Delimitação de espécies e filogeografia molecular comparada para Isbrueckerichthys (Siluriformes : Loricariidae) : a influência de captura de rios na história evolutiva

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Almeida, Rafael Bonfim de, 1989-
Data de Publicação: 2019
Tipo de documento: Tese
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFPR
Texto Completo: https://hdl.handle.net/1884/71311
Resumo: Orientador: Prof. Dr. Marcelo Ricardo Vicari
id UFPR_fc00ed5eb87b3798e7e27d9b5b3e1e5b
oai_identifier_str oai:acervodigital.ufpr.br:1884/71311
network_acronym_str UFPR
network_name_str Repositório Institucional da UFPR
repository_id_str 308
spelling Almeida, Rafael Bonfim de, 1989-Torres, Rodrigo AugustoUniversidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em GenéticaVicari, Marcelo Ricardo2021-06-29T16:48:38Z2021-06-29T16:48:38Z2019https://hdl.handle.net/1884/71311Orientador: Prof. Dr. Marcelo Ricardo VicariCoorientador: Prof. Dr. Rodrigo Augusto TorresTese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas - Genética. Defesa : Curitiba, 28/03/2019Inclui referências: p. 82-95Área de concentração: GenéticaResumo: A evolução e distribuição dos peixes neotropicais está intimamente ligada a eventos geológicos de dispersão. Um importante mecanismo que acaba por promover a dispersão e a evolução de espécies de peixes é o evento conhecido como captura de cabeceiras de rios. Estes eventos interconectam bacias adjacentes e isolam bacias que eram previamente conectadas, promovendo ao mesmo tempo o isolamento (vicariância) e a dispersão (geodispersão) de espécies de peixes. Nas regiões sul/sudeste do Brasil alterações do relevo promoveram eventos de captura de cabeceiras de rios e intercâmbio de fauna entre drenagens costeiras, com rios de bacias das regiões mais altas que compõem o escudo cristalino brasileiro. O gênero Isbrueckerichthys (Loricariidae: Neoplecostominae) é endêmico do sul e sudeste brasileiro, constituindo um grupo chave para as investigações dos eventos de captura de cabeceira nesta região. O objetivo deste trabalho foi inferir os padrões de distribuição geográfica e de diversidade genética de populações de Isbrueckerichthys em regiões limítrofes ao Arco de Ponta Grossa para as bacias dos rios Ribeira de Iguape e Tibagi e inferir sobre a história evolutiva associadas aos eventos geológicos de captura de cabeceiras de rios na diversificação do grupo. Para isso foram realizadas análises de identificação molecular e de delimitação de espécies utilizando DNA barcoding e GMYC usando o gene citocromo c oxidase subunidade I. Para as investigações populacionais foram utilizadas análises moleculares de variância e de diversidade, inferências filogenéticas e filogeográficas, relógio molecular, além de índices de genética de populações, como ST, diversidade haplotípica, diversidade nucleotídica, rede haplotípica, Teste de Mantel e análises bayesiana de estruturação. Isbrueckerichthys saxicola e Isbrueckerichthys calvus demonstram ser uma única categoria taxonômica tanto nas análises de divergência genética K2P (1,32% ±0,022%), quanto nas análises filogenéticas e de GMYC. As análises populacionais apontam para uma alta diversidade haplotípica (h)= 0,859 e diversidade nucleotídica (r) =0,05026. O teste de Mantel aponta para uma forte correlação entre a distribuição geográfica e a diversidade genética. As análises mostram ainda um cenário onde o ancestral de Isbrueckerichthys partiu das bacias costeiras do Atlântico para as terras mais altas através de um processo de captura de cabeceira de rios há cerca de 12 milhões de anos atrás. Os resultados confirmam a hipótese de que eventos de captura de cabeceiras na região do Arco de Ponta Grossa contribuíram para a diversidade de Isbrueckerichthys e moldaram a sua distribuição na bacia do rio Tibagi, e ainda, propõe a especiação incipiente entre I. saxicola e I. calvus nesta região.Abstract: The evolution and distribution of Neotropical fish are strictly linked to geologic events of dispersion. An important mechanism that promote the species dispersion and the evolution of fishes is the event known as headwaters capture or river capture. This kind of geological events interconnects adjacent basins and isolate the ones that were previously connected, promoting at same time the isolation (vicariance) and the dispersion (geodispersion) of fish species. In Brazilian south/southeast regions geographical alterations promoted events of river capture and faunal interchange between coastal drainages and higher of the Brazilian crystalline shield. The genus Isbrueckerichthys (Loricariidae: Neoplecostominae) is endemic of Brazilian south/southeast, making them a key group to understand the evolutive effects of river capture events in these regions. The aim of this work was to infer patterns of geographic distribution and genetic diversity of Isbrueckerichthys in bordering regions of the Ponta Grossa Arch for the Ribeira de Iguape and Tibagi rivers basins. Also, to prospect the evolutionary history associated with geologic events of river capture in the group diversification. For this purpose, were performed molecular identification and species delimitation analysis of DNA barcoding and GMYC using cytochrome c oxidase subunit I. For the populational investigations were performed Analysis of Molecular Variance and diversity, phylogenetic and phylogeographical inferences, molecular clock, besides the population genetics index, as ST, haplotipic diversity, nucleotic diversity, haplotipic diversity, haplotipic network, Mantel Test and bayesian analysis of structuration. I. calvus and I. saxicola behaves as a single taxonomic category both in relation to K2P genetic divergence (1,32% ±0,022%), as in GMYC and phylogenetic inferences. Populational analysis shown a high haplotipic diversity (h) = 0,859 and nucleotic diversity (r) = 0,05026. Mantel Test shown a strong positive correlation among geographic distribution and genetic diversity. Analysis also shown a scenario where the Isbrueckerichthys ancestral reaches the higher lands from the coastal Drainages through a river capture process about 12 million years ago. The results confirm the hypothesis that driver capture events in Ponta Grossa Arch region contributes for the diversity and shape their distribution in Tibagi river basin, and proposes the incipient speciation among I. saxicola e I. calvus in this region.1 arquivo (95 p.) : il.application/pdfBiogeografiaPeixes - Distribuição geograficaRiosBiodiversidadeFilogeografiaGenéticaDelimitação de espécies e filogeografia molecular comparada para Isbrueckerichthys (Siluriformes : Loricariidae) : a influência de captura de rios na história evolutivainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisporreponame:Repositório Institucional da UFPRinstname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)instacron:UFPRinfo:eu-repo/semantics/openAccessORIGINALR - T - RAFAEL BONFIM DE ALMEIDA.pdfapplication/pdf3166001https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/71311/1/R%20-%20T%20-%20RAFAEL%20BONFIM%20DE%20ALMEIDA.pdfcdbb8432166e643c010e5f6c11f2bb3dMD51open access1884/713112021-06-29 13:48:38.801open accessoai:acervodigital.ufpr.br:1884/71311Repositório de PublicaçõesPUBhttp://acervodigital.ufpr.br/oai/requestopendoar:3082021-06-29T16:48:38Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Delimitação de espécies e filogeografia molecular comparada para Isbrueckerichthys (Siluriformes : Loricariidae) : a influência de captura de rios na história evolutiva
title Delimitação de espécies e filogeografia molecular comparada para Isbrueckerichthys (Siluriformes : Loricariidae) : a influência de captura de rios na história evolutiva
spellingShingle Delimitação de espécies e filogeografia molecular comparada para Isbrueckerichthys (Siluriformes : Loricariidae) : a influência de captura de rios na história evolutiva
Almeida, Rafael Bonfim de, 1989-
Biogeografia
Peixes - Distribuição geografica
Rios
Biodiversidade
Filogeografia
Genética
title_short Delimitação de espécies e filogeografia molecular comparada para Isbrueckerichthys (Siluriformes : Loricariidae) : a influência de captura de rios na história evolutiva
title_full Delimitação de espécies e filogeografia molecular comparada para Isbrueckerichthys (Siluriformes : Loricariidae) : a influência de captura de rios na história evolutiva
title_fullStr Delimitação de espécies e filogeografia molecular comparada para Isbrueckerichthys (Siluriformes : Loricariidae) : a influência de captura de rios na história evolutiva
title_full_unstemmed Delimitação de espécies e filogeografia molecular comparada para Isbrueckerichthys (Siluriformes : Loricariidae) : a influência de captura de rios na história evolutiva
title_sort Delimitação de espécies e filogeografia molecular comparada para Isbrueckerichthys (Siluriformes : Loricariidae) : a influência de captura de rios na história evolutiva
author Almeida, Rafael Bonfim de, 1989-
author_facet Almeida, Rafael Bonfim de, 1989-
author_role author
dc.contributor.other.pt_BR.fl_str_mv Torres, Rodrigo Augusto
Universidade Federal do Paraná. Setor de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Genética
dc.contributor.author.fl_str_mv Almeida, Rafael Bonfim de, 1989-
dc.contributor.advisor1.fl_str_mv Vicari, Marcelo Ricardo
contributor_str_mv Vicari, Marcelo Ricardo
dc.subject.por.fl_str_mv Biogeografia
Peixes - Distribuição geografica
Rios
Biodiversidade
Filogeografia
Genética
topic Biogeografia
Peixes - Distribuição geografica
Rios
Biodiversidade
Filogeografia
Genética
description Orientador: Prof. Dr. Marcelo Ricardo Vicari
publishDate 2019
dc.date.issued.fl_str_mv 2019
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2021-06-29T16:48:38Z
dc.date.available.fl_str_mv 2021-06-29T16:48:38Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/doctoralThesis
format doctoralThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://hdl.handle.net/1884/71311
url https://hdl.handle.net/1884/71311
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv 1 arquivo (95 p.) : il.
application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFPR
instname:Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron:UFPR
instname_str Universidade Federal do Paraná (UFPR)
instacron_str UFPR
institution UFPR
reponame_str Repositório Institucional da UFPR
collection Repositório Institucional da UFPR
bitstream.url.fl_str_mv https://acervodigital.ufpr.br/bitstream/1884/71311/1/R%20-%20T%20-%20RAFAEL%20BONFIM%20DE%20ALMEIDA.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv cdbb8432166e643c010e5f6c11f2bb3d
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFPR - Universidade Federal do Paraná (UFPR)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1813898727389134848