Análise de microssatélites da regiao MHC em uma amostra de doadores voluntários de medula óssea

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Abuázar, Carolina Sens
Data de Publicação: 2008
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1884/15099
Resumo: Orientadora : Valéria Sperandio Roxo
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spelling Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em GenéticaRoxo, Valeria Maria Munhoz Sperandio, 1958-Abuázar, Carolina Sens2023-06-05T20:02:03Z2023-06-05T20:02:03Z2008https://hdl.handle.net/1884/15099Orientadora : Valéria Sperandio RoxoDissertaçao (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciencias Biológicas, Programa de Pós-Graduaçao em Genética. Defesa: Curitiba, 2008Inclui bibliografia e anexoResumo: Microssatélites são seqüências de DNA com repetições curtas, de 1 a 6 pares de bases, que ocorrem em tandem e estão distribuídas por todo o genoma. Podem apresentar um alto grau de polimorfismo e há grande evidência na literatura de que muitos deles sejam bons marcadores genéticos. Neste trabalho, foram investigados 7 microssatélites da região MHC em uma amostra composta por indivíduos caucasóides da cidade de Curitiba e região metropolitana. Foram descritas as freqüências alélicas, genotípicas e haplotípicas dos microssatélites assim como o desequilíbrio de ligação entre os alelos destes marcadores e os alelos ou grupos alélicos dos genes HLA-B, HLA-DRB1 e HLA-DQB1. Os microssatélites mais polimórficos foram encontrados próximos ao gene HLA-B, na região MHC de classe I, sugerindo uma evolução mais rápida desta região. A comparação com outros estudos populacionais demostrou diferenças nas freqüências alélicas, as quais podem ser devidas ao longo tempo de divergência entre essas populações, juntamente com a ação da deriva genética. Além disso, a comparação entre as freqüências alélicas possibilitou a inferência de fluxo gênico entre populações euro-brasileiras e populações indígenas. Os resultados indicam a existência de desequílibrio de ligação entre alelos de microssatélites e alelos ou grupos alélicos dos genes HLA. O desequilíbrio de ligação foi mais fortemente observado nas proximidades dos genes HLA clássicos. Os resultados deste estudo trazem informações a respeito de haplótipos HLA, podendo ser úteis para a prática laboratorial.Microsatellites are short tandem repeats of 1-6bp DNA fragments, which are found all over the genome. Many of them are highly polymorphic and may be good markers for genetic studies. In this study, we investigated 7 microsatellites of the MHC region in a sample composed of Caucasoid individuals from the region of Curitiba and surrounding districts. Allelic, genotypic and haplotypic frequencies are described as well as the linkage disequilibrium between alleles of these microsatellites and alleles of the HLA genes: HLA-B, HLA-DRB1 and HLA-DQB1. The most polymorphic microsatellites were found close to HLA-B gene, in the MHC class I region, suggesting that this region may be subject to a faster pace of evolution. Comparisons with other population studies showed differences in the allelic frequencies, which may be due to the long time of divergence between these groups, associated with the effect of genetic drift. Moreover, the comparison of the allelic frequencies suggested possible gene flow between Euro-Brazilian populations and Amerindians. Strong linkage disequilibrium was observed between alleles of microsatellites and HLA genes, specially in the vicinity of classic HLA genes. This study contributes with important information on HLA haplotypes, which may be useful in laboratory routine.xii, 95f. : il. color., grafs., tabs.application/pdfDisponível em formato digitalTesesHistocompatibilidadeGeneticaMicrossatélites (Genética)Análise de microssatélites da regiao MHC em uma amostra de doadores voluntários de medula ósseainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALDF carol.pdfapplication/pdf878694https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/15099/1/DF%20carol.pdf82dc77fb9c971e814c638aff01f5551fMD51open accessTEXTDF carol.pdf.txtExtracted Texttext/plain152350https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/15099/2/DF%20carol.pdf.txtf5e2b6b1cb8fcbdc2fde887be3c65966MD52open accessTHUMBNAILDF carol.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1188https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/15099/3/DF%20carol.pdf.jpgc20f31ab4d7386172c5ccc5f8ba4a293MD53open access1884/150992023-06-05 17:02:03.535open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/15099Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082023-06-05T20:02:03Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
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