Caracterização molecular de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense do Nordeste, Sudeste e Sul do Brasil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Costa, Shirley Nascimento
Data de Publicação: 2013
Tipo de documento: Dissertação
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRB
Texto Completo: http://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/906
Resumo: A bananicultura é fundamental para o agronegócio brasileiro. Contudo, diversos problemas fitossanitários limitam a sua produção. O mal-do-Panamá, causado por Fusariumoxysporum f. sp. cubense (Foc), é uma das principais preocupações, visto que esse fungo é endêmico em todas as regiões produtoras e é habitante do solo, o que dificulta o manejo da doença. O objetivo deste trabalho foi compreender a estrutura populacionalde Foc em diferentes regiões produtoras do Brasil, uma vez que essas informações são relevantes para o entendimento desse patossistema. Para isso, foram utilizados 214 isolados de Foc das regiões Nordeste, Sudeste e Sul do país, os quais foram caracterizados por meio de marcadores microssatélites (SSR). Os marcadores separaram os isolados em 52 haplótipos distintos. Não foi encontrada correlação entre distâncias genéticas e distâncias geográficas para as regiões Sudeste e Nordeste. No entanto, para a região Sul a correlação foi moderada, e significativa. Por meio da AMOVA constatou-se que 67,9% da variação total ocorreu dentro dos estados, ou seja, entre os municípios, e 25,3% entre os estados. Com base na composição genética dos isolados, foi verificada existência de 16 prováveis grupos genéticos ancestrais. Entretanto, tais grupos estão distribuídos nas diferentes regiões geográficas e cultivares de onde foram obtidos. Os resultados indicam que os isolados dos diferentes estados compõem uma única população. Assim, as diferenças genéticas entre isolados podem ser, devidas à mistura de diferentes linhagens clonais. A diversidade encontrada reafirma a necessidade de estudos com este patógeno, pois essa característica pode estar relacionada ao seu potencial evolutivo e, possivelmente, à sua capacidade de suplantar a resistência das cultivares geradas por programas de melhoramento genético.
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spelling 2016-01-072013-03COSTA, Shirley Nascimento. Caracterização molecular de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense do Nordeste, Sudeste e Sul do Brasil. 2013. 71 f. Dissertação (Mestrado Profissional em Microbiologia Agrícola) - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e Biológicas, Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, Cruz das Almas, 2013.http://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/906A bananicultura é fundamental para o agronegócio brasileiro. Contudo, diversos problemas fitossanitários limitam a sua produção. O mal-do-Panamá, causado por Fusariumoxysporum f. sp. cubense (Foc), é uma das principais preocupações, visto que esse fungo é endêmico em todas as regiões produtoras e é habitante do solo, o que dificulta o manejo da doença. O objetivo deste trabalho foi compreender a estrutura populacionalde Foc em diferentes regiões produtoras do Brasil, uma vez que essas informações são relevantes para o entendimento desse patossistema. Para isso, foram utilizados 214 isolados de Foc das regiões Nordeste, Sudeste e Sul do país, os quais foram caracterizados por meio de marcadores microssatélites (SSR). Os marcadores separaram os isolados em 52 haplótipos distintos. Não foi encontrada correlação entre distâncias genéticas e distâncias geográficas para as regiões Sudeste e Nordeste. No entanto, para a região Sul a correlação foi moderada, e significativa. Por meio da AMOVA constatou-se que 67,9% da variação total ocorreu dentro dos estados, ou seja, entre os municípios, e 25,3% entre os estados. Com base na composição genética dos isolados, foi verificada existência de 16 prováveis grupos genéticos ancestrais. Entretanto, tais grupos estão distribuídos nas diferentes regiões geográficas e cultivares de onde foram obtidos. Os resultados indicam que os isolados dos diferentes estados compõem uma única população. Assim, as diferenças genéticas entre isolados podem ser, devidas à mistura de diferentes linhagens clonais. A diversidade encontrada reafirma a necessidade de estudos com este patógeno, pois essa característica pode estar relacionada ao seu potencial evolutivo e, possivelmente, à sua capacidade de suplantar a resistência das cultivares geradas por programas de melhoramento genético.The banana production is a major component of Brazilian agribusiness. However, several problems limit the production of this crop. Panamá disease, caused by the fungus Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), is a major concern since the only control measure is the use of resistant varieties. Foc is endemic to all producing regions, and is soilborne, which hinders this disease’s management. The objective of this study was to understand the population structure of Foc in different producing regions of Brazil. Therefore, 214 Foc isolates from the Northeast, Southeast and Southern regions were used and characterised by microsatellite markers (SSR). The markers sorted the isolates into 52 distinct haplotypes. There was no correlation between the genetic and geographical distances for the Southeast and Northeast region. However, a moderate significant the correlation was moderate and highly significant for the Southern region. The AMOVA analysis showed that 67.9% of the total variation occurred within the states. Based on the isolates’ genetic constitution, 16 genetic clusters were formed. These were distributed into different geographical regions and cultivars from which they were obtained. Results indicate that isolates from different states comprise a single population, which is predominantly clonal. Moreover, the genetic differences between isolates are due to the mixture of different clonal lineages. The encountered diversity points to the need for additional studies since that characteristic might be related to Foc’s evolutionary potential and possibly to its ability to overcome the resistance of by breeding programs’ generated cultivars.porUniversidade Federal do Recôncavo da BahiaPrograma de Pós-Graduação em Microbiologia AgrícolaUFRBBrasilCCAAB - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e BiológicasCNPQ:CIÊNCIAS AGRÁRIASPanama disease - Phytopathogenic fungiBanana - AnalysisMicrosatellites - Genetic diversityMal-do-Panamá - Fungos fitopatogênicosBanana - AnáliseMicrossatélites - Diversidade genéticaCaracterização molecular de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense do Nordeste, Sudeste e Sul do Brasilinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisMestrado ProfissionalLaranjeira, Francisco FerrazHaddad, FernandoMatos, Aristóteles Pires deMoreira, Ricardo Franco CunhaCosta, Shirley Nascimentoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRBinstname:Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB)instacron:UFRBTEXTShirley Costa - Dissertação Mestrado Microbiologia.pdf.txtShirley Costa - Dissertação Mestrado Microbiologia.pdf.txtExtracted texttext/plain104670http://ri.ufrb.edu.br/jspui/bitstream/123456789/906/3/Shirley%20Costa%20-%20Disserta%c3%a7%c3%a3o%20Mestrado%20Microbiologia.pdf.txta2ab9c4e1892efe422add67a97703970MD53LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-82004http://ri.ufrb.edu.br/jspui/bitstream/123456789/906/2/license.txtf99c6b30d99fdcdcf2a96ea592a16736MD52ORIGINALCaracterizacao_Molecular_Isolados_Dissertacao_2013.pdfCaracterizacao_Molecular_Isolados_Dissertacao_2013.pdfapplication/pdf1215405http://ri.ufrb.edu.br/jspui/bitstream/123456789/906/1/Caracterizacao_Molecular_Isolados_Dissertacao_2013.pdfa20f28f4bf8119cfa1fb865445e0f493MD51123456789/9062023-06-20 11:34:25.347oai:ri.ufrb.edu.br:123456789/906TElDRU4/QSBERSBBUk1BWkVOQU1FTlRPIEUgRElTVFJJQlVJPz9PIE4/Ty1FWENMVVNJVkEKCkFvIGNvbmNvcmRhciBjb20gZXN0YSBsaWNlbj9hLCB2b2M/KHMpIGF1dG9yKGVzKSBvdSB0aXR1bGFyKGVzKSBkb3MgZGlyZWl0b3MgYXV0b3JhaXMgYXMgb2JyYSBkZXNjcml0YSBjb25jZWRlKG0pID8gVW5pdmVyc2lkYWRlIEZlZGVyYWwgZG8gUmVjP25jYXZvIEJhaWFubywgZ2VzdG9yYSBkbyByZXBvc2l0P3JpbyBSSS1VRlJCLCBvIGRpcmVpdG8gbj9vLWV4Y2x1c2l2byBkZSByZXByb2R1emlyLCBjb252ZXJ0ZXIgKGNvbW8gZGVmaW5pZG8gYWJhaXhvKSBlL291IGRpc3RyaWJ1aXIgbyBkb2N1bWVudG8gZGVwb3NpdGFkbyBlbSBmb3JtYXRvIGltcHJlc3NvLCBlbGV0cj9uaWNvIG91IGVtIHF1YWxxdWVyIG91dHJvIG1laW8uClZvYz8ocykgY29uY29yZGEobSkgcXVlIGEgVW5pdmVyc2lkYWRlIEZlZGVyYWwgZG8gUmVjP25jYXZvIEJhaWFubywgZ2VzdG9yYSBkbyByZXBvc2l0P3JpbyBSSS1VRlJCLCBwb2RlLCBzZW0gYWx0ZXJhciBvIGNvbnRlP2RvLCBjb252ZXJ0ZXIgbyBhcnF1aXZvIGRlcG9zaXRhZG8gYSBxdWFscXVlciBtZWlvIG91IGZvcm1hdG8gY29tIGZpbnMgZGUgcHJlc2VydmE/P28uClZvYz8ocykgdGFtYj9tIGNvbmNvcmRhKG0pIHF1ZSBhIFVuaXZlcnNpZGFkZSBGZWRlcmFsIGRvIFJlYz9uY2F2byBCYWlhbm8sIGdlc3RvcmEgZG8gcmVwb3NpdD9yaW8gUkktVUZSQiwgcG9kZSBtYW50ZXIgbWFpcyBkZSB1bWEgYz9waWEgZGVzdGUgZGVwb3NpdG8gcGFyYSBmaW5zIGRlIHNlZ3VyYW4/YSwgYmFjay11cCBlIG91IHByZXNlcnZhPz9vLgpWb2M/KHMpIGRlY2xhcmEobSkgcXVlIGEgYXByZXNlbnRhPz9vIGRvIHNldSB0cmFiYWxobyA/IG9yaWdpbmFsIGUgcXVlIHZvYz8ocykgcG9kZShtKSBjb25jZWRlciBvcyBkaXJlaXRvcyBjb250aWRvcyBuZXN0YSBsaWNlbj9hLgpWb2M/KHMpIHRhbWI/bSBkZWNsYXJhKG0pIHF1ZSBvIGVudmlvID8gZGUgc2V1IGNvbmhlY2ltZW50byBlIG4/byBpbmZyaW5nZSBvcyBkaXJlaXRvcyBhdXRvcmFpcyBkZSBvdXRyYSBwZXNzb2Egb3UgaW5zdGl0dWk/P28uCkNhc28gbyBkb2N1bWVudG8gYSBzZXIgZGVwb3NpdGFkbyBjb250ZW5oYSBtYXRlcmlhbCBwYXJhIG8gcXVhbCB2b2M/KHMpIG4/byBkZXQ/bSBhIHRpdHVsYXJpZGFkZSBkb3MgZGlyZWl0b3MgZGUgYXV0b3JhaXMsIHZvYz8ocykgZGVjbGFyYShtKSBxdWUgb2J0ZXZlIGEgcGVybWlzcz9vIGlycmVzdHJpdGEgZG8gdGl0dWxhciBkb3MgYXV0b3JhaXMgZGUgY29uY2VkZXIgPyBVbml2ZXJzaWRhZGUgRmVkZXJhbCBkbyBSZWM/bmNhdm8gQmFpYW5vLCBnZXN0b3JhIGRvIHJlcG9zaXQ/cmlvIFJJLVVGUkIsIG9zIGRpcmVpdG9zIHJlcXVlcmlkb3MgcG9yIGVzdGEgbGljZW4/YSBlIHF1ZSBvcyBtYXRlcmlhaXMgZGUgcHJvcHJpZWRhZGUgZGUgdGVyY2Vpcm9zLCBlc3Q/byBkZXZpZGFtZW50ZSBpZGVudGlmaWNhZG9zIGUgcmVjb25oZWNpZG9zIG5vIHRleHRvIG91IGNvbnRlP2RvIGRhIGFwcmVzZW50YT8/by4KCkNBU08gTyBUUkFCQUxITyBERVBPU0lUQURPIFRFTkhBIFNJRE8gRU5DQU1JTkhBRE8gT1UgQVBPSUFETyBQT1IgVU0gT1JHP08sIFFVRSBOP08gQSBJTlNUSVRVST8/TyBERVNURSBSRVBPU0lUP1JJTzogVk9DPyBERUNMQVJBIFRFUiBDVU1QUklETyBUT0RPUyBPUyBESVJFSVRPUyBERSBSRVZJUz9PIEUgUVVJU1FVRVIgT1VUUkFTIE9CUklHQT8/RVMgUkVRVUVSSURBUyBQRUxPIENPTlRSQVRPIE9VIEFDT1JETy4KCk8gcmVwb3NpdD9yaW8gaWRlbnRpZmljYXI/IGNsYXJhbWVudGUgbyBzZXUocykgbm9tZShzKSBjb21vIGF1dG9yKGVzKSBvdSB0aXR1bGFyKGVzKSBkbyBkaXJlaXRvIGRlIGF1dG9yKGVzKSBkbyBkb2N1bWVudG8gc3VibWV0aWRvIGUgZGVjbGFyYSBxdWUgbj9vIGZhcj8gcXVhbHF1ZXIgYWx0ZXJhPz9vIGFsP20gZGFzIHBlcm1pdGlkYXMgcG9yICBlc3RhIGxpY2VuP2EgLgoKRepositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.ufrb.edu.br/oai/requestnutin.cidoc@proplan.ufrb.edu.bropendoar:27582023-06-20T14:34:25Repositório Institucional da UFRB - Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB)false
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