Filogenia e taxonomia do gênero Diaporthe e a sua aplicação no controle biológico da mancha preta dos citros

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Gomes, Renata Rodrigues
Data de Publicação: 2012
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1884/36485
Resumo: Orientadores : Profª Drª Chirlei Glienke, PhD Pedro Crous
id UFPR_d9e4368e166dfe6a03209f41282b3233
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/36485
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str 308
spelling Kava, Vanessa, 1968-Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em GenéticaGlienke, Chirlei, 1970-Crous, PedroGomes, Renata Rodrigues2022-12-08T15:23:30Z2022-12-08T15:23:30Z2012https://hdl.handle.net/1884/36485Orientadores : Profª Drª Chirlei Glienke, PhD Pedro CrousCo-orientadora : Profª Drª Vanessa Kava CordeiroTese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba, 31/07/2012Inclui referênciasÁrea de concentração : GenéticaResumo: Espécies do gênero Diaporthe (Phomopsis) têm sido descritas em uma ampla gama de hospedeiros como fitopatogênicas, endofíticas, saprofíticas e recentemente foram descritas causando problemas de saúde em humanos e outros mamíferos. Esse trabalho teve como objetivo reavaliar o gênero Diaporthe através de análise taxonômica e filogenética e esclarecer a taxonomia de Diaporthe endofíticos com potencial antagonista contra Phyllosticta citricarpa agente causal da Mancha Preta dos Citros. No presente estudo nós investigamos 243 isolados usando dados de sequências de DNA em multilocus. Foram selecionados dentre nove genes os cinco melhores para resolução taxonômica. As regiões gênicas selecionadas, região espaçadora interna transcrita do rDNA (ITS1, 5.8S, ITS2), regiões parciais dos genes fator 1-alfa de elongação da tradução (TEF1), beta-tubulina (TUB), histona H3 (HIS) e calmodulina (CAL), resolveram 95 clados. Quinze novas espécies foram descritas, Diaporthe arengae, D. brasiliensis, D. endophytica, D. hongkongensis, D. inconspicua, D. infecunda, D. mayteni, D. neoarctii, D. oxe, D. paranensis, D. pseudomangiferae, D. pseudophoenicicola, D. raonikayaporum, D. schini and D. Terebinthifolii, Quatorze novas combinações foram introduzidas em Diaporthe e a espécie D. anacardii foi epitipificada. A taxonomia de Diaporthe endófitos das plantas medicinais Spondias mombin, Schinus terebinthifolius, Aspidosperma tomentosun e Maytenus ilicifolia com potencial antagonista contra P. citricarpa foi esclarecida. Embora as espécies de Diaporthe no passado tenham sido identificadas principalmente com base na associação com o hospedeiro, os resultados deste estudo confirmam que o mesmo táxon pode estar associado a diferentes hospedeiros, o que sugere que eles se movem livremente entre os mesmos. Em contrapartida, alguns patógenos de plantas e endofíticos parecem ser estritamente restritos a determinado hospedeiro. Devido ao comportamento de diversidade ecológica entre os membros do gênero Diaporthe, esse trabalho sugere que descrições de novas espécies ocorram apenas quando empregados dados moleculares.Abstract: Species in the genus Diaporthe (Phomopsis) have been reported as plant pathogens, non-pathogenic endophytes or saprobes from a wide range of hosts and have also been recently reported as the cause of health problems in humans and other mamals. The current study aimed to resolve the taxonomy and phylogeny of a large collection of Diaporthe species occurring on diverse hosts, either as pathogens, saprobes, or as harmless endophytes, including endophytic Diaporthe with antagonistic potentials against the Phyllosticta citricicarpa the causative agent for Citrus Black Spot. In the present study we investigated 243 isolates using multilocus DNA sequence data. Nine genes were evaluated and the five best have been selected for taxonomic resolution. The selected gene regions were the rDNA internal transcribed spacer (ITS1, 5.8S, ITS2) region, and partial translation elongation factor 1-alpha (TEF1), beta-tubulin (TUB), histone H3 (HIS) and calmodulin (CAL) genes resolved 95 clades. Fifteen new species are described, namely Diaporthe arengae, D. brasiliensis, D. endophytica, D. hongkongensis, D. inconspicua, D. infecunda, D. mayteni, D. neoarctii, D. oxe, D. paranensis, D. pseudomangiferae, D. pseudophoenicicola, D. raonikayaporum, D. schini and D. terebinthifolii. A further 14 new combinations are introduced in Diaporthe, and D. anacardii is epitypified. The taxonomy of endophyte Diaporthe from the medicinal plants Aspidosperma tomentosun, Maytenus ilicifolia, Spondias mombin and Schinus terebinthifolius, with antagonistic potential against P. citricicarpa was clarified. Although species of Diaporthe have in the past chiefly been distinguished based on host association, results of this study confirm several taxa to have wide host ranges, suggesting that they move freely among hosts, frequently co-colonising diseased or dead tissue. In contrast, some plant pathogenic and endophytic taxa appear to be strictly host specific. Given this diverse ecological behaviour among members of Diaporthe, the current study suggests that new species descriptions should only happen when there is molecular data.86f. : il., tabs.application/pdfDisponível em formato digitalTesesGenéticaFrutas citricas - Doenças e pragasPragas agricolas - Controle biológicoFungos fitopatogenicos - Plantas hospedeirasFilogenia e taxonomia do gênero Diaporthe e a sua aplicação no controle biológico da mancha preta dos citrosinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - T - RENATA RODRIGUES GOMES.pdfapplication/pdf3206209https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/36485/1/R%20-%20T%20-%20RENATA%20RODRIGUES%20GOMES.pdf0bbb1d9b4b6005edbb7b71d10acef3beMD51open accessTEXTR - T - RENATA RODRIGUES GOMES.pdf.txtExtracted Texttext/plain336332https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/36485/2/R%20-%20T%20-%20RENATA%20RODRIGUES%20GOMES.pdf.txt3d9c91d72b16cb71928396c1b620f564MD52open accessTHUMBNAILR - T - RENATA RODRIGUES GOMES.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1363https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/36485/3/R%20-%20T%20-%20RENATA%20RODRIGUES%20GOMES.pdf.jpg28f769cda4f2480d78c6ecb03361e430MD53open access1884/364852022-12-08 12:23:30.899open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/36485Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082022-12-08T15:23:30Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Filogenia e taxonomia do gênero Diaporthe e a sua aplicação no controle biológico da mancha preta dos citros
title Filogenia e taxonomia do gênero Diaporthe e a sua aplicação no controle biológico da mancha preta dos citros
spellingShingle Filogenia e taxonomia do gênero Diaporthe e a sua aplicação no controle biológico da mancha preta dos citros
Gomes, Renata Rodrigues
Teses
Genética
Frutas citricas - Doenças e pragas
Pragas agricolas - Controle biológico
Fungos fitopatogenicos - Plantas hospedeiras
title_short Filogenia e taxonomia do gênero Diaporthe e a sua aplicação no controle biológico da mancha preta dos citros
title_full Filogenia e taxonomia do gênero Diaporthe e a sua aplicação no controle biológico da mancha preta dos citros
title_fullStr Filogenia e taxonomia do gênero Diaporthe e a sua aplicação no controle biológico da mancha preta dos citros
title_full_unstemmed Filogenia e taxonomia do gênero Diaporthe e a sua aplicação no controle biológico da mancha preta dos citros
title_sort Filogenia e taxonomia do gênero Diaporthe e a sua aplicação no controle biológico da mancha preta dos citros
author Gomes, Renata Rodrigues
author_facet Gomes, Renata Rodrigues
author_role author
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv Kava, Vanessa, 1968-
Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Genética
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Glienke, Chirlei, 1970-
Crous, Pedro
dc.contributor.author.fl_str_mv Gomes, Renata Rodrigues
contributor_str_mv Glienke, Chirlei, 1970-
Crous, Pedro
dc.subject.por.fl_str_mv Teses
Genética
Frutas citricas - Doenças e pragas
Pragas agricolas - Controle biológico
Fungos fitopatogenicos - Plantas hospedeiras
topic Teses
Genética
Frutas citricas - Doenças e pragas
Pragas agricolas - Controle biológico
Fungos fitopatogenicos - Plantas hospedeiras
description Orientadores : Profª Drª Chirlei Glienke, PhD Pedro Crous
publishDate 2012
dc.date.issued.fl_str_mv 2012
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2022-12-08T15:23:30Z
dc.date.available.fl_str_mv 2022-12-08T15:23:30Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/1884/36485
url https://hdl.handle.net/1884/36485
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.pt_BR.fl_str_mv Disponível em formato digital
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 86f. : il., tabs.
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/36485/1/R%20-%20T%20-%20RENATA%20RODRIGUES%20GOMES.pdf
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/36485/2/R%20-%20T%20-%20RENATA%20RODRIGUES%20GOMES.pdf.txt
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/36485/3/R%20-%20T%20-%20RENATA%20RODRIGUES%20GOMES.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 0bbb1d9b4b6005edbb7b71d10acef3be
3d9c91d72b16cb71928396c1b620f564
28f769cda4f2480d78c6ecb03361e430
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801860594535497728

Registros relacionados