Genetic diversity of Salminus brasiliensis (Characiformes: Characidae) collected in the passage ladder of the Canoas I hydropower plant in the Paranapanema River, Brazil

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Gomes, Patrícia Cristina
Data de Publicação: 2013
Outros Autores: Lopera Barrero, Nelson Mauricio, Vargas, Lauro, Streit Júnior, Danilo Pedro, Povh, Jayme Aparecido, Sirol, Rodolfo Nardez, Ribeiro, Ricardo Pereira
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/204393
Resumo: O objetivo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética de Salminus brasiliensis coletados em três períodos diferentes na escada de transposição da hidrelétrica de Canoas I no rio Paranapanema (Brasil). Os peixes foram coletados no dia 14 (CI14), 18 (CI18) e 25 (CI25) do mês de fevereiro de 2008. Foram avaliados oito iniciadores com a técnica de RAPD. Dos 105 fragmentos amplificados pelos iniciadores, 79 foram polimórficos (75,2%), 32 tiveram diferenças significativas (p<0,05) na frequência, 10 fragmentos tiveram baixa frequência, 25 fragmentos foram excluídos e quatro fragmentos foram fixados. Um fragmento exclusivo foi encontrado em CI14. Observaram-se altos valores de porcentagem de fragmentos polimórficos e índice de diversidade genética de Shannon em CI14 e CI18. O valor de Fst mostrou que existe uma baixa ancestralidade entre os agrupamentos sugerindo uma alta diferenciação genética entre os grupos amostrados. O valor de número de migrantes por geração (Nm) calculado foi baixo nos três grupos, sendo considerado como baixa presença de fluxo gênico. De acordo com a AMOVA, a maior parte da variação genética está dentro de cada grupo e não entre os grupos, sendo confirmado com as estimativas da identidade e da distância genética. Os resultados deste estudo indicam que existe uma alta variabilidade genética e diferenciação genética entre os grupos amostrados.
id UFRGS-2_3340db00d893703951cf49137d32c873
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/204393
network_acronym_str UFRGS-2
network_name_str Repositório Institucional da UFRGS
repository_id_str
spelling Gomes, Patrícia CristinaLopera Barrero, Nelson MauricioVargas, LauroStreit Júnior, Danilo PedroPovh, Jayme AparecidoSirol, Rodolfo NardezRibeiro, Ricardo Pereira2020-01-17T04:08:57Z20131676-546Xhttp://hdl.handle.net/10183/204393001107625O objetivo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética de Salminus brasiliensis coletados em três períodos diferentes na escada de transposição da hidrelétrica de Canoas I no rio Paranapanema (Brasil). Os peixes foram coletados no dia 14 (CI14), 18 (CI18) e 25 (CI25) do mês de fevereiro de 2008. Foram avaliados oito iniciadores com a técnica de RAPD. Dos 105 fragmentos amplificados pelos iniciadores, 79 foram polimórficos (75,2%), 32 tiveram diferenças significativas (p<0,05) na frequência, 10 fragmentos tiveram baixa frequência, 25 fragmentos foram excluídos e quatro fragmentos foram fixados. Um fragmento exclusivo foi encontrado em CI14. Observaram-se altos valores de porcentagem de fragmentos polimórficos e índice de diversidade genética de Shannon em CI14 e CI18. O valor de Fst mostrou que existe uma baixa ancestralidade entre os agrupamentos sugerindo uma alta diferenciação genética entre os grupos amostrados. O valor de número de migrantes por geração (Nm) calculado foi baixo nos três grupos, sendo considerado como baixa presença de fluxo gênico. De acordo com a AMOVA, a maior parte da variação genética está dentro de cada grupo e não entre os grupos, sendo confirmado com as estimativas da identidade e da distância genética. Os resultados deste estudo indicam que existe uma alta variabilidade genética e diferenciação genética entre os grupos amostrados.The aim of this study was to evaluate the genetic diversity of Salminus brasiliensis collected three times in the passage ladder of the hydropower plant Canoas I, in the Paranapanema River (Brazil). Fish samples were collected on 14 (CI14), 18 (CI18) and 25 (CI25) February 2008. Eight primers using RAPD technique were evaluated. Seventy-nine in 105 fragments amplified using these primers were polymorphic fragments (75.2%), 32 had frequencies with significant differences (P<0.05), 10 had low frequencies, 25 were excluded, and four were fixed fragments. One exclusive fragment was found in the CI14 sample. High values for polymorphic fragments and genetic diversity index of Shannon were observed for the CI14 and CI18. Low ancestry levels among the groups were indicated by the FST values that indicated high genetic differentiation. In all the three groups, the estimates of the number of migrants by generation (Nm) indicated low levels of gene flow. Most of the genetic variation was found within the groups through the AMOVA analysis, which was confirmed by the results of the identity and genetic distance. The results indicate high variability within the groups and genetic differentiation among them.application/pdfengSemina : ciências agrárias. Londrina, PR. Vol. 34, n. 3 (2013), p. 1421-1432Dourado (peixe)Repovoamento animalVariação genéticaFish transpositionGenetic variabilityRAPDRestocking programGenetic diversity of Salminus brasiliensis (Characiformes: Characidae) collected in the passage ladder of the Canoas I hydropower plant in the Paranapanema River, BrazilDiversidade genética de Salminus brasiliensis (Characiformes: Characidae) coletados na escada de transposição da Hidrelétrica de Canoas I, rio Paranapanema, Brasil info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/otherinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT001107625.pdf.txt001107625.pdf.txtExtracted Texttext/plain38586http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/204393/2/001107625.pdf.txtbd1c6aba19eacbb423a624862b89c223MD52ORIGINAL001107625.pdfTexto completo (inglês)application/pdf723694http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/204393/1/001107625.pdf69e7f86eec6379eef75743ba34db376cMD5110183/2043932023-09-27 03:34:19.206472oai:www.lume.ufrgs.br:10183/204393Repositório de PublicaçõesPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestopendoar:2023-09-27T06:34:19Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Genetic diversity of Salminus brasiliensis (Characiformes: Characidae) collected in the passage ladder of the Canoas I hydropower plant in the Paranapanema River, Brazil
dc.title.alternative.pt.fl_str_mv Diversidade genética de Salminus brasiliensis (Characiformes: Characidae) coletados na escada de transposição da Hidrelétrica de Canoas I, rio Paranapanema, Brasil
title Genetic diversity of Salminus brasiliensis (Characiformes: Characidae) collected in the passage ladder of the Canoas I hydropower plant in the Paranapanema River, Brazil
spellingShingle Genetic diversity of Salminus brasiliensis (Characiformes: Characidae) collected in the passage ladder of the Canoas I hydropower plant in the Paranapanema River, Brazil
Gomes, Patrícia Cristina
Dourado (peixe)
Repovoamento animal
Variação genética
Fish transposition
Genetic variability
RAPD
Restocking program
title_short Genetic diversity of Salminus brasiliensis (Characiformes: Characidae) collected in the passage ladder of the Canoas I hydropower plant in the Paranapanema River, Brazil
title_full Genetic diversity of Salminus brasiliensis (Characiformes: Characidae) collected in the passage ladder of the Canoas I hydropower plant in the Paranapanema River, Brazil
title_fullStr Genetic diversity of Salminus brasiliensis (Characiformes: Characidae) collected in the passage ladder of the Canoas I hydropower plant in the Paranapanema River, Brazil
title_full_unstemmed Genetic diversity of Salminus brasiliensis (Characiformes: Characidae) collected in the passage ladder of the Canoas I hydropower plant in the Paranapanema River, Brazil
title_sort Genetic diversity of Salminus brasiliensis (Characiformes: Characidae) collected in the passage ladder of the Canoas I hydropower plant in the Paranapanema River, Brazil
author Gomes, Patrícia Cristina
author_facet Gomes, Patrícia Cristina
Lopera Barrero, Nelson Mauricio
Vargas, Lauro
Streit Júnior, Danilo Pedro
Povh, Jayme Aparecido
Sirol, Rodolfo Nardez
Ribeiro, Ricardo Pereira
author_role author
author2 Lopera Barrero, Nelson Mauricio
Vargas, Lauro
Streit Júnior, Danilo Pedro
Povh, Jayme Aparecido
Sirol, Rodolfo Nardez
Ribeiro, Ricardo Pereira
author2_role author
author
author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Gomes, Patrícia Cristina
Lopera Barrero, Nelson Mauricio
Vargas, Lauro
Streit Júnior, Danilo Pedro
Povh, Jayme Aparecido
Sirol, Rodolfo Nardez
Ribeiro, Ricardo Pereira
dc.subject.por.fl_str_mv Dourado (peixe)
Repovoamento animal
Variação genética
topic Dourado (peixe)
Repovoamento animal
Variação genética
Fish transposition
Genetic variability
RAPD
Restocking program
dc.subject.eng.fl_str_mv Fish transposition
Genetic variability
RAPD
Restocking program
description O objetivo do presente estudo foi avaliar a diversidade genética de Salminus brasiliensis coletados em três períodos diferentes na escada de transposição da hidrelétrica de Canoas I no rio Paranapanema (Brasil). Os peixes foram coletados no dia 14 (CI14), 18 (CI18) e 25 (CI25) do mês de fevereiro de 2008. Foram avaliados oito iniciadores com a técnica de RAPD. Dos 105 fragmentos amplificados pelos iniciadores, 79 foram polimórficos (75,2%), 32 tiveram diferenças significativas (p<0,05) na frequência, 10 fragmentos tiveram baixa frequência, 25 fragmentos foram excluídos e quatro fragmentos foram fixados. Um fragmento exclusivo foi encontrado em CI14. Observaram-se altos valores de porcentagem de fragmentos polimórficos e índice de diversidade genética de Shannon em CI14 e CI18. O valor de Fst mostrou que existe uma baixa ancestralidade entre os agrupamentos sugerindo uma alta diferenciação genética entre os grupos amostrados. O valor de número de migrantes por geração (Nm) calculado foi baixo nos três grupos, sendo considerado como baixa presença de fluxo gênico. De acordo com a AMOVA, a maior parte da variação genética está dentro de cada grupo e não entre os grupos, sendo confirmado com as estimativas da identidade e da distância genética. Os resultados deste estudo indicam que existe uma alta variabilidade genética e diferenciação genética entre os grupos amostrados.
publishDate 2013
dc.date.issued.fl_str_mv 2013
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2020-01-17T04:08:57Z
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/other
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/204393
dc.identifier.issn.pt_BR.fl_str_mv 1676-546X
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 001107625
identifier_str_mv 1676-546X
001107625
url http://hdl.handle.net/10183/204393
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.ispartof.pt_BR.fl_str_mv Semina : ciências agrárias. Londrina, PR. Vol. 34, n. 3 (2013), p. 1421-1432
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Repositório Institucional da UFRGS
collection Repositório Institucional da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/204393/2/001107625.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/204393/1/001107625.pdf
bitstream.checksum.fl_str_mv bd1c6aba19eacbb423a624862b89c223
69e7f86eec6379eef75743ba34db376c
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1801224982405054464