Análise funcional e estrutural do sistema de secreção do tipo III Herbaspirillum rubrisubalbicans M1

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Schmidt, Maria Augusta
Data de Publicação: 2013
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1884/29962
Resumo: Orientadora : Profa. Dra. Rose Adele Monteiro
id UFPR_d2ec5f2f9b3b058c2262396c75aa17cf
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/29962
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str 308
spelling Souza, Emanuel Maltempi de, 1964-Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Ciências (Bioquímica)Monteiro, Rose Adele, 1973-Schmidt, Maria Augusta2022-12-07T19:13:05Z2022-12-07T19:13:05Z2013https://hdl.handle.net/1884/29962Orientadora : Profa. Dra. Rose Adele MonteiroCo-orientador : Prof. Dr. Emanuel Maltempi de SouzaTese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Bioquímica. Defesa: Curitiba, 27/02/2013Bibliografia: fls. 72-84Resumo: O Herbaspirillum rubrisubalbicans é uma bactéria diazotrófica e endofítica pertencente a classe ? das proteobacterias que é capaz de se associar com várias Poaceae de interesse econômico como milho, arroz, sorgo, trigo e cana-de-açúcar. Esta bactéria é capaz de causar a doença da estria mosqueada na variedade B- 4362 de cana-de-açúcar e a doença da estria vermelha em algumas variedades de sorgo. Em várias plantas a virulência das bactérias patogênicas é em parte dependente de um grupo de proteínas que são injetadas nas células do hospedeiro pelo Sistema de Secreção do Tipo III (SST3). Esta é uma maquinaria altamente conservada capaz de injetar proteínas bacterianas dentro de células eucarióticas. Recentemente, genes hrp/hrc que codificam as proteínas do SST3, foram identificados no genoma de H. rubrisubalbicans. Neste trabalho também identificamos prováveis proteínas efetoras e possíveis regiões promotoras dentro deste cluster. Os genes hrpE e hrcN que foram mutagenizados gerando os mutantes TSE e TSN que foram incapazes de causar a doença da estria mosqueada na cana de açúcar B-4362. A cana-de-açúcar B-4362 quando inoculada com a estirpe selvagem M1 materna apresenta sintomas da doença. A caracterização do funcionamento do SST3 foi feita inoculando os mutantes em outras variedades de gramíneas, como o arroz e milho. Sua capacidade de colonização e de promover o crescimento vegetal foi determinado, permitindo que o mutante no SST3 além de não ter conseguido colonizar arroz, cana de açúcar e milho com tanta eficiência quanto o selvagem, também não foi capaz de promover o crescimento destas plantas. O secretoma de H. rubrisubalbicans foi realizado afim de determianrmos quais proteínas estariam sendo secretadas na presença do caldo da cana B-4362 durante o cultivo, diferentes padrões proteicos foram encontrados sendo que 5 proteínas diferentemente expressas nas duas condições puderam ser identificadas. Estes resultados mostram que o produto dos genes hrpE ou hrcN é essencial para o funcionamento do SST3 em H. rubrisubalbicans ou ainda que este produto faz reação cruzada com outros sistemas interferindo assim na fisiologia da interação desta bactéria com as plantas.Abstract: The Herbaspirillum rubrisubalbicans is an endophytic diazotrophic bacterium and belongs to the class ? of proteobacteria that can be associated with several Poaceae of economic interest such as maize, rice, sorghum, wheat and sugar cane. This bacterium is capable of causing mottled strip disease in B-4362 variety of cane sugar and the Red Stripe disease in some sorghum varieties. In several plants the virulence of pathogenic bacteria is partly dependent on a group of proteins that are injected into host cells by Type III Secretion System (T3SS). This is a highly conserved machinery capable of injecting bacterial proteins into eukaryotic cells. Recently, hrp/hrc genes that encod to proteins of T3SS were identified in the genome of H. rubrisubalbicans. This work also identified probable effector proteins and putative promoter regions of this cluster. hrpE and hrcN genes were mutated generating mutants TSE and TSN, they were unable to cause mottled strip disease in sugarcane B-4362. The cane sugar B- 4362 when inoculated with the wild type M1 maternal symptoms of the disease. The characterization of operation of T3SS was made by inoculating mutants in other varieties of grasses, such as rice and maize. The ability to colonize and promote plant growth was determined by allowing the mutant of T3SS in addition to failing to colonize rice, sugarcane and maize as efficiently as the wild, was not able to promote the growth of these plants. The secretome of H. rubrisubalbicans was performed in order to determine which proteins were being secreted in the presence of B-4362 sugarcane juice during cultivation, different protein patterns were found with 5 proteins differentially expressed in the two conditions could be identified. These results show that the product of gene hrpE or hrcN is essential for the functioning of T3SS of H. rubrisubalbicans or that this product is cross-reaction with other systems interfering in the physiology of these bacteria interact with plants.84f. : il. [algumas color.], grafs., tabs.application/pdfDisponível em formato digitalTesesHerbaspirillumFisiologiaBioquímicaAnálise funcional e estrutural do sistema de secreção do tipo III Herbaspirillum rubrisubalbicans M1info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - T - MARIA AUGUSTA SCHMIDT.pdfapplication/pdf23871271https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/29962/1/R%20-%20T%20-%20MARIA%20AUGUSTA%20SCHMIDT.pdf7f76c33689b584dbda27a423857f8ad4MD51open accessTEXTR - T - MARIA AUGUSTA SCHMIDT.pdf.txtExtracted Texttext/plain147365https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/29962/2/R%20-%20T%20-%20MARIA%20AUGUSTA%20SCHMIDT.pdf.txtf47ffa257297db70a4afe4a1bb57ccbaMD52open accessTHUMBNAILR - T - MARIA AUGUSTA SCHMIDT.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1262https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/29962/3/R%20-%20T%20-%20MARIA%20AUGUSTA%20SCHMIDT.pdf.jpg112d6af18fc51445707f07301c1f9e61MD53open access1884/299622022-12-07 16:13:05.15open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/29962Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082022-12-07T19:13:05Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Análise funcional e estrutural do sistema de secreção do tipo III Herbaspirillum rubrisubalbicans M1
title Análise funcional e estrutural do sistema de secreção do tipo III Herbaspirillum rubrisubalbicans M1
spellingShingle Análise funcional e estrutural do sistema de secreção do tipo III Herbaspirillum rubrisubalbicans M1
Schmidt, Maria Augusta
Teses
Herbaspirillum
Fisiologia
Bioquímica
title_short Análise funcional e estrutural do sistema de secreção do tipo III Herbaspirillum rubrisubalbicans M1
title_full Análise funcional e estrutural do sistema de secreção do tipo III Herbaspirillum rubrisubalbicans M1
title_fullStr Análise funcional e estrutural do sistema de secreção do tipo III Herbaspirillum rubrisubalbicans M1
title_full_unstemmed Análise funcional e estrutural do sistema de secreção do tipo III Herbaspirillum rubrisubalbicans M1
title_sort Análise funcional e estrutural do sistema de secreção do tipo III Herbaspirillum rubrisubalbicans M1
author Schmidt, Maria Augusta
author_facet Schmidt, Maria Augusta
author_role author
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv Souza, Emanuel Maltempi de, 1964-
Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Ciências (Bioquímica)
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Monteiro, Rose Adele, 1973-
dc.contributor.author.fl_str_mv Schmidt, Maria Augusta
contributor_str_mv Monteiro, Rose Adele, 1973-
dc.subject.por.fl_str_mv Teses
Herbaspirillum
Fisiologia
Bioquímica
topic Teses
Herbaspirillum
Fisiologia
Bioquímica
description Orientadora : Profa. Dra. Rose Adele Monteiro
publishDate 2013
dc.date.issued.fl_str_mv 2013
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-12-07T19:13:05Z
dc.date.available.fl_str_mv 2022-12-07T19:13:05Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/1884/29962
url https://hdl.handle.net/1884/29962
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.pt_BR.fl_str_mv Disponível em formato digital
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 84f. : il. [algumas color.], grafs., tabs.
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/29962/1/R%20-%20T%20-%20MARIA%20AUGUSTA%20SCHMIDT.pdf
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/29962/2/R%20-%20T%20-%20MARIA%20AUGUSTA%20SCHMIDT.pdf.txt
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/29962/3/R%20-%20T%20-%20MARIA%20AUGUSTA%20SCHMIDT.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 7f76c33689b584dbda27a423857f8ad4
f47ffa257297db70a4afe4a1bb57ccba
112d6af18fc51445707f07301c1f9e61
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801860272742203392

Registros relacionados