Inferências filogenéticas do gênero Oxymycterus (Cricetidae:Sigmodontinae) de algumas localidades do Sul do Brasil, com base em sequências de DNA mitocondrial

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Peçanha, Willian Thomaz
Data de Publicação: 2015
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: http://hdl.handle.net/1884/38130
Resumo: Orientador : Prof. Dr. Tales Renato O. de Freitas
id UFPR_94982d6ee6339de1faaef926fddb897b
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/38130
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str 308
spelling Peçanha, Willian ThomazHass, IrisUniversidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em GenéticaFreitas, Thales Renato Ochotorena de2015-07-22T19:04:16Z2015-07-22T19:04:16Z2015http://hdl.handle.net/1884/38130Orientador : Prof. Dr. Tales Renato O. de FreitasCo-orientadora : Profª Drª Iris HassDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba, 27/03/2015Inclui referênciasÁrea de concentraçãoResumo: O gênero Oxymycterus possui uma taxonomia bastante confusa, sendo relativamente mal entendido os reais limites entre as espécies, suas relações filogenéticas, distribuição e história natural. Algumas de suas espécies possuem ampla distribuição geográfica, ocorrendo em mais de uma formação fitofisionômica ou em mesmos biomas, geralmente em simpatria com congêneres de "distribuição restrita". Neste contexto, o presente estudo teve por objetivo investigar a variabilidade haplotípica de gênero Oxymycterus no Brasil Meridional (Estados do PR, SC e RS), através do sequenciamento do gene mitocondrial citocromo b (cyt b) de 181 espécimes, utilizando também sequencias disponíveis em banco de dados públicos (Genbank) como referencia, com o intuito de investigar as potenciais espécies existentes na Região Sul. Apesar de a literatura relatar quatro táxons para o Sul do Brasil, a análise filogenética Bayesiana revelou a existência predominante de duas espécies na região (O. nasutus e O. aff. quaestor) e a inédita extensão de ocorrência de um táxon cuja distribuição na Mata Atlântica restringia-se até então a região Sudeste (O. dasytrichus). A inferência Bayesiana também revelou possíveis erros de informações depositadas em banco de dados, levando a conflitos de identificação de uma amostra entre O. delator e O. amazonicus, e identificando potencialmente uma espécie nova registrada para regiões de Cerrado no Oeste do Estado do Paraná. Ainda de acordo com os resultados obtidos, O. nasutus e o "O. quaestor'' são linhagens com marcada estruturação interna. Oxymycterus nasutus formou clados distintos, dentre eles, dois grupos exclusivos que pertencem ao Planalto Meridional e a Planície Costeira/RS. A linhagem de O. quaestor possui distribuição somente no Planalto Meridional, e também apresentou marcada divisão em dois clados, indicando a possível existência de espécies crípticas dentro deste grupo, cuja divergência genética superou a média interespecífica do gênero (> 6%). Essa informação é forte evidência de uma potencial espécie nova no Sul do Brasil, que ainda necessita revisão de caracteres morfológicos comparativos às demais linhagens próximas para robusta definição. Palavras-Chave: Akodontini, Citocromo b, Filogenia Molecular, SequenciamentoAbstract: Quite confusing taxonomy, being relatively misunderstood over the limits between species, phylogenetic relationships, and the natural history and distribution of the group, some species of Oxymycterus have wide geographical distribution, occurring in more than one phytophysiognomic training or same biomes, usually with sympatric congeners "restricted distribution". In this context, the present study aimed to investigate the haplotype variability Oxymycterus kind in southern Brazil (PR, SC and RS states), by sequencing the mitochondrial cytochrome b gene (cyt b) of 181 specimens, also using sequences available in public database (Genbank) as a reference, in order to investigate the potential species existing in the South. Although the literature report four taxa for the South Brazil, the Bayesian phylogenetic analysis revealed the existence of two predominant species in the region (O. nasutus and O. aff. quaestor) and the unprecedented extent of occurrence of a taxon whose distribution in the Atlantic Forest was restricted so far to Southeast (O. dasytrichus). The Bayesian inference also revealed possible error information deposited in the database, leading conflicts to identifying a sample of between O. delator and O. amazonicus, and potentially identifying a new recorded species to savannah regions in the west of Paraná. Also according to the results obtained, O. nasutus and "O. quaestor'' are markedly lines with internal structure. Oxymycterus nasutus formed distinct clades, including two exclusive groups belonging to the Southern Plateau and the Coastal Plain. The strain of O. quaestor has distribution only in the southern Plateau, and also showed marked division into two clades, indicating the possible existence of cryptic species within this group, whose genetic divergence exceeded interspecific average gender (> 6%). This information is strong evidence of a potential new species in southern Brazil, which still requires review of comparative morphological characters of other lineages to allow robust species definition. Keywords: Akodontini, Cytochrome b, molecular phylogeny, Sequencing.133f. : il., tabs., maps., grafs., algumas color.application/pdfDisponível em formato digitalGenéticaInferências filogenéticas do gênero Oxymycterus (Cricetidae:Sigmodontinae) de algumas localidades do Sul do Brasil, com base em sequências de DNA mitocondrialinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessTHUMBNAILR - D - WILLIAN THOMAZ PECANHA.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1259https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/38130/1/R%20-%20D%20-%20WILLIAN%20THOMAZ%20PECANHA.pdf.jpg1162af7abca40abd25a60f4603a21226MD51open accessTEXTR - D - WILLIAN THOMAZ PECANHA.pdf.txtExtracted Texttext/plain274889https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/38130/2/R%20-%20D%20-%20WILLIAN%20THOMAZ%20PECANHA.pdf.txt1597ded3a1699750786ce417c4af4b6dMD52open accessORIGINALR - D - WILLIAN THOMAZ PECANHA.pdfapplication/pdf2982362https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/38130/3/R%20-%20D%20-%20WILLIAN%20THOMAZ%20PECANHA.pdfa129de56f691099855c7f2071d8dad64MD53open access1884/381302015-11-24 08:58:53.806open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/38130Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082015-11-24T10:58:53Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Inferências filogenéticas do gênero Oxymycterus (Cricetidae:Sigmodontinae) de algumas localidades do Sul do Brasil, com base em sequências de DNA mitocondrial
title Inferências filogenéticas do gênero Oxymycterus (Cricetidae:Sigmodontinae) de algumas localidades do Sul do Brasil, com base em sequências de DNA mitocondrial
spellingShingle Inferências filogenéticas do gênero Oxymycterus (Cricetidae:Sigmodontinae) de algumas localidades do Sul do Brasil, com base em sequências de DNA mitocondrial
Peçanha, Willian Thomaz
Genética
title_short Inferências filogenéticas do gênero Oxymycterus (Cricetidae:Sigmodontinae) de algumas localidades do Sul do Brasil, com base em sequências de DNA mitocondrial
title_full Inferências filogenéticas do gênero Oxymycterus (Cricetidae:Sigmodontinae) de algumas localidades do Sul do Brasil, com base em sequências de DNA mitocondrial
title_fullStr Inferências filogenéticas do gênero Oxymycterus (Cricetidae:Sigmodontinae) de algumas localidades do Sul do Brasil, com base em sequências de DNA mitocondrial
title_full_unstemmed Inferências filogenéticas do gênero Oxymycterus (Cricetidae:Sigmodontinae) de algumas localidades do Sul do Brasil, com base em sequências de DNA mitocondrial
title_sort Inferências filogenéticas do gênero Oxymycterus (Cricetidae:Sigmodontinae) de algumas localidades do Sul do Brasil, com base em sequências de DNA mitocondrial
author Peçanha, Willian Thomaz
author_facet Peçanha, Willian Thomaz
author_role author
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv Hass, Iris
Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Genética
dc.contributor.author.fl_str_mv Peçanha, Willian Thomaz
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Freitas, Thales Renato Ochotorena de
contributor_str_mv Freitas, Thales Renato Ochotorena de
dc.subject.por.fl_str_mv Genética
topic Genética
description Orientador : Prof. Dr. Tales Renato O. de Freitas
publishDate 2015
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2015-07-22T19:04:16Z
dc.date.available.fl_str_mv 2015-07-22T19:04:16Z
dc.date.issued.fl_str_mv 2015
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/1884/38130
url http://hdl.handle.net/1884/38130
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.pt_BR.fl_str_mv Disponível em formato digital
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 133f. : il., tabs., maps., grafs., algumas color.
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/38130/1/R%20-%20D%20-%20WILLIAN%20THOMAZ%20PECANHA.pdf.jpg
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/38130/2/R%20-%20D%20-%20WILLIAN%20THOMAZ%20PECANHA.pdf.txt
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/38130/3/R%20-%20D%20-%20WILLIAN%20THOMAZ%20PECANHA.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 1162af7abca40abd25a60f4603a21226
1597ded3a1699750786ce417c4af4b6d
a129de56f691099855c7f2071d8dad64
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801860933977374720