Estudo de associação do polimorfismo RS2910164 no gene MIR146A em pacientes portadoras de carcinoma esporádico de mama
Autor(a) principal: | |
---|---|
Data de Publicação: | 2018 |
Tipo de documento: | Dissertação |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFPR |
Texto Completo: | https://hdl.handle.net/1884/56152 |
Resumo: | Orientadora: Profa. Dra. Enilze Maria de Souza Fonseca Ribeiro |
id |
UFPR_42927c04c7e9f5ec5e3e22fce42f0b84 |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:acervodigital.ufpr.br:1884/56152 |
network_acronym_str |
UFPR |
network_name_str |
Repositório Institucional da UFPR |
repository_id_str |
308 |
spelling |
Brincas, Heloisa MagagninRibeiro, Enilze Maria de Souza Fonseca, 1958-Cavalli, Iglenir JoãoAlmeida, Rodrigo Coutinho deUniversidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Genética2018-12-07T19:40:01Z2018-12-07T19:40:01Z2018https://hdl.handle.net/1884/56152Orientadora: Profa. Dra. Enilze Maria de Souza Fonseca RibeiroCoorientadores: Prof. Dr. Iglenir João Cavalli e Dr. Rodrigo Coutinho de AlmeidaDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa : Curitiba, 29/03/2018Inclui referências: p.70-78Resumo: O câncer de mama é o tipo de câncer mais frequente na população feminina brasileira, sem considerar os tumores de pele não melanoma e mundialmente é considerado a principal causa de morte por câncer entre as mulheres. Tumores têm alterações genéticas que afetam os produtos da expressão gênica e, neste contexto, os microRNAs (miRNAs) desempenham um papel importante no desenvolvimento do câncer, modulando a expressão de oncogenes e genes supressores de tumor. Polimorfismos localizados em genes que codificam miRNAs são capazes de alterar sua interação com o substrato, o RNA mensageiro, interferindo, gerando ou removendo os sítios de ligação dos miRNAs e alterando seu nível de expressão. Essas variantes genéticas podem ser de grande impacto para a biologia pois cada miRNA regula diferencialmente um grande número de alvos. No presente estudo foi avaliado o polimorfismo rs2910164, localizado na região seed do miR-146a, em 326 pacientes portadoras de câncer de mama esporádico e em 411 controles sem histórico de neoplasias, provenientes de uma população brasileira da cidade de Curitiba, PR. Para a genotipagem dos pacientes e controles foi utilizada a técnica de PCRSSP e, para complementar, foram realizadas análises in silico para se acessar dados de expressão do MIR146A no banco de dados de câncer TCGA. A análise da variância e o teste do Qui-Quadrado foram utilizados, respectivamente, na comparação entre as médias das idades e na análise de parâmetros histopatológicos (invasão de linfonodos regionais, grau de diferenciação tumoral e subtipo imunoistoquímico) dentre os diferentes genótipos. O estudo de associação caso-controle indicou presença de associação positiva quando analisados os genótipos CC/GC versus o genótipo GG (OR=1,38 - IC95%=1,03- 1,85). O teste do Qui-Quadrado de homogeneidade também foi utilizado para o teste do modelo dominante do alelo de risco (C) corroborando o resultado do OR com ?²= 4,66 e p<0,05. Nas análises dos parâmetros histopatológicos e de idade, não foram detectadas diferenças estatisticamente significativas. Nas análises in silico observamos uma maior expressão do MIR146A em câncer de mama em relação ao tecido normal, principalmente no subtipo triplo-negativo. Embora a associação do rs2910164 com o câncer de mama já tenha sido estudada anteriormente, este é o primeiro relato em uma amostra de população brasileira. Com base nestes resultados, concluímos que, nesta amostra, a variante alélica C do rs2910164 está positivamente associada com a suscetibilidade ao câncer de mama, mas não influencia na progressão da doença. Palavras-chave: rs2910164; miR-146a; Câncer de mama; População brasileira.Abstract: Breast cancer is the most frequent type of cancer in the Brazilian female population, without taking into account non-melanoma skin cancer and it is considered the leading cause of death by cancer among women worldwide. Tumours have genetic alterations that affect the products of gene expression and, in this context, microRNAs (miRNAs) play an important role in cancer development by modulating the expression of oncogenes and tumour suppressor genes. Polymorphisms located in genes encoding miRNAs are capable of altering their interaction with substrate, messenger RNA, by interfering, generating or removing miRNA binding sites and by altering their expression levels. These genetic variants can be of great impact for biology, since each miRNA differentially regulates a large number of targets. In the present study, the polymorphism rs2910164, located in the seed region of miR-146a, was evaluated in 326 patients with sporadic breast cancer and in 411 controls with no history of neoplasia, from a Brazilian population from Curitiba, PR. For genotyping patients and controls, PCR-SSP technique was used and, in addition, in silico analysis were performed to access the expression levels of miR146A in TCGA datasets. The analysis of variance and the chi-square test were used, respectively, in the comparison between the means of age and the analysis of histopathological parameters (regional lymph node invasion, degree of tumour differentiation and immunohistochemical subtype) among different genotypes. The case-control association study indicated a positive association when we analysed CC/GC genotypes versus GG genotype (OR=1.38, 95%CI=1.03-1.85). The chi-square homogeneity test was also used to test the dominant model of C-risk allele, corroborating the OR result with ?²= 4.66 and p<0.05. In the analysis of histopathological and age parameters, no statistically significant differences were detected. We observed in the in silico analysis a greater expression of MIR146A in breast cancer compared to normal tissue, especially in triple-negative subtype. Even though the association of rs2910164 has already been studied previously, this is the first report in a sample of Brazilian population. Based in these results, we conclude that in this sample, the C allele variant of rs2910164 is positively associated with breast cancer susceptibility, but does not influence the disease progression. Keywords: rs2910164. miR-146a. Breast Cancer. Brazilian Population.83 p. : il. (algumas color.).application/pdfMamas - CancerGenéticaMicroRNAsEstudo de associação do polimorfismo RS2910164 no gene MIR146A em pacientes portadoras de carcinoma esporádico de mamainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - D - HELOISA MAGAGNIN BRINCAS.pdfapplication/pdf3525243https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/56152/1/R%20-%20D%20-%20HELOISA%20MAGAGNIN%20BRINCAS.pdfed147ebf981b916663a558eb78335c8aMD51open access1884/561522018-12-07 17:40:02.03open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/56152Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082018-12-07T19:40:02Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false |
dc.title.pt_BR.fl_str_mv |
Estudo de associação do polimorfismo RS2910164 no gene MIR146A em pacientes portadoras de carcinoma esporádico de mama |
title |
Estudo de associação do polimorfismo RS2910164 no gene MIR146A em pacientes portadoras de carcinoma esporádico de mama |
spellingShingle |
Estudo de associação do polimorfismo RS2910164 no gene MIR146A em pacientes portadoras de carcinoma esporádico de mama Brincas, Heloisa Magagnin Mamas - Cancer Genética MicroRNAs |
title_short |
Estudo de associação do polimorfismo RS2910164 no gene MIR146A em pacientes portadoras de carcinoma esporádico de mama |
title_full |
Estudo de associação do polimorfismo RS2910164 no gene MIR146A em pacientes portadoras de carcinoma esporádico de mama |
title_fullStr |
Estudo de associação do polimorfismo RS2910164 no gene MIR146A em pacientes portadoras de carcinoma esporádico de mama |
title_full_unstemmed |
Estudo de associação do polimorfismo RS2910164 no gene MIR146A em pacientes portadoras de carcinoma esporádico de mama |
title_sort |
Estudo de associação do polimorfismo RS2910164 no gene MIR146A em pacientes portadoras de carcinoma esporádico de mama |
author |
Brincas, Heloisa Magagnin |
author_facet |
Brincas, Heloisa Magagnin |
author_role |
author |
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv |
Ribeiro, Enilze Maria de Souza Fonseca, 1958- Cavalli, Iglenir João Almeida, Rodrigo Coutinho de Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Genética |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Brincas, Heloisa Magagnin |
dc.subject.por.fl_str_mv |
Mamas - Cancer Genética MicroRNAs |
topic |
Mamas - Cancer Genética MicroRNAs |
description |
Orientadora: Profa. Dra. Enilze Maria de Souza Fonseca Ribeiro |
publishDate |
2018 |
dc.date.accessioned.fl_str_mv |
2018-12-07T19:40:01Z |
dc.date.available.fl_str_mv |
2018-12-07T19:40:01Z |
dc.date.issued.fl_str_mv |
2018 |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
dc.type.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/masterThesis |
format |
masterThesis |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
https://hdl.handle.net/1884/56152 |
url |
https://hdl.handle.net/1884/56152 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
83 p. : il. (algumas color.). application/pdf |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositório Institucional da UFPR instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR) instacron:UFPR |
instname_str |
Universidade Federal do Paraná (UFPR) |
instacron_str |
UFPR |
institution |
UFPR |
reponame_str |
Repositório Institucional da UFPR |
collection |
Repositório Institucional da UFPR |
bitstream.url.fl_str_mv |
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/56152/1/R%20-%20D%20-%20HELOISA%20MAGAGNIN%20BRINCAS.pdf |
bitstream.checksum.fl_str_mv |
ed147ebf981b916663a558eb78335c8a |
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv |
MD5 |
repository.name.fl_str_mv |
Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR) |
repository.mail.fl_str_mv |
|
_version_ |
1813898869051752448 |