DNA barcode como ferramenta na identificação de larvas de peixes da plataforma continental amazônica.

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: PANTOJA, Jéssica dos Santos Lima
Data de Publicação: 2024
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRA
Texto Completo: http://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/2326
Resumo: Projeto Amazomix.
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spelling DNA barcode como ferramenta na identificação de larvas de peixes da plataforma continental amazônica.DNA barcodeLarva de peixeIctioplânctonMolecular analysisPeixe amazônicoIchthyoplanktonNorthern coast of BrazilProjeto Amazomix.A fase larval da vida dos peixes é caracterizada como o estágio de maior vulnerabilidade e nessa fase ocorre a maior taxa de mortalidade. Estudos relacionados a esse estágio ainda são escassos, no entanto estudar essa fase de vida desses organismos é de grande importância, pois fornece informações sobre a biologia e taxonomia das espécies, assim como, ajuda na identificação das áreas de desova e no monitoramento dos estoques pesqueiros. O método morfológico, com auxílio de guias de identificação, é o método mais utilizado para a identificação das larvas de peixes, no entanto, essa metodologia ainda é um obstáculo, pois há uma grande carência desses guias e grande parte deles é local ou regional e não contempla a costa norte brasileira .A identificação incerta das larvas de peixes pode trazer problemas relacionados a estratégiasde manejo de espécies de importância comercial e, consequentemente, as atividades pesqueiras. Com isso, muitos pesquisadores internacionais passaram a testar e utilizar a análise molecular, em alguns grupos. Atualmente, a técnica mais utilizada é a técnica doDNA Barcode, através do sequenciamento do gene da subunidade I citocromo c oxidasemitocondrial (COI), sendo o marcador molecular mais utilizado para peixes e que permite a identificação e a diferenciação entre as espécies, de forma mais precisa. No Brasil, o uso dessa técnica para identificar as larvas de peixes marinhos ainda é raro e na costa norte brasileira o uso dessa técnica para larvas de peixes ainda não foi realizado. Este trabalho possui como objetivo testar a eficácia da técnica do DNA Barcode e avaliar a precisão da identificação morfológica para as larvas de peixes coletadas na plataforma continental amazônica. A área de estudo se concentrou na plataforma continental amazônica e foram analisadas 12 estações de coletas. As larvas foram coletadas entresetembro e outubro de 2021 e fazem parte do projeto de cooperação franco-brasileira Amazon shelf mixing and its impacts in the ecosystems – AMAZOMIX. As amostras foram coletadas a bordo do navio de pesquisa francês Antares, utilizando um amostra do r múltiplo do tipo Multinet Midi (5 redes de 300μm), coletando em diferentes profundidades na coluna d’água. Após coletadas, as amostras foram fixadas em etanol a 90% e refrigeradas. Foram identificadas 343 larvas de peixes utilizando o método morfológico, classificadas em 10 ordens, 30 famílias, 29 gêneros e 17 espécies. Para análise de DNA Barcode, foram selecionados 76 indivíduos de cada nível taxonômico. Um fragmento de aproximadamente 600pb de 54 larvas, abrangendo 8 ordens, 31 famílias, 16 gêneros e 34 espécies, foisubmetido à análise de DNA Barcode. Houve uma discordância de 27% entre os resultados do DNA Barcode e a identificação morfológica.Estes resultados indicam que o DNA Barcode, combinado com a identificação morfológica, pode ser uma ferramenta valiosa para uma identificação precisa das larvas de peixes da plataforma continental amazônica.The larval stage of fish life is characterized as the period of greatest vulnerability, during which the highest mortality rate occurs. Studies related to this stage are still very scarce; however, studying this life stage of these organisms is of great importance as it provides information about the biology and taxonomy of species, as well as helping in the identification of spawning areas and the monitoring of fish stocks. The morphological method, with the aid of identification guides, is the most commonly used method for identifying fish larvae. However, this methodology remains a challenge because there is a significant shortage of these guides, and most of them are local or regional and do not cover the northern coast of Brazil. Uncertain identification of fish larvae can lead to problems related to management strategies for commercially important species and, consequently, fishing activities. Therefore, many international researchers have started testing and using molecular analysis in some groups. Currently, the most widely used technique is DNA Barcoding, through the sequencing of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene, which is the most commonly used molecular marker for fish and allows for more precise identification and differentiation between species. In Brazil, the use of this technique to identify marine fish larvae is still rare, and on the northern coast of Brazil, this technique has not yet been applied to fish larvae. This study aims to test the efficacy of the DNA Barcoding technique and evaluate the accuracy of morphological identification for fish larvae collected on the Amazon continental shelf. The study area focused on the Amazon continental shelf, and 12 sampling stations were analyzed. The larvae were collected between September and October 2021 and are part of the French-Brazilian cooperation project Amazon shelf mixing and its impacts in the ecosystems – AMAZOMIX. The samples were collected aboard the French research vessel Antares, using a Multinet Midi sampler (5 nets of 300 μm), collecting at different depths in the water column. After collection, the samples were fixed in 90% ethanol and refrigerated. A total of 343 fish larvae were identified using the morphological method, classified into 10 orders, 30 families, 29 genera, and 17 species. For DNA Barcoding analysis, 76 individuals from each taxonomic level were selected. A fragment of approximately 600bp from 54 larvae, encompassing 8 orders, 31 families, 16 genera, and 34 species, was subjected to DNA Barcoding analysis. There was a 27% discrepancy between the DNA Barcoding results and the morphological identification. These results indicate that DNA Barcoding, combined with morphological identification, can be a valuable tool for precise identification of fish larvae on the Amazon continental shelf.UFRA - Campus Belémhttp://lattes.cnpq.br/8911516573302586HAMOY, Igor GuerreiroCAMPOS, Paula Nepomucenohttp://lattes.cnpq.br/4120043093712772PANTOJA, Jéssica dos Santos Lima2024-08-23T19:36:08Z2024-08-23T19:36:08Z2024-08-23info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfPANTOJA, Jéssica dos Santos Lima. DNA barcode como ferramenta na identificação de larvas de peixes da plataforma continental amazônica. Orientador: Igor Guerreiro Hamoy. 46 f. 2024. Dissertação (Mestrado em Aquicultura e Recursos Aquáticos Tropicais) - Universidade Federal Rural da Amazônia, Belém, 2024. Disponível em: http://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/2326. Acesso em: .CDD: 574.52636072081http://repositorio.ufra.edu.br/jspui/handle/123456789/2326Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 United Stateshttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/us/info:eu-repo/semantics/openAccessporreponame:Repositório Institucional da UFRAinstname:Universidade Federal Rural da Amazônia (UFRA)instacron:UFRA2024-08-23T19:39:35Zoai:repositorio.ufra.edu.br:123456789/2326Repositório Institucionalhttp://repositorio.ufra.edu.br/jspui/PUBhttp://repositorio.ufra.edu.br/oai/requestrepositorio@ufra.edu.br || riufra2018@gmail.comopendoar:2024-08-23T19:39:35Repositório Institucional da UFRA - Universidade Federal Rural da Amazônia (UFRA)false
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