Enriquecimento de vesículas extracelulares de Giardia intestinalis por centrifugação diferencial e por gradiente de sacarose

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sana, Abel
Data de Publicação: 2023
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1884/87540
Resumo: Orientador: Prof. Dr. Marcel Ivan Ramirez Araya
id UFPR_d5fa689c4e8a24d54a65eb08b21804f7
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/87540
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str 308
spelling Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e MolecularRamirez, Marcel IvanSana, Abel2024-04-17T13:07:06Z2024-04-17T13:07:06Z2023https://hdl.handle.net/1884/87540Orientador: Prof. Dr. Marcel Ivan Ramirez ArayaDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Defesa : Curitiba, 30/11/2023Inclui referênciasResumo: Giardia intestinalis é um protozoário flagelado, causador da doença diarreica denominada giardíase. Recentemente a produção de vesículas extracelulares (VEs) por G. intestinalis e o papel dessas VEs na interação do parasito com o hospedeiro foi descrito. De acordo com a biogênese, as VEs são agrupadas em grandes (na sua maioria microvesículas) e pequenas (majoritariamente exossomos) e os dois grupos foram descritos em G. Intestinalis. As populações de VEs são heterogêneas e métodos aprimorados para separá-los e estudá-los são necessários para entender seus papéis na fisiologia e na patologia. Este trabalho objetivou-se em enriquecer e caracterizar as VEs de G. intestinalis, visando compreender melhor os papéis dessas vesículas na interação do parasito com o hospedeiro. Para isso, estabelecemos um método para enriquecer as VEs e as caracterizamos com base no tamanho por análise de rastreamento de nanopartículas (NTA). A produção de VEs foi induzida incubando G. intestinalis em meio TYI-S-33 sem soro, com 1mM de CaCl2, por 1h a 37º C. As VEs foram isoladas do sobrenadante por centrifugação diferencial a 15K por 1 hora e 4 horas e pela ultracentrifugação diferencial a 100K por 1 hora e 30 minutos. Também as VEs foram isoladas por centrifugação diferencial a 15K 4h e separadas em frações por gradiente de sacarose. Como principal resultado, o NTA mostrou que a ultracentrifugação direta a 100K 1,5h e a 15K 4h concentraram mais VEs (177,6x108/ml e 165,4x108/ml, respectivamente) em comparação com a centrifugação a 15K 1h (93,2x108/ml) e dessas VEs a maioria eram médias (mVEs) e grandes (lEVs). Quanto ao gradiente de sacarose, a fração 6 concentrou mais partículas (148,8x108/ml) e eram na sua maioria VEs grandes (lEVs). Vimos que os VEs liberados por G. intestinalis podem ser melhor enriquecidas por ultracentrifugação a 100K 1,5h, ou por centrifugação 15K 4h. Este último pode ser feito utilizando uma centrífuga de bancada, o que pode ser útil para pesquisadores que desejam investigar o papel das VEs, mas não possuem uma ultracentrífuga. Espera-se que este trabalho possa auxiliar no estudo de VEs.Giardia intestinalis é um protozoário flagelado, causador da doença diarreica denominada giardíase. Recentemente a produção de vesículas extracelulares (VEs) por G. intestinalis e o papel dessas VEs na interação do parasito com o hospedeiro foi descrito. De acordo com a biogênese, as VEs são agrupadas em grandes (na sua maioria microvesículas) e pequenas (majoritariamente exossomos) e os dois grupos foram descritos em G. Intestinalis. As populações de VEs são heterogêneas e métodos aprimorados para separá-los e estudá-los são necessários para entender seus papéis na fisiologia e na patologia. Este trabalho objetivou-se em enriquecer e caracterizar as VEs de G. intestinalis, visando compreender melhor os papéis dessas vesículas na interação do parasito com o hospedeiro. Para isso, estabelecemos um método para enriquecer as VEs e as caracterizamos com base no tamanho por análise de rastreamento de nanopartículas (NTA). A produção de VEs foi induzida incubando G. intestinalis em meio TYI-S-33 sem soro, com 1mM de CaCl2, por 1h a 37º C. As VEs foram isoladas do sobrenadante por centrifugação diferencial a 15K por 1 hora e 4 horas e pela ultracentrifugação diferencial a 100K por 1 hora e 30 minutos. Também as VEs foram isoladas por centrifugação diferencial a 15K 4h e separadas em frações por gradiente de sacarose. Como principal resultado, o NTA mostrou que a ultracentrifugação direta a 100K 1,5h e a 15K 4h concentraram mais VEs (177,6x108/ml e 165,4x108/ml, respectivamente) em comparação com a centrifugação a 15K 1h (93,2x108/ml) e dessas VEs a maioria eram médias (mVEs) e grandes (lEVs). Quanto ao gradiente de sacarose, a fração 6 concentrou mais partículas (148,8x108/ml) e eram na sua maioria VEs grandes (lEVs). Vimos que os VEs liberados por G. intestinalis podem ser melhor enriquecidas por ultracentrifugação a 100K 1,5h, ou por centrifugação 15K 4h. Este último pode ser feito utilizando uma centrífuga de bancada, o que pode ser útil para pesquisadores que desejam investigar o papel das VEs, mas não possuem uma ultracentrífuga. Espera-se que este trabalho possa auxiliar no estudo de VEs.Abstract: Giardia intestinalis is a flagellated protozoan that colonizes the small intestine causing the diarrheal disease called giardiasis. Recently, the production of extracellular vesicles (EVs) by G. intestinalis and the role of these EVs in the interaction between the parasite and the host was described. According to biogenesis, EVs are grouped into large (mostly microvesicles) and small (mostly exosomes) and both groups have been described in G. intestinalis. EVs populations are heterogeneous and improved methods to separate and study them are needed to understand their roles in physiology and pathology. This work aimed to enrich and characterize the EVs of G. intestinalis, aiming to better understand the roles of these vesicles in the interaction between the parasite and the host. To this end, we established a method to enrich EVs and characterized them based on size by nanoparticle tracking analysis (NTA). EV production was induced by incubating G. intestinalis in serum-free TYI-S-33 medium, with 1mM CaCl2, for 1h at 37º C. EVs were isolated from the supernatant by differential centrifugation at 15K for 1 hour and 4 hours and by differential ultracentrifugation at 100K 1,5h. EVs were also isolated by differential centrifugation at 15K for 4h and separated into fractions by sucrose gradient. As a main result, the NTA showed that direct ultracentrifugation at 100K 1.5h and 15K 4h concentrated more EVs (177.6x108/ml and 165.4x108/ml, respectively) compared to centrifugation at 15K 1h (93.2x108/ml) and of these VEs the majority were medium (mVEs) and large (lEVs). As for the sucrose gradient, fraction 6 concentrated more particles (148,8x108/ml) and they were mostly large EVs (lEVs). We saw that EVs released by G. intestinalis can be enriched by direct ultracentrifugation at 100K 1,5h or by centrifugation at 15K 4h. The latter can be done using a benchtop centrifuge, which could be useful for researchers who want to investigate the role of EVs but do not have an ultracentrifuge. It is hoped that this work can assist in the study of EVs.1 recurso online : PDF.application/pdfGiardiaRelação hospedeiro-parasitoMorfologiaEnriquecimento de vesículas extracelulares de Giardia intestinalis por centrifugação diferencial e por gradiente de sacaroseinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - D - ABEL SANA.pdfapplication/pdf2237658https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/87540/1/R%20-%20D%20-%20ABEL%20SANA.pdf72e0716667b9e3f9565a900d177bc214MD51open access1884/875402024-04-17 10:07:06.096open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/87540Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082024-04-17T13:07:06Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Enriquecimento de vesículas extracelulares de Giardia intestinalis por centrifugação diferencial e por gradiente de sacarose
title Enriquecimento de vesículas extracelulares de Giardia intestinalis por centrifugação diferencial e por gradiente de sacarose
spellingShingle Enriquecimento de vesículas extracelulares de Giardia intestinalis por centrifugação diferencial e por gradiente de sacarose
Sana, Abel
Giardia
Relação hospedeiro-parasito
Morfologia
title_short Enriquecimento de vesículas extracelulares de Giardia intestinalis por centrifugação diferencial e por gradiente de sacarose
title_full Enriquecimento de vesículas extracelulares de Giardia intestinalis por centrifugação diferencial e por gradiente de sacarose
title_fullStr Enriquecimento de vesículas extracelulares de Giardia intestinalis por centrifugação diferencial e por gradiente de sacarose
title_full_unstemmed Enriquecimento de vesículas extracelulares de Giardia intestinalis por centrifugação diferencial e por gradiente de sacarose
title_sort Enriquecimento de vesículas extracelulares de Giardia intestinalis por centrifugação diferencial e por gradiente de sacarose
author Sana, Abel
author_facet Sana, Abel
author_role author
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Ramirez, Marcel Ivan
dc.contributor.author.fl_str_mv Sana, Abel
contributor_str_mv Ramirez, Marcel Ivan
dc.subject.por.fl_str_mv Giardia
Relação hospedeiro-parasito
Morfologia
topic Giardia
Relação hospedeiro-parasito
Morfologia
description Orientador: Prof. Dr. Marcel Ivan Ramirez Araya
publishDate 2023
dc.date.issued.fl_str_mv 2023
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2024-04-17T13:07:06Z
dc.date.available.fl_str_mv 2024-04-17T13:07:06Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/1884/87540
url https://hdl.handle.net/1884/87540
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 1 recurso online : PDF.
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/87540/1/R%20-%20D%20-%20ABEL%20SANA.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 72e0716667b9e3f9565a900d177bc214
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801860305158930432