Expressão de RNAs não codificantes longos no inicio da diferenciação de células-tronco adultas derivadas de tecido adiposo

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Bonilauri, Bernardo
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1884/58214
Resumo: Orientador: Prof. Dr. Bruno Dallagiovanna Muñiz
id UFPR_d8dda3a7ed1194d9d7b0661f69489de5
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/58214
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str 308
spelling Bonilauri, BernardoUniversidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e MolecularDallagiovanna Muñiz, Bruno2019-02-08T20:35:06Z2019-02-08T20:35:06Z2018https://hdl.handle.net/1884/58214Orientador: Prof. Dr. Bruno Dallagiovanna MuñizDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular. Defesa : Curitiba, 22/02/2018Inclui referências: p.118-141Resumo: RNAs não codificantes longos (lncRNAs) possuem um importante papel na regulação transcricional e pós-transcricional. São classificados como transcritos maiores que 200 nucleotídeos, que não apresentam potencial de codificar proteínas, sendo observados tanto no núcleo como no citoplasma. Novos estudos tem demonstrado a grande importância destes RNAs na diferenciação celular, porém pouco se compreende a cerca de sua dinâmica e de seus mecanismos de ação, principalmente nos processos de diferenciação de células-tronco adultas. O objetivo deste trabalho foi estudar o perfil de expressão dos lncRNAs logo no disparo inicial da diferenciação, além de sua associação aos polissomos em células-tronco adultas. Utilizamos sequenciamento em larga escala (RNA-Seq) dos RNAs associados aos polissomos e da fração total, obtidos através da técnica de Polysome Profile de células-tronco adultas derivadas de tecido adiposo submetidas a 24h de diferenciação osteogênica e adipogênica. Com isso, verificamos a expressão diferencial de 46 lncRNAs na fração total e 73 lncRNAs na fração polissomal após a indução osteogênica e 76 lncRNAs na fração total e 89 lncRNAs na fração polissomal após a indução adipogênica. Todos estes lncRNAs foram classificados e caracterizados de acordo com suas localizações genômicas, comprimento, número de éxons, conteúdo GC, estrutura e potencial codificante. Curiosamente, ao compararmos os lncRNAs com expressão diferencial nas frações total e polissomal, notamos que há poucos transcritos comuns entre elas, o que nos indica possíveis funções distintas entre os RNAs das frações. Além disso, ao compararmos as duas diferenciações, poucos lncRNAs comuns entre elas foram visualizados da mesma forma, demonstrando assim, que logo no início da diferenciação (24h) há uma clara distinção da regulação transcricional e pós-transcricional de lncRNAs durante a adipogênese e osteogênese. Alguns lncRNAs polissomais relacionados ao processo de diferenciação foram selecionados para a validação do RNA-seq, sendo demonstrados sua expressão durante todo o processo de diferenciação osteogênica (21 dias) e adipogênica (14 dias), além de comprovarmos a associação destes lncRNAs aos polissomos através da técnica de Polysome Profiling com adição do inibidor da tradução puromicina. Podemos concluir que, a expressão de lncRNAs durante o disparo inicial da diferenciação celular se mostrou bastante específica, inclusive em relação aos lncRNAs associados aos polissomos, denotando uma ampla regulação transcricional e pós transcricional logo no primeiro dia das diferenciações osteogênica e adipogênica. Palavras-chave: lncRNAs; polissomo, diferenciação, células-tronco, pós-transcricional e transcricional.Abstract: Long non-coding RNAs (lncRNAs) play an important role in transcriptional and posttranscriptional regulation. They are classified as transcripts greater than 200 nucleotides, which don't possible to encode proteins, being observed either in the nucleus and cytoplasm. New studies demonstrated a great importance of these RNAs in cell differentiation, though there is no complete understanding of their dynamics and mechanisms of action, especially during adult stem cell differentiation. The objective of this work was to study the expression profile of lncRNAs at the initial step of differentiation, and also its association with polysomes in adult stem cells. We used the large-scale sequencing (RNA-Seq) of both, total fraction and the RNAs associated with the polysomes, obtained from adipose tissue-derived adult stem cells previously submitted to 24h of adipogenic and osteogenic differentiation through the Polysome Profiling. Accordingly, we verified the differential expression of 46 lncRNAs in the total fraction and 73 lncRNAs in the polysomal fraction after osteogenic induction. After the adipogenic induction we found 76 lncRNAs in the total fraction and 89 lncRNAs in the polysomal fraction. These lncRNAs were classified and characterized according to their locations, size, number of exons, GC content, structure and coding potential. Interestingly, when comparing differential expressed lncRNAs in total and polysomal fractions, we noticed that there are only few common transcripts between them, which indicates different functions and regulation for the lncRNAs which were exclusive to each fractions. In addition, when comparing the two differentiations, few common lncRNAs were visualized between the two processes demonstrating that in early steps of differentiation (24h) there is a clear distinction between the transcriptional and posttranscriptional regulation of lncRNAs. Some polysomal lncRNAs envolved in differentiation process were selected for the validation of RNA-Seq. For this, lncRNAs expression was demonstrated during the whole process of osteogenic (21 days) and adipogenic (14 days) differentiation. Besides, we proved the association of these lncRNAs with the polysomes through Polysome Profiling technique with addition of the puromycin. We can conclude that; the expression of lncRNAs during the initial steps of cell differentiation was quite specific, including the lncRNAs associated with polysome, denoting a wide transcriptional and posttranscriptional regulation right after the first day of osteogenic and adipogenic differentiations. Keywords: lncRNAs; polysome; differentiation; stem cells; posttranscriptional and transcriptional.192 p. : il. (algumas color.).application/pdfCélulas-troncoMorfologiaTecido adiposoÁcido ribonucleicoExpressão de RNAs não codificantes longos no inicio da diferenciação de células-tronco adultas derivadas de tecido adiposoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - D - BERNARDO BONILAURI.pdfapplication/pdf5490675https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/58214/1/R%20-%20D%20-%20BERNARDO%20BONILAURI.pdf9b6e467e3292ee3e1f0d666f916a36a8MD51open access1884/582142019-02-08 18:35:06.883open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/58214Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082019-02-08T20:35:06Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Expressão de RNAs não codificantes longos no inicio da diferenciação de células-tronco adultas derivadas de tecido adiposo
title Expressão de RNAs não codificantes longos no inicio da diferenciação de células-tronco adultas derivadas de tecido adiposo
spellingShingle Expressão de RNAs não codificantes longos no inicio da diferenciação de células-tronco adultas derivadas de tecido adiposo
Bonilauri, Bernardo
Células-tronco
Morfologia
Tecido adiposo
Ácido ribonucleico
title_short Expressão de RNAs não codificantes longos no inicio da diferenciação de células-tronco adultas derivadas de tecido adiposo
title_full Expressão de RNAs não codificantes longos no inicio da diferenciação de células-tronco adultas derivadas de tecido adiposo
title_fullStr Expressão de RNAs não codificantes longos no inicio da diferenciação de células-tronco adultas derivadas de tecido adiposo
title_full_unstemmed Expressão de RNAs não codificantes longos no inicio da diferenciação de células-tronco adultas derivadas de tecido adiposo
title_sort Expressão de RNAs não codificantes longos no inicio da diferenciação de células-tronco adultas derivadas de tecido adiposo
author Bonilauri, Bernardo
author_facet Bonilauri, Bernardo
author_role author
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular
dc.contributor.author.fl_str_mv Bonilauri, Bernardo
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Dallagiovanna Muñiz, Bruno
contributor_str_mv Dallagiovanna Muñiz, Bruno
dc.subject.por.fl_str_mv Células-tronco
Morfologia
Tecido adiposo
Ácido ribonucleico
topic Células-tronco
Morfologia
Tecido adiposo
Ácido ribonucleico
description Orientador: Prof. Dr. Bruno Dallagiovanna Muñiz
publishDate 2018
dc.date.issued.fl_str_mv 2018
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2019-02-08T20:35:06Z
dc.date.available.fl_str_mv 2019-02-08T20:35:06Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/1884/58214
url https://hdl.handle.net/1884/58214
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 192 p. : il. (algumas color.).
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/58214/1/R%20-%20D%20-%20BERNARDO%20BONILAURI.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv 9b6e467e3292ee3e1f0d666f916a36a8
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1813898911297830912

Registros relacionados