Comparação dos testes Linear Array HPV Genotyping® e Cobas HPV Test® para detecção e genotipagem do papilomavírus humano (HPV) de alto risco oncogênico em mulheres em idade reprodutiva

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Fernandes, Thaiz
Data de Publicação: 2018
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1884/69681
Resumo: Orientadora : Profª. Drª. Camila Marconi
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spelling Fernandes, ThaizMarconi, CamilaUniversidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Microbiologia, Parasitologia e Patologia2021-03-05T23:36:25Z2021-03-05T23:36:25Z2018https://hdl.handle.net/1884/69681Orientadora : Profª. Drª. Camila MarconiDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Microbiologia, Parasitologia e Patologia. Defesa : Curitiba, 23/03/2018Inclui referências : p. 57-72Resumo : Atualmente são descritos cerca de 40 genótipos de Papilomavírus humano (HPV) que podem infectar a região anogenital. Tais vírus podem ser divididos em genótipos de alto risco, provável alto risco e baixo risco de acordo com o seu potencial de deflagrar o desenvolvimento de lesões intraepiteliais de alto grau e carcinomas invasivos no colo uterino. Com isso, torna-se fundamental a detecção e genotipagem do HPV para determinar quais mulheres estão em risco em desenvolver lesões HPVinduzidas. O Linear Array HPV Genotyping® (Roche Molecular Systems, Pleasanton, CA) é a técnica mais utilizada nas pesquisas científicas para detecção e genotipagem do HPV. Entretanto, na rotina diagnóstica a técnica mais utilizada para essa finalidade é o Cobas HPV Test® (Roche Molecular Systems, Pleasanton, CA). Assim, o objetivo desse estudo foi comparar as técnicas Linear Array® e Cobas® quanto a positividade de HPV de alto risco oncogênico em mulheres em idade reprodutiva. Trata-se de um estudo transversal que incluiu 162 amostras cervicais de mulheres que procuraram as Unidades Básicas de Saúde do município de Botucatu/SP, Brasil e do Serviço de Orientação e Prevenção do Câncer do município de Bauru/SP, Brasil. Dessas, amostras provenientes de 93 mulheres foram testadas pelas duas técnicas, 56 (60,2%) foram positivas para o Linear Array® e 29 (31,2%) foram HPV-positivas para o Cobas®. Das 27 amostras com resultados diferentes, 17 (63,0%) foram positivas para HPV de baixo risco e não são compreendidas na detecção pelo sistema Cobas®, essas foram consideradas como negativas para HPV de alto risco na comparação entre as técnicas. No entanto, as 10 (37,0%) amostras restantes foram positivas para HPV de alto risco, principalmente para "outros HPV de alto risco", sendo consideradas discordantes. A partir disso, esse estudo confirmou à capacidade do Linear Array® em gerar mais resultados positivos para "outros HPV de alto risco" em comparação ao Cobas®. Dentre as mulheres HPV-positivas, o HPV-16 foi o genótipo mais prevalente pela técnica de Linear Array® e Cobas®, estando presente em 11 (28,9%) e 9 (31,0%) amostras respectivamente, resultando em um kappa de 0,8881. As duas técnicas apresentaram uma taxa de concordância de 89,2% com um valor de kappa de 0,7460, indicando uma concordância considerável. Dessa forma, o Cobas® apresentou uma alta taxa de concordância em relação ao Linear Array® e, portanto, pode ser considerado como teste empregado em rastreio da população, tendo em vista seu menor custo e praticidade durante a execução da técnica. Palavras-Chaves: HPV. Diagnóstico. Linear Array HPV Genotyping®. Cobas HPV Test®Abstract : Approximately 40 Human Papillomavirus (HPV) genotypes that infect the anogenital region are currently described. These genotypes are classified as low-, probable high- and high-risk HPV according to their oncogenic potential of causing high grade squamous intraepithelial lesions and cervical carcinoma. HPV detection and genotyping is important to identify the women group at risk of developing HPV-induced lesions. The Linear Array HPV Genotyping® (Roche Molecular Systems, Pleasanton, CA) is a method of HPV detection and genotyping most used in scientific research. While the Cobas HPV Test® (Roche Molecular Systems, Pleasanton, CA) is a method most used in diagnostic routine to HPV detection and genotyping. Therefore, the objective of this study was to compare the Linear Array® and Cobas® techniques for high-risk oncogenic HPV positivity in women of reproductive age. This is a crosssectional study that included 162 cervical samples from women attending the Primary Health Care Units in Botucatu/SP, Brazil and the Cancer Prevention and Orientation Service, in Bauru/SP, Brazil. A subset of 93 women included in the study had comparable results for both techniques, 56 (60.2%) were HPV-positive by Linear Array® and 29 (31.2%) were HPV-positive by Cobas®. Of the 27 samples with conflicting results, 17 (63.0%) were positive for low-risk HPV. Such genotypes are not detectable by Cobas® system, thus they were considered as negative for high-risk HPV when comparing both techniques. However, the 10 (37.0%) remaining samples were positive for high-risk HPV, mainly for "other high-risk HPV" and were considered discordant. Thus, this study confirmed the ability of the Linear Array® to generate more positive results for "other high-risk HPV" compared to Cobas®. Among HPV-positive women, HPV-16 was the most prevalent genotype by the Linear Array® and Cobas® technique, being present in 11 (28.9%) e 9 (31.0%) samples respectively, resulting in kappa value of 0.8881. The two techniques had a concordance rate of 89.2%, resulting a kappa value of 0.7460 indicating a considerable agreement. Thus, the Cobas® presented a high concordance rate in relation to Linear Array®. Therefore, it may be considered the test of choice for population screening, considering its lower cost and practicality during the execution. Keywords: HPV. Diagnosis. Linear Array HPV Genotyping®. Cobas HPV Test®77 p. : il. (algumas color.).application/pdfGenótiposMicrobiologiaVirus do papilomaVirus oncogenicosAnálise de DNAReprodução humanaDiagnostico virologicoCâncer - Aspectos genéticosComparação dos testes Linear Array HPV Genotyping® e Cobas HPV Test® para detecção e genotipagem do papilomavírus humano (HPV) de alto risco oncogênico em mulheres em idade reprodutivainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - D - THAIZ FERNANDES.pdfapplication/pdf3753813https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/69681/1/R%20-%20D%20-%20THAIZ%20FERNANDES.pdf361c0996c80bf15cba3fda0f08249866MD51open access1884/696812021-03-05 20:36:26.105open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/69681Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082021-03-05T23:36:26Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
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