Ciclo celular detalhado pela análise de componentes principais
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2018 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRGS |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10183/189376 |
Resumo: | Utilizando dados de expressão gênica obtidos por RNA-Seq de células únicas de Mus Musculus, analisamos o ciclo celular a partir do método do transcriptograma e de análise por componentes principais (PCA). A análise sugere uma classificação das amostras nas diferentes fases do ciclo celular e possibilita propor um ranqueamento pseudo-temporal das amostras. Com dados de grupos de genes reguladores do ciclo, como o complexo ciclina-CDK, validamos biologicamente o ordenamento, uma vez que a sequência temporal proposta pelo ordenamento das amostras dá lugar à evolução esperada da expressão gênica de marcadores de fases do ciclo celular. |
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Souza, Lars Leonardo Sanhudo deAlmeida, Rita Maria Cunha deLenz, Guido2019-03-15T02:29:18Z2018http://hdl.handle.net/10183/189376001087255Utilizando dados de expressão gênica obtidos por RNA-Seq de células únicas de Mus Musculus, analisamos o ciclo celular a partir do método do transcriptograma e de análise por componentes principais (PCA). A análise sugere uma classificação das amostras nas diferentes fases do ciclo celular e possibilita propor um ranqueamento pseudo-temporal das amostras. Com dados de grupos de genes reguladores do ciclo, como o complexo ciclina-CDK, validamos biologicamente o ordenamento, uma vez que a sequência temporal proposta pelo ordenamento das amostras dá lugar à evolução esperada da expressão gênica de marcadores de fases do ciclo celular.Using gene expression data obtained fromRNA-Seq of single-cellMusMusculus , we analyzed the cell cycle fromthe transcriptogram and principal component analysis method (PCA). The analysis suggests a classification of the samples in the different phases of the cell cycle and made possible to propose a pseudo-temporal ordering. With data from groups of cycle-regulating genes, such as the cyclin-CDK complex, we biologically validate the ordering, since the temporal sequence proposed by the ordering of the samples gives rise to the expected evolution of the gene expression of phase markers of the cell cycle.application/pdfporBiofísicaCiclo celularDNACiclo celular detalhado pela análise de componentes principaisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulInstituto de FísicaPorto Alegre, BR-RS2018Física: Bachareladograduaçãoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT001087255.pdf.txt001087255.pdf.txtExtracted Texttext/plain74722http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/189376/2/001087255.pdf.txte3ddc76716852ce20c90e2036102c8baMD52ORIGINAL001087255.pdfTexto completoapplication/pdf2716007http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/189376/1/001087255.pdf749741a52e70ffdfa74ba8ab73884bdcMD5110183/1893762024-07-10 06:25:24.765793oai:www.lume.ufrgs.br:10183/189376Repositório de PublicaçõesPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestopendoar:2024-07-10T09:25:24Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false |
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