Identificação, caracterização e validação de marcadores minissatélites para o mamoeiro

• Autor(a) principal: Oliveira, Gilmara Alvarenga Fachardo
• Data de Publicação: 2015
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRB
• Texto Completo: http://localhost:8080/handle/prefix/1047
• topic: CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA; Mamão; Melhoramento Vegetal; Carica papaya L.; Polimorfismo; Mamoeiro; Recursos Genéticos do Mamoeiro

A identificação de polimorfismos em espécies com baixa variabilidade molecular como o mamoeiro (Carica papaya L.) é um desafio para a pesquisa. Assim, o objetivo desse estudo foi identificar, caracterizar e validar o polimorfismo de marcadores minissatélites visando o manejo, conservação e uso dos recursos genéticos do mamoeiro. O genoma depositado no banco de dados foi utilizado para identificação de locos minissatélites com motivos de 6 a 500 pares de bases (pb). Foram identificados 1.730 minissatélites com no mínimo seis repetições (média de 1 a cada 156Kb), cujo conteúdo médio de GC foi de 28,84% e média de 9,27 repetições por loco. Motivos com até 20 bases foram os mais frequentes (71,5%). O polimorfismo de 82 minissatélites foi avaliado em 24 acessos de mamoeiro e comparado com marcadores microssatélites, cujos resultados demostraram a presença de 3,10 e 3,57 alelos por loco, respectivamente. Maior heterozigosidade esperada (He=0,52), observada (Ho=0,16), conteúdo de informação polimórfica (PIC=0,47) e diversidade de Shannon-Wiener (H’=1,10) foi verificada nos microssatélites em comparação com os minissatélites (He=0,42, Ho=0,11, PIC=0,38 e H’=0,85, respectivamente), possivelmente em função do hermafroditismo da maioria dos acessos avaliados. Contudo, a probabilidade de exclusão de paternidade e de identidade foi elevada para ambos os marcadores. Com relação à estrutura populacional, ambos marcadores indicaram a organização do germoplasma em dois grupos (K=2), embora os minissatélites tenham apontado a presença de uma subestrutura (K=4). Este é um dos primeiros trabalhos relacionado ao desenvolvimento de minissatélites para o mamoeiro, cujo menor polimorfismo em comparação com os microssatélites pode ser compensado pelo melhor poder de discriminação dos alelos e maior acurácia na identificação genotípica dos indivíduos.