturais interespecíficas e aplicar esses marcadores no estudo de dois indivíduos híbridos (híbridas A e B). Utilizou-se técnicas baseadas na coloração convencional por Giemsa, bandamentos C e G, e hibridação in situ fluorescente (FISH) com sondas de DNA ribossômico (rDNA) 5S e 18S e microssatélites (CA)n, (GA)n, (CAG)n, (GATA)n, (GAA)n, (CGC)n e (GACA)n para as espécies puras e indivíduos híbridos. Foram realizadas análises morfológicas e moleculares, utilizando genes de DNA mitocondrial (mtDNA) e nuclear (nucDNA), para identificação das espécies envolvidas nos casos de hibridismo. O uso da sonda de rDNA 5S permitiu a identificação do segundo par de macrocromossomos metacêntrico como detentor do sítio de rDNA para as quatro espécies puras e as híbridas A e B, sendo que um sítio adicional em um par de microcromossomos (mc) foi identificado para C. mydas e híbrida A. Os resultados mostram que apenas os microssatélites (CA)n, (GA)n, (CAG)n e (GATA)n são detectados nos cromossomos das espécies puras e híbridas, preferencialmente em regiões heterocromáticas dos mc. Variações na localização da heterocromatina e dos microssatélites corrobora a proposta de reposicionamento de centrômero nas espécies de Cheloniidae. A análise integrada (citogenética, morfológica e molecular) mostra que a híbrida A é um provável híbrido de segunda geração (F2) entre C. caretta x E. imbricata x C. mydas e a híbrida B pode ser resultado de um retrocruzamento entre C. caretta x L. olivacea, porém o conjunto cromossômico dos híbridos continua balanceado. Esses achados são úteis no entendimento da diversificação cariotípica das espécies e podem ser aplicados no estudo de cariótipos híbridos. Futuramente, a hibridização entre tartarugas marinhas no Brasil deve continuar a ser estudada utilizando análises integradas para compreender e determinar as consequências desse fenômeno para os indivíduos híbridos e para as espécies puras, visando estratégias de manejo e conservação.Abstract: Sea turtles belong to the oldest lineage of living reptiles, being an essential part of marine ecosystems. Seven sea turtle living lineages are recognized in the world, five of which occur on the Brazilian coast, they are: Dermochelys coriacea, the only representative of Dermochelydae, and the other four species belong to Cheloniidae: Chelonia mydas, Caretta caretta, Eretmochelys imbricata and Lepidochelys olivacea. Hybridization process among sea turtles species on the Brazilian coast is atypical with the highest rate of hybridization among the species in the world, occurring where feeding and nesting areas overlap. The cytogenetic of sea turtles is proving to be a promising field that remained unexplored until recently, allowing evolutionary inferences to be made for the group from the study of karyotypic microstructure. The establishment of the karyotypic structure for the species and the development of speciesspecific chromosome markers allow hybrids karyotypes recognition and can be an auxiliary tool for morphological and molecular recognition of hybrids individuals. Therefore, this study aims to increase the knowledge of the Cheloniidae sea turtles karyotypic organization that occur on the Brazilian coast by obtaining and characterizing chromosomic markers to evaluate interspecific microstructural chromosomal variations and apply these markers in the study of two hybrid individuals (hybrids A and B). We used techniques such as conventional Giemsa staining, C and G-banding, and fluorescence in situ hybridization (FISH) using 5S and 18S ribosomal DNA (rDNA) and (CA)n, (GA)n, (CAG)n, (GATA)n, (GAA)n, (CGC)n and (GACA)n microsatellites probes for pure and hybrid species. Morphological and molecular analyses were made using mitochondrial (mtDNA) and nuclear (nucDNA) DNA sequences in order to identify the species involved in these cases of hybridism. The 5S rDNA site was identified in the second pair of metacentric macrochromosomes on the four pure species and hybrids A and B, in addition one extra site was identified in a microchromosome (mc) pair on C. mydas and hybrid A. The results show that only (CA)n, (GA)n, (CAG)n and (GATA)n are detected on the chromosomes of pure and hybrid species, preferentially in heterochromatic regions of mc. Variation in the heterochromatin and microsatellites localization corroborates the proposal of centromere repositioning occurrence in Cheloniidae species. The integrated analyses (morphological, molecular, and cytogenetics) shows that hybrid A is probably an F2 hybrid among C. caretta x E. imbricata x C. mydas while hybrid B could be the result of backcross among C. caretta x L. olivacea, however the chromosome sets are still balanced. These findings are useful in understanding the karyotypic diversification of the species and can be applied in hybrid karyotypes studies. In the further, sea turtles hybridization in Brazil should continue to be studied using integrated analyses to comprehend and determine the consequences of this phenomenon for hybrid individuals and for pure species, in order to develop conservation and management strategies.1 recurso online : PDF.application/pdfMorfologia (Animais)CromossomosDNAHibridaçaoMarcadores biologicosMitocondriaTartaruga marinhaGenéticaCitogenética molecular comparativa de tartarugas marinhas da família Cheloniidae (Reptilia, Testudines) : avaliação de variações cromossômicas microestruturaisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - T - CAROLINE REGINA DIAS MACHADO.pdfapplication/pdf6800713https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/80695/1/R%20-%20T%20-%20CAROLINE%20REGINA%20DIAS%20MACHADO.pdf208af2be5876c669aa0f390abde780f0MD51open access1884/806952023-01-10 10:43:39.884open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/80695Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082023-01-10T13:43:39Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Citogenética molecular comparativa de tartarugas marinhas da família Cheloniidae (Reptilia, Testudines) : avaliação de variações cromossômicas microestruturais
title Citogenética molecular comparativa de tartarugas marinhas da família Cheloniidae (Reptilia, Testudines) : avaliação de variações cromossômicas microestruturais
spellingShingle Citogenética molecular comparativa de tartarugas marinhas da família Cheloniidae (Reptilia, Testudines) : avaliação de variações cromossômicas microestruturais
Machado, Caroline Regina Dias
Morfologia (Animais)
Cromossomos
DNA
Hibridaçao
Marcadores biologicos
Mitocondria
Tartaruga marinha
Genética
title_short Citogenética molecular comparativa de tartarugas marinhas da família Cheloniidae (Reptilia, Testudines) : avaliação de variações cromossômicas microestruturais
title_full Citogenética molecular comparativa de tartarugas marinhas da família Cheloniidae (Reptilia, Testudines) : avaliação de variações cromossômicas microestruturais
title_fullStr Citogenética molecular comparativa de tartarugas marinhas da família Cheloniidae (Reptilia, Testudines) : avaliação de variações cromossômicas microestruturais
title_full_unstemmed Citogenética molecular comparativa de tartarugas marinhas da família Cheloniidae (Reptilia, Testudines) : avaliação de variações cromossômicas microestruturais
title_sort Citogenética molecular comparativa de tartarugas marinhas da família Cheloniidae (Reptilia, Testudines) : avaliação de variações cromossômicas microestruturais
author Machado, Caroline Regina Dias
author_facet Machado, Caroline Regina Dias
author_role author
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv Domit, Camila
Pucci, Marcela Baer
Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Genética
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Vicari, Marcelo Ricardo
dc.contributor.author.fl_str_mv Machado, Caroline Regina Dias
contributor_str_mv Vicari, Marcelo Ricardo
dc.subject.por.fl_str_mv Morfologia (Animais)
Cromossomos
DNA
Hibridaçao
Marcadores biologicos
Mitocondria
Tartaruga marinha
Genética
topic Morfologia (Animais)
Cromossomos
DNA
Hibridaçao
Marcadores biologicos
Mitocondria
Tartaruga marinha
Genética
description Orientador: Prof. Dr. Marcelo Ricardo Vicari
publishDate 2021
dc.date.issued.fl_str_mv 2021
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2023-01-10T13:43:39Z
dc.date.available.fl_str_mv 2023-01-10T13:43:39Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/1884/80695
url https://hdl.handle.net/1884/80695
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 1 recurso online : PDF.
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/80695/1/R%20-%20T%20-%20CAROLINE%20REGINA%20DIAS%20MACHADO.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 208af2be5876c669aa0f390abde780f0
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801860418526773248

Registros relacionados