Caracterização molecular de acessos do banco ativo de germoplasma de citros da Embrapa Mandioca e Fruticultura
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2010 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRB |
Texto Completo: | http://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/2283 |
Resumo: | O Banco Ativo de Germoplasma de Citros, localizado no campo experimental da Embrapa Mandioca e Fruticultura, Cruz das Almas-BA, contém aproximadamente 800 acessos de Citrus e espécies afins, muitos com ascendência desconhecida. Assim, este trabalho objetivou a caracterização, via marcadores ISSR, de 83 acessos do banco de Germoplasma de Citros, a fim de determinar o nível de dissimilaridade genética entre os acessos da coleção. Para tanto, DNA genômico total foi extraído, quantificado e genotipado através da utilização de 9 iniciadores ISSR. Um total de 47 marcadores foi identificado, sendo 39 polimórficos (82,98%) e 8 monomórficos (17,02%). Os programas computacionais GENE e MEGA-4, foram utilizados para gerar uma matriz de dissimilaridade e dendograma, respectivamente, revelando a formação de cinco grandes grupos entre os acessos. A maior dissimilaridade observada foi entre os acessos Ilhoa de Goiânia e Oneco, oriundos das espécies C. sinensis e C. reticulata, respectivamente. No entanto, para uma caracterização mais completa desses genótipos faz-se necessária a identificação de um maior número de marcadores ISSR. |
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2023-05-16T17:35:27Z2023-05-16T17:35:27Z2010-12-16http://ri.ufrb.edu.br/jspui/handle/123456789/2283O Banco Ativo de Germoplasma de Citros, localizado no campo experimental da Embrapa Mandioca e Fruticultura, Cruz das Almas-BA, contém aproximadamente 800 acessos de Citrus e espécies afins, muitos com ascendência desconhecida. Assim, este trabalho objetivou a caracterização, via marcadores ISSR, de 83 acessos do banco de Germoplasma de Citros, a fim de determinar o nível de dissimilaridade genética entre os acessos da coleção. Para tanto, DNA genômico total foi extraído, quantificado e genotipado através da utilização de 9 iniciadores ISSR. Um total de 47 marcadores foi identificado, sendo 39 polimórficos (82,98%) e 8 monomórficos (17,02%). Os programas computacionais GENE e MEGA-4, foram utilizados para gerar uma matriz de dissimilaridade e dendograma, respectivamente, revelando a formação de cinco grandes grupos entre os acessos. A maior dissimilaridade observada foi entre os acessos Ilhoa de Goiânia e Oneco, oriundos das espécies C. sinensis e C. reticulata, respectivamente. No entanto, para uma caracterização mais completa desses genótipos faz-se necessária a identificação de um maior número de marcadores ISSR.The Active Germplasm Bank of Citrus, located at Embrapa Mandioca e Fruticultura, Cruz das Almas-BA, contains about 800 accessions of Citrus and related species, many from unknown ancestry. The level of genetic diversity present in this collection so far remains unknown. This study aimed to characterize, through the ISSR markers, 83 accessions from the Citrus Germplasm Bank in order to determine the level and organization of genetic diversity in the collection. In order to do so, total genomic DNA was extracted, quantified and genotyped by using 9 ISSR primers. A total of 47 markers were identified, from which 39 were polymorphic (82.98%) and monomorphic 8 (17.02%). The computer programs GENE and MEGA-4 were used to generate a dissimilarity matrix and a dendrogram, respectively, revealing the formation of five major groups among the accessions. The greatest dissimilarity was observed among accessions Ilhoa Goiânia and Oneco, provenient from the species C. sinensis and C. reticulata, respectively. However, for a more complete characterization of these genotypes it is necessary to identify a larger number of ISSR.porUniversidade Federal do Recôncavo da BahiaUFRBBrasilCCAAB - Centro de Ciências Agrárias, Ambientais e BiológicasCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA::GENETICA VEGETALCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERALCitrusGenetic variabilityISSR (Inter Single Sequence Repeats) MarkersCruz das Almas (BA)CitrusVariabilidade genéticaMarcadores ISSR (Inter Single Sequence Repeats)Cruz das Almas (BA)Caracterização molecular de acessos do banco ativo de germoplasma de citros da Embrapa Mandioca e Fruticulturainfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisBachareladoMachado, Edna LoboGesteira, Abelmon da SilvaFerreira, Cláudia FortesMoreira, Ricardo Franco CunhaSilva, Simone AlvesCarneiro, Janáira Lopes dos Santosinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRBinstname:Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB)instacron:UFRBORIGINALCaracterizacao_Molecular_Acessos_TCC_2010.pdfCaracterizacao_Molecular_Acessos_TCC_2010.pdfapplication/pdf997984http://ri.ufrb.edu.br/jspui/bitstream/123456789/2283/1/Caracterizacao_Molecular_Acessos_TCC_2010.pdfe823313074e843708eab87ec02ae1394MD51LICENSElicense.txtlicense.txttext/plain; charset=utf-81930http://ri.ufrb.edu.br/jspui/bitstream/123456789/2283/2/license.txt17dd64d7a271c2bbd8e88fd80624d4a1MD52123456789/22832023-05-16 14:35:27.157oai:ri.ufrb.edu.br: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Repositório InstitucionalPUBhttp://www.repositorio.ufrb.edu.br/oai/requestnutin.cidoc@proplan.ufrb.edu.bropendoar:27582023-05-16T17:35:27Repositório Institucional da UFRB - Universidade Federal do Recôncavo da Bahia (UFRB)false |
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