Extended-spectrum β-lactamases in Klebsiella spp and Escherichia coli obtained in a brazilian teaching hospital: detection, prevalence and molecular typing

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Freitas, Ana Lucia Peixoto de
Data de Publicação: 2003
Outros Autores: Machado, Denise Pires, Soares, Fabiana da Silva Correa, Barth, Afonso Luis
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/19843
Resumo: Este estudo foi desenvolvido para comparar métodos de detecção e para estimar a prevalência de Klebsiella spp e E.coli produtoras de b-lactamases de espetro ampliado (ESBL) em um Hospital Universitário no sul do Brasil. A correlação genética, determinada através de método molecular de tipagem, entre as amostras de K. pneumoniae também foi determinada. A produção de ESBL foi investigada em 95 amostras de Klebsiella spp e E.coli obtidas de pacientes no Hospital de Clínicas de Porto Alegre usando-se: medida do diâmetro a zona de inibição (KB), dupladifusão de disco (DD), valores de concentração inibitória mínima da ceftazidima (MIC CAZ), aumento do diâmetro da zona de inibição com adição de clavulanato (CAZ/CAC) e a relação entre o MIC da ceftazidima/MIC ceftazidima com clavulanato (MIC CAZ/ CAC). A tipagem molecular foi realizada utilizando-se o método de macrorestrição de DNA e eletroforese em campo pulsado (PFGE). O método KB apresentou as maiores taxas de produção de ESBL (> 70% para Klebsiella e 59% para E.coli) contrastando com os outros métodos (p< 0,05). Os métodos confirmatórios (DD, MIC CAZ e MIC CAZ/CAC) indicaram a produção de ESBL em 8 a 13% de E.coli e em 33 a 40% para as espécies de Klebsiella. Portanto, o método KB é útil apenas como método de triagem devido aos diversos resultados considerados falso-positivos. A tipagem molecular realizada em 17 amostras de K.pneumoniae ESBL indicou não existência de relação clonal. Este estudo encontrou uma boa correlação entre os métodos confirmatórios de detecção de ESBL embora os métodos que avaliam a inibição da enzima pelo clavulanato pareçam ser mais específicos. A alta prevalência de Klebsiella ESBL em nosso hospital provavelmente se deve a seleção individual de cepas resistentes do que a transmissão de uma cepa comum.
id UFRGS-2_14a89c3cd352128382a3f88ad4b12fb2
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/19843
network_acronym_str UFRGS-2
network_name_str Repositório Institucional da UFRGS
repository_id_str
spelling Freitas, Ana Lucia Peixoto deMachado, Denise PiresSoares, Fabiana da Silva CorreaBarth, Afonso Luis2010-04-16T09:11:51Z20031517-8382http://hdl.handle.net/10183/19843000435704Este estudo foi desenvolvido para comparar métodos de detecção e para estimar a prevalência de Klebsiella spp e E.coli produtoras de b-lactamases de espetro ampliado (ESBL) em um Hospital Universitário no sul do Brasil. A correlação genética, determinada através de método molecular de tipagem, entre as amostras de K. pneumoniae também foi determinada. A produção de ESBL foi investigada em 95 amostras de Klebsiella spp e E.coli obtidas de pacientes no Hospital de Clínicas de Porto Alegre usando-se: medida do diâmetro a zona de inibição (KB), dupladifusão de disco (DD), valores de concentração inibitória mínima da ceftazidima (MIC CAZ), aumento do diâmetro da zona de inibição com adição de clavulanato (CAZ/CAC) e a relação entre o MIC da ceftazidima/MIC ceftazidima com clavulanato (MIC CAZ/ CAC). A tipagem molecular foi realizada utilizando-se o método de macrorestrição de DNA e eletroforese em campo pulsado (PFGE). O método KB apresentou as maiores taxas de produção de ESBL (> 70% para Klebsiella e 59% para E.coli) contrastando com os outros métodos (p< 0,05). Os métodos confirmatórios (DD, MIC CAZ e MIC CAZ/CAC) indicaram a produção de ESBL em 8 a 13% de E.coli e em 33 a 40% para as espécies de Klebsiella. Portanto, o método KB é útil apenas como método de triagem devido aos diversos resultados considerados falso-positivos. A tipagem molecular realizada em 17 amostras de K.pneumoniae ESBL indicou não existência de relação clonal. Este estudo encontrou uma boa correlação entre os métodos confirmatórios de detecção de ESBL embora os métodos que avaliam a inibição da enzima pelo clavulanato pareçam ser mais específicos. A alta prevalência de Klebsiella ESBL em nosso hospital provavelmente se deve a seleção individual de cepas resistentes do que a transmissão de uma cepa comum.His study was performed to compare the methods of detection and to estimate the prevalence of extendedspectrum β-lactamases (ESBL) among Klebsiella spp and E. coli in a university hospital in southern Brazil. We also used a molecular typing method to evaluate the genetic correlation between isolates of ESBL K. pneumoniae. Production of ESBL was investigated in 95 clinical isolates of Klebsiella spp and Escherichia coli from Hospital de Clínicas de Porto Alegre, using Kirby-Bauer zone diameter (KB), double-disk diffusion (DD), breakpoint for ceftazidime (MIC CAZ), increased zone diameter with clavulanate (CAZ/CAC) and ratio of ceftazidime MIC/ceftazidime-clavulanate MIC (MIC CAZ/CAC). Molecular typing was performed by DNA macrorestriction analysis followed by pulsed-field gel electrophoresis. The KB method displayed the highest rates of ESBL (up to 70% of Klebsiella and 59% of E. coli), contrasting with all the other methods (p < 0.05). The confirmatory methods (DD, MIC CAZ, CAZ/CAC and MIC CAZ/CAC) showed a range of ESBL production from 8 to 13% for E. coli and from 33 to 40% for Klebsiella species. Therefore, the KB method was useful only as a screening method as it provided several false positive results. Molecular typing of 17 ESBL K. pneumoniae indicated that the isolates had no clonal relation. We found a good correlation among the confirmatory methods for ESBL detection although the methods which evaluate inhibition of the β-lactamase by clavulanate appeared to be more specific. The high prevalence of ESBL Klebsiella in our hospital is probably due to individual selection of resistant strains rather than the transmission of a common strain.application/pdfengBrazilian journal of microbiology. São Paulo, SP. Vol. 34, n. 4 (out./dez. 2003), p. 344-348Klebsiella pneumoniaeEscherichia coliESBLKlebsiellaResistanceMolecular typingExtended-spectrum β-lactamases in Klebsiella spp and Escherichia coli obtained in a brazilian teaching hospital: detection, prevalence and molecular typingβ-lactamases de espectro ampliado em Klebsiella spp e em Escherichia coli obtidas em um hospital escola brasileiro: detecção, prevalência e tipagem molecular info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/otherinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSORIGINAL000435704.pdf000435704.pdfTexto completo (inglês)application/pdf388945http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/19843/1/000435704.pdf4c40e05dfe20a80490524c82310e4d01MD51TEXT000435704.pdf.txt000435704.pdf.txtExtracted Texttext/plain26544http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/19843/2/000435704.pdf.txte793c719200892ba61443057e8adffefMD52THUMBNAIL000435704.pdf.jpg000435704.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1771http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/19843/3/000435704.pdf.jpg1291b1185de431553ae2be8728da345fMD5310183/198432018-10-30 07:52:22.314oai:www.lume.ufrgs.br:10183/19843Repositório de PublicaçõesPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestopendoar:2018-10-30T10:52:22Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Extended-spectrum β-lactamases in Klebsiella spp and Escherichia coli obtained in a brazilian teaching hospital: detection, prevalence and molecular typing
dc.title.alternative.en.fl_str_mv β-lactamases de espectro ampliado em Klebsiella spp e em Escherichia coli obtidas em um hospital escola brasileiro: detecção, prevalência e tipagem molecular
title Extended-spectrum β-lactamases in Klebsiella spp and Escherichia coli obtained in a brazilian teaching hospital: detection, prevalence and molecular typing
spellingShingle Extended-spectrum β-lactamases in Klebsiella spp and Escherichia coli obtained in a brazilian teaching hospital: detection, prevalence and molecular typing
Freitas, Ana Lucia Peixoto de
Klebsiella pneumoniae
Escherichia coli
ESBL
Klebsiella
Resistance
Molecular typing
title_short Extended-spectrum β-lactamases in Klebsiella spp and Escherichia coli obtained in a brazilian teaching hospital: detection, prevalence and molecular typing
title_full Extended-spectrum β-lactamases in Klebsiella spp and Escherichia coli obtained in a brazilian teaching hospital: detection, prevalence and molecular typing
title_fullStr Extended-spectrum β-lactamases in Klebsiella spp and Escherichia coli obtained in a brazilian teaching hospital: detection, prevalence and molecular typing
title_full_unstemmed Extended-spectrum β-lactamases in Klebsiella spp and Escherichia coli obtained in a brazilian teaching hospital: detection, prevalence and molecular typing
title_sort Extended-spectrum β-lactamases in Klebsiella spp and Escherichia coli obtained in a brazilian teaching hospital: detection, prevalence and molecular typing
author Freitas, Ana Lucia Peixoto de
author_facet Freitas, Ana Lucia Peixoto de
Machado, Denise Pires
Soares, Fabiana da Silva Correa
Barth, Afonso Luis
author_role author
author2 Machado, Denise Pires
Soares, Fabiana da Silva Correa
Barth, Afonso Luis
author2_role author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Freitas, Ana Lucia Peixoto de
Machado, Denise Pires
Soares, Fabiana da Silva Correa
Barth, Afonso Luis
dc.subject.por.fl_str_mv Klebsiella pneumoniae
Escherichia coli
topic Klebsiella pneumoniae
Escherichia coli
ESBL
Klebsiella
Resistance
Molecular typing
dc.subject.eng.fl_str_mv ESBL
Klebsiella
Resistance
Molecular typing
description Este estudo foi desenvolvido para comparar métodos de detecção e para estimar a prevalência de Klebsiella spp e E.coli produtoras de b-lactamases de espetro ampliado (ESBL) em um Hospital Universitário no sul do Brasil. A correlação genética, determinada através de método molecular de tipagem, entre as amostras de K. pneumoniae também foi determinada. A produção de ESBL foi investigada em 95 amostras de Klebsiella spp e E.coli obtidas de pacientes no Hospital de Clínicas de Porto Alegre usando-se: medida do diâmetro a zona de inibição (KB), dupladifusão de disco (DD), valores de concentração inibitória mínima da ceftazidima (MIC CAZ), aumento do diâmetro da zona de inibição com adição de clavulanato (CAZ/CAC) e a relação entre o MIC da ceftazidima/MIC ceftazidima com clavulanato (MIC CAZ/ CAC). A tipagem molecular foi realizada utilizando-se o método de macrorestrição de DNA e eletroforese em campo pulsado (PFGE). O método KB apresentou as maiores taxas de produção de ESBL (> 70% para Klebsiella e 59% para E.coli) contrastando com os outros métodos (p< 0,05). Os métodos confirmatórios (DD, MIC CAZ e MIC CAZ/CAC) indicaram a produção de ESBL em 8 a 13% de E.coli e em 33 a 40% para as espécies de Klebsiella. Portanto, o método KB é útil apenas como método de triagem devido aos diversos resultados considerados falso-positivos. A tipagem molecular realizada em 17 amostras de K.pneumoniae ESBL indicou não existência de relação clonal. Este estudo encontrou uma boa correlação entre os métodos confirmatórios de detecção de ESBL embora os métodos que avaliam a inibição da enzima pelo clavulanato pareçam ser mais específicos. A alta prevalência de Klebsiella ESBL em nosso hospital provavelmente se deve a seleção individual de cepas resistentes do que a transmissão de uma cepa comum.
publishDate 2003
dc.date.issued.fl_str_mv 2003
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2010-04-16T09:11:51Z
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/other
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/19843
dc.identifier.issn.pt_BR.fl_str_mv 1517-8382
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 000435704
identifier_str_mv 1517-8382
000435704
url http://hdl.handle.net/10183/19843
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.ispartof.pt_BR.fl_str_mv Brazilian journal of microbiology. São Paulo, SP. Vol. 34, n. 4 (out./dez. 2003), p. 344-348
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Repositório Institucional da UFRGS
collection Repositório Institucional da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/19843/1/000435704.pdf
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/19843/2/000435704.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/19843/3/000435704.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 4c40e05dfe20a80490524c82310e4d01
e793c719200892ba61443057e8adffef
1291b1185de431553ae2be8728da345f
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1815447400012054528