Procura in sílico por genes de tripanosomatídeos com possível função regulatória do sistema complemento humano

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Gomes, Fabiano Carvalho
Data de Publicação: 2014
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: http://hdl.handle.net/1884/39346
Resumo: Orientadora : Maria Berenice Reynaud Steffens
id UFPR_e8da814f1af988cce8f08d2e1cddb43b
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/39346
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str 308
spelling Gomes, Fabiano CarvalhoAraya, Marcel Ivan RamirezUniversidade Federal do Paraná. Setor de Educação Profissional e Tecnológica. Programa de Pós-Graduação em BioinformáticaSteffens, Maria Berenice Reynaud2016-02-25T17:04:54Z2016-02-25T17:04:54Z2014http://hdl.handle.net/1884/39346Orientadora : Maria Berenice Reynaud SteffensCo-orientador : Marcel Ivan Ramirez ArayaDissertação (mestrado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Exatas, Programa de Pós-Graduação em Bioinformática. Defesa: Curitiba, 15/08/2013Inclui referênciasResumo: O Trypanosoma cruzi e o agente causador da doença de Chagas e possui um ciclo de vida complexo que alterna entre hospedeiros invertebrados e vertebrados. O ciclo do T. cruzi no hospedeiro vertebrado inicia-se na via sanguínea, onde ele entra em contato com o sistema complemento, o qual ele evade para penetrar em células e se multiplicar. O sistema complemento e um conjunto de proteínas séricas ativadas em cascata culminando com a lise do patógeno. Este sistema possui três vias de ativação; a via clássica, a via da lectina e a via alternativa. Vários estudos já apresentaram alguns mecanismos utilizados pelo T. cruzi para evadir a ação do sistema complemento. O presente trabalho propôs através de uma estratégia de bioinformática buscar novos mecanismos de evasão do T. cruzi ao sistema complemento. Com este objetivo desenvolvemos uma base de dados com dois grupos. Um grupo com dados de proteínas humanas de complemento e reguladoras ou inibidoras desse sistema e um outro grupo com informações de proteínas de tripanossomatideos, coletadas de tres bancos de dados proteicos distintos. As informações dos dois grupos foram confrontadas resultando em proteínas dos tripanossomatideos homologas a C1qBP (uma reguladora do sistema complemento em humanos). As proteínas homologas a C1qBP foram submetidas a analises de características biológicas e a fim de identificar as proteínas presentes nas três bases de dados simultaneamente, foram implementadas técnica de mineração de dados. Dentre as proteínas selecionadas , três eram de T. cruzi. Os resultados obtidos propõem um novo mecanismo de evasão ao sistema complemento utilizado pelo T. cruzi. Este mecanismo atua diretamente com o complexo antígeno anticorpo na ligação com a extremidade gC1q da proteína C1q, inibindo a ativação do componente C1 da via clássica do sistema complemento.Abstract: The Trypanosoma cruzi is the causative agent of Chagas disease, have a complex life cycle that alternates between vertebrate and invertebrate hosts. The parasite need evades the complement system to penetrate into eukaryotic cells for multiplying and produce the infection. The complement system is a group of serum proteins activated in cascade culminating with the lysis of the pathogen. This system has three activation pathways: the classical pathway, lectin pathway and alternative pathway. Several studies already shown some mechanisms used by Trypanosome cruzi to evade the action of the complement system. This work propose through a strategy of bioinformatics seek new evasion mechanisms of T. cruzi for complement system..We have developed a database with two data groups. The first data group including complement system proteins and regulators and inhibitors to complement. The second group contain informations about trypanosomatid proteins, collected from three different protein databanks. The information of the two groups were compared resulting in proteins homologous to C1qBP trypanosomes. Homologous proteins C1qBP were analyzed for biological characteristics as functional domain, cellular localization and protein structure . In order to identify the proteins present in the three databases we have used simultaneously data mining technique to ensure best coverage between them. Among the selected proteins were three T. cruzi. The results proposes a new mechanism to evade complement system used by T. cruzi. This mechanism work directly with the antigen antibody complex in connection with gC1q end of C1q protein, inhibiting the activation of the C1 component of the classical pathway of the complement system.112f. : il., tabs., algumas color.application/pdfDisponível em formato digitalBioinformáticaChagas, Doença deTrypanosoma cruziProcura in sílico por genes de tripanosomatídeos com possível função regulatória do sistema complemento humanoinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - D - FABIANO CARVALHO GOMES.pdfapplication/pdf6517029https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/39346/1/R%20-%20D%20-%20FABIANO%20CARVALHO%20GOMES.pdfa7162ca7cabba7ee600aed7837c2241bMD51open accessTEXTR - D - FABIANO CARVALHO GOMES.pdf.txtExtracted Texttext/plain184188https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/39346/2/R%20-%20D%20-%20FABIANO%20CARVALHO%20GOMES.pdf.txtc0c9a952d709b566f4cc228d78118c9eMD52open accessTHUMBNAILR - D - FABIANO CARVALHO GOMES.pdf.jpgR - D - FABIANO CARVALHO GOMES.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1233https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/39346/3/R%20-%20D%20-%20FABIANO%20CARVALHO%20GOMES.pdf.jpg6266e5025c83853682643dd31a0299daMD53open access1884/393462016-04-08 04:16:37.098open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/39346Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082016-04-08T07:16:37Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.none.fl_str_mv Procura in sílico por genes de tripanosomatídeos com possível função regulatória do sistema complemento humano
title Procura in sílico por genes de tripanosomatídeos com possível função regulatória do sistema complemento humano
spellingShingle Procura in sílico por genes de tripanosomatídeos com possível função regulatória do sistema complemento humano
Gomes, Fabiano Carvalho
Bioinformática
Chagas, Doença de
Trypanosoma cruzi
title_short Procura in sílico por genes de tripanosomatídeos com possível função regulatória do sistema complemento humano
title_full Procura in sílico por genes de tripanosomatídeos com possível função regulatória do sistema complemento humano
title_fullStr Procura in sílico por genes de tripanosomatídeos com possível função regulatória do sistema complemento humano
title_full_unstemmed Procura in sílico por genes de tripanosomatídeos com possível função regulatória do sistema complemento humano
title_sort Procura in sílico por genes de tripanosomatídeos com possível função regulatória do sistema complemento humano
author Gomes, Fabiano Carvalho
author_facet Gomes, Fabiano Carvalho
author_role author
dc.contributor.other.none.fl_str_mv Araya, Marcel Ivan Ramirez
Universidade Federal do Paraná. Setor de Educação Profissional e Tecnológica. Programa de Pós-Graduação em Bioinformática
dc.contributor.author.fl_str_mv Gomes, Fabiano Carvalho
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Steffens, Maria Berenice Reynaud
contributor_str_mv Steffens, Maria Berenice Reynaud
dc.subject.por.fl_str_mv Bioinformática
Chagas, Doença de
Trypanosoma cruzi
topic Bioinformática
Chagas, Doença de
Trypanosoma cruzi
description Orientadora : Maria Berenice Reynaud Steffens
publishDate 2014
dc.date.issued.fl_str_mv 2014
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2016-02-25T17:04:54Z
dc.date.available.fl_str_mv 2016-02-25T17:04:54Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/1884/39346
url http://hdl.handle.net/1884/39346
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv Disponível em formato digital
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 112f. : il., tabs., algumas color.
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/39346/1/R%20-%20D%20-%20FABIANO%20CARVALHO%20GOMES.pdf
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/39346/2/R%20-%20D%20-%20FABIANO%20CARVALHO%20GOMES.pdf.txt
https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/39346/3/R%20-%20D%20-%20FABIANO%20CARVALHO%20GOMES.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv a7162ca7cabba7ee600aed7837c2241b
c0c9a952d709b566f4cc228d78118c9e
6266e5025c83853682643dd31a0299da
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801860555868209152

Registros relacionados