Estudo genético em populações de Mugil curema (Valenciennes, 1836), em áreas de proteção ambiental utilizando marcadores moleculares ISSR
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Data de Publicação: | 2019 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRB |
Texto Completo: | http://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/2474 |
Resumo: | Mugil curema é popularmente conhecida como tainha e parati, são espécies eurialinas e euritérmicas, que ocorrem em águas costeiras e estuarinas de todo o mundo. No nordeste brasileiro, esta espécie é uma das mais capturadas pela pesca artesanal. Os estudos genéticos são de grande importância para melhor compreensão das interações ambientais sobre a ecologia das espécies, pois viabilizam o manejo e conservação dos estoques. O presente trabalho teve como objetivo, caracterizar a diversidade genética de duas populações da espécie M. curema na RESEX de Canavieiras-BA e no estuário de Jaguaripe-BA, por meio do marcador molecular ISSR. Foram amostradas em diversos pontos pesqueiros, um total de 60 indivíduos em Canavieiras e 30 indivíduos em Jaguaripe. Uma alíquota da nadadeira caudal foi submetida ao protocolo de solução salina para extração de DNA, depois as amostras foram quantificadas em gel de agarose e submetidas à amplificação com oito primers; (GA)8C; (AG)8C; (GA)8T; (AG)8YC; (GA)8YT; (GA)8YG; (GGAT)4; (AAGC)4. Os resultados a partir da análise dos padrões de bandas foram transformados em matriz numérica binária com presença/ausência de banda. Foi gerado um total de 137 fragmentos, sendo 117 polimórficos (85.5%). A média do Índice de Conteúdo Polimórfico (PIC) foi 0,86 e mostrou-se efetivo por possuir em todos os primers valor superior a 0,5. Para os parâmetros de diversidade genética, a percentagem de bandas polimórficas foi de 85,40%, o Índice de Shannon variou entre as populações de Canavieiras 0,3506(σ± 0.2187) e Jaguaripe 0,4984(σ±0.2109). Entre as populações, a média da identidade genética de Nei (H) foi 0,7832e a média da diversidade genética 0,2444, o número de migrante por geração foi 1,7. A AMOVA forneceu uma estimativa que grande parte da variabilidade genética está concentrada dentro das populações (53,14%), com índice FST de 0.46857 indicando uma forte estruturação genética. Estes resultados moleculares evidenciam que estes organismos partilham poucos alelos em comum, indicando baixo fluxo gênico entre as populações evidenciando uma variabilidade genéticaintrapopulacional. Assim para o aumento da variabilidade genética desta espécie recomenda-se redução da exploração nesses estuários, para um desenvolvimento mais sutentável da pesca até que os níveis de variabilidade genética sejam considerados satisfatórios. |
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2023-06-29T14:14:18Z2023-06-29T14:14:18Z2019-02-15http://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/2474Mugil curema é popularmente conhecida como tainha e parati, são espécies eurialinas e euritérmicas, que ocorrem em águas costeiras e estuarinas de todo o mundo. No nordeste brasileiro, esta espécie é uma das mais capturadas pela pesca artesanal. Os estudos genéticos são de grande importância para melhor compreensão das interações ambientais sobre a ecologia das espécies, pois viabilizam o manejo e conservação dos estoques. O presente trabalho teve como objetivo, caracterizar a diversidade genética de duas populações da espécie M. curema na RESEX de Canavieiras-BA e no estuário de Jaguaripe-BA, por meio do marcador molecular ISSR. Foram amostradas em diversos pontos pesqueiros, um total de 60 indivíduos em Canavieiras e 30 indivíduos em Jaguaripe. Uma alíquota da nadadeira caudal foi submetida ao protocolo de solução salina para extração de DNA, depois as amostras foram quantificadas em gel de agarose e submetidas à amplificação com oito primers; (GA)8C; (AG)8C; (GA)8T; (AG)8YC; (GA)8YT; (GA)8YG; (GGAT)4; (AAGC)4. Os resultados a partir da análise dos padrões de bandas foram transformados em matriz numérica binária com presença/ausência de banda. Foi gerado um total de 137 fragmentos, sendo 117 polimórficos (85.5%). A média do Índice de Conteúdo Polimórfico (PIC) foi 0,86 e mostrou-se efetivo por possuir em todos os primers valor superior a 0,5. Para os parâmetros de diversidade genética, a percentagem de bandas polimórficas foi de 85,40%, o Índice de Shannon variou entre as populações de Canavieiras 0,3506(σ± 0.2187) e Jaguaripe 0,4984(σ±0.2109). Entre as populações, a média da identidade genética de Nei (H) foi 0,7832e a média da diversidade genética 0,2444, o número de migrante por geração foi 1,7. A AMOVA forneceu uma estimativa que grande parte da variabilidade genética está concentrada dentro das populações (53,14%), com índice FST de 0.46857 indicando uma forte estruturação genética. Estes resultados moleculares evidenciam que estes organismos partilham poucos alelos em comum, indicando baixo fluxo gênico entre as populações evidenciando uma variabilidade genéticaintrapopulacional. Assim para o aumento da variabilidade genética desta espécie recomenda-se redução da exploração nesses estuários, para um desenvolvimento mais sutentável da pesca até que os níveis de variabilidade genética sejam considerados satisfatórios.Mugil curema is popularly known as mullet and parati are eurythermal and eurythermal species that occur in coastal and estuarine waters around the world. In northeast Brazil, this issue is one of the most captured by artisanal fishing. Genetic studies are of great importance for a better understanding of the environmental interactions on the ecology of the species, since they enable the management and conservation of the stocks. The present work aimed to characterize a genetic sample of two species of the species. Curative in the RESEX of Canavieiras-BA and in the estuary of Jaguaripe-BA, through molecular marker ISSR. They were sampled over a period of 60 years in Canavieiras and 30 years in Jaguaripe. An aliquot of the caudal fin was submitted to the saline protocol for DNA extraction, after being quantified in agarose gel and submitted to amplification with primers; (GA) 8C; (AG) 8C; (GA) 8T; (AG) 8YC; (GA) 8YT; (GA) 8YG; (GGAT) 4; (AAGC) 4. The results of the band pattern analysis were transformed into binary numerical matrix with band presence / absence. A total of 137 fragments were generated, being 117 polymorphic (85.5%). The mean of the Polymorphic Index (PIC) was 0.86 and proved to be effective in having all primers higher than 0.5. Parameter of genetic order, the percentage of polymorphic bands was 85.40%, the Shannon Index varied between the variables of Canavieiras 0.3506(σ ± 0.2187) and Jaguaripe 0.4898(σ ± 0.2109 ). Among the populations, the number of migrants per generation was equal to 0.7832 and the number of the race family was 0.244, 1.70. The AMOVA provided a variable percentage of the genetic variability is concentrated within the populations (53.14%), with FST index of 0.46857. between populations showing intra-population genetic variability. In order to increase the variation of the capacity to reduce the weight, for a greater development of the fish up to the levels of variability, the temperature and the results are satisfactory.porUniversidade Federal do Recôncavo da BahiaUFRBBrasilCCAAB - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e BiológicasCNPQ::ENGENHARIASTainha - FishGenetic variabilityArtisanal fishingAPA (Environmental Protection Areas)Molecular markersTainha - PeixeVariabilidade genéticaPesca artesanalAPA (Áreas de Proteção Ambiental)Marcadores molecularesEstudo genético em populações de Mugil curema (Valenciennes, 1836), em áreas de proteção ambiental utilizando marcadores moleculares ISSRinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisBachareladoFonteles, Soraia Barreto AguiarMoreira, Ricardo Franco CunhaAndréa, Maria VanderlyPereira, Elaine Costa CerqueiraSantos, Joemille Silva dosinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRBinstname:Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB)instacron:UFRBORIGINALEstudo_Genetico_Populacoes_TCC_2019.pdfEstudo_Genetico_Populacoes_TCC_2019.pdfapplication/pdf1045707http://ri.ufrb.edu.br/jspui/bitstream/123456789/2474/1/Estudo_Genetico_Populacoes_TCC_2019.pdf3ea568459845cc20ff386fa7b1d15090MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81930http://ri.ufrb.edu.br/jspui/bitstream/123456789/2474/2/license.txt17dd64d7a271c2bbd8e88fd80624d4a1MD52123456789/24742023-06-29 11:14:18.716oai:ri.ufrb.edu.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.ufrb.edu.br/oai/requestnutin.cidoc@proplan.ufrb.edu.bropendoar:27582023-06-29T14:14:18Repositório Institucional da UFRB - Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB)false |
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