Estudo computacional da agregação de polipeptídios AgB8/1, AgB8/2, e AgB8/3.

• Autor(a) principal: Duarte, Ueiler Lisoski
• Data de Publicação: 2011
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/37344
• topic: Dinâmica molecular; Métodos computacionais; Peptides; Molecular dynamics; AgB8 / 1; AgB8 / 2; AgB8 / 3; Hydatid cyst

Neste trabalho investigou-se a agregação de três subunidades do Antigeno B que é um polipeptídio lipoproteico que é liberado no ciclo do parasita da doença conhecida como Hidatidose são elas: AgB8/1, AgB8/2, AgB8/3. O AgB interfere diretamente nas funções de sobrevivência hospedeiro-parasita e é produzido com freqüência durante o ciclo da doença. Não se sabe detalhes da sua função e estruturação, mas observou-se experimentalmente uma tendência muito forte de agregação das suas subunidades. Nesse trabalho, desenvolve-se um protocolo computacional com o intuito de observar a agregação dos AgB8/1, AgB8/2, e AgB8/3 formando homo e hetero-oligômeros. A análise desses agregados fornece dados esclarecendo como esses polipeptídios interagem. A agregação das subunidades representa um processo que envolve tempos longos quando comparado com eixos temporais característicos na fase condensada de poucos picosegundos. Para prolongar o eixo temporal no tratamento computacional, aplica-se a simulação por dinâmica molecular em nível de “coarse-graining”.