PCR-RFLP of 16S ribosomal DNA to confirm the identification of Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus isolated from clinical and food samples

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Medeiros, Aline Weber
Data de Publicação: 2010
Outros Autores: D'Azevedo, Pedro Alves, Pereira, Rebeca Inhoque, Cassenego, Ana Paula Vaz, Van der Sand, Sueli Terezinha, Frazzon, Jeverson, Frazzon, Ana Paula Guedes
Tipo de documento: Artigo
Idioma: eng
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/28877
Resumo: Introdução: O objetivo deste estudo foi confirmar a identificação de amostras clínicas e alimentos de Enterococcus gallinarum e Enterococcus casseliflavus por PCR-RFLP. Métodos: Cinquenta e duas cepas identificadas por exames bioquímicos convencionais foram submetidos a amplificação por PCR e digestão com HinfI. Apenas 20 (38,5%) das 52 amostras apresentaram um padrão de DNA esperado E. gallinarum e E. casseliflavus. Resultados: Analise dos resultados deste estudo demonstraram que, algumas vezes E. gallinarum e E. casseliflavus são erroneamente identificados e confirmaram a potencial aplicação da análise do 16S rDNA para identificação exata destas espécies. Conclusões: A correta identificação é importante a fim de distinguir entre resistência intrínseca e adquirida à vancomicina.
id UFRGS-2_4e9808892811208a853a28d7f432e67f
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/28877
network_acronym_str UFRGS-2
network_name_str Repositório Institucional da UFRGS
repository_id_str
spelling Medeiros, Aline WeberD'Azevedo, Pedro AlvesPereira, Rebeca InhoqueCassenego, Ana Paula VazVan der Sand, Sueli TerezinhaFrazzon, JeversonFrazzon, Ana Paula Guedes2011-05-06T06:00:04Z20100037-8682http://hdl.handle.net/10183/28877000757905Introdução: O objetivo deste estudo foi confirmar a identificação de amostras clínicas e alimentos de Enterococcus gallinarum e Enterococcus casseliflavus por PCR-RFLP. Métodos: Cinquenta e duas cepas identificadas por exames bioquímicos convencionais foram submetidos a amplificação por PCR e digestão com HinfI. Apenas 20 (38,5%) das 52 amostras apresentaram um padrão de DNA esperado E. gallinarum e E. casseliflavus. Resultados: Analise dos resultados deste estudo demonstraram que, algumas vezes E. gallinarum e E. casseliflavus são erroneamente identificados e confirmaram a potencial aplicação da análise do 16S rDNA para identificação exata destas espécies. Conclusões: A correta identificação é importante a fim de distinguir entre resistência intrínseca e adquirida à vancomicina.Introduction: This study aimed to confirm the identification of Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus isolated from clinical and food samples by PCR-RFLP. Methods: Fifty-two strains identified by conventional biochemical exams were submitted to PCR amplification and digested with HinfI. Only 20 (38.5%) of the 52 strains showed a DNA pattern expected for E. gallinarum and E. casseliflavus. Results: Analysis of the results of this study showed that E. gallinarum and E. casseliflavus are occasionally erroneously identified and confirmed the potential application of 16S rDNA analysis for accurate identification of these species. Conclusions: A correct identification is important to distinguish between intrinsic and acquired vancomycin resistance.application/pdfengRevista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical. Brasília. Vol. 43, n. 1 (jan./fev. 2010), p. 100-101.Enterococcus gallinarumEnterococcus casseliflavusPCR-RFLP of 16S rDNAEnterococcus gallinarumEnterococcus casseliflavusPCR-RFLP of 16S ribosomal DNA to confirm the identification of Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus isolated from clinical and food samplesinfo:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/otherinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT000757905.pdf.txt000757905.pdf.txtExtracted Texttext/plain9779http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/28877/2/000757905.pdf.txtad96349314dca13ac641d754b8b91d89MD52ORIGINAL000757905.pdf000757905.pdfTexto completo (inglês)application/pdf204728http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/28877/1/000757905.pdf37ddad42cc45dc7faa25735cf358098bMD51THUMBNAIL000757905.pdf.jpg000757905.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg2066http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/28877/3/000757905.pdf.jpg49a7f2188ee5f4bebea203fbfd42ccdcMD5310183/288772021-07-09 04:33:43.965932oai:www.lume.ufrgs.br:10183/28877Repositório de PublicaçõesPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestopendoar:2021-07-09T07:33:43Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv PCR-RFLP of 16S ribosomal DNA to confirm the identification of Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus isolated from clinical and food samples
title PCR-RFLP of 16S ribosomal DNA to confirm the identification of Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus isolated from clinical and food samples
spellingShingle PCR-RFLP of 16S ribosomal DNA to confirm the identification of Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus isolated from clinical and food samples
Medeiros, Aline Weber
Enterococcus gallinarum
Enterococcus casseliflavus
PCR-RFLP of 16S rDNA
Enterococcus gallinarum
Enterococcus casseliflavus
title_short PCR-RFLP of 16S ribosomal DNA to confirm the identification of Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus isolated from clinical and food samples
title_full PCR-RFLP of 16S ribosomal DNA to confirm the identification of Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus isolated from clinical and food samples
title_fullStr PCR-RFLP of 16S ribosomal DNA to confirm the identification of Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus isolated from clinical and food samples
title_full_unstemmed PCR-RFLP of 16S ribosomal DNA to confirm the identification of Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus isolated from clinical and food samples
title_sort PCR-RFLP of 16S ribosomal DNA to confirm the identification of Enterococcus gallinarum and Enterococcus casseliflavus isolated from clinical and food samples
author Medeiros, Aline Weber
author_facet Medeiros, Aline Weber
D'Azevedo, Pedro Alves
Pereira, Rebeca Inhoque
Cassenego, Ana Paula Vaz
Van der Sand, Sueli Terezinha
Frazzon, Jeverson
Frazzon, Ana Paula Guedes
author_role author
author2 D'Azevedo, Pedro Alves
Pereira, Rebeca Inhoque
Cassenego, Ana Paula Vaz
Van der Sand, Sueli Terezinha
Frazzon, Jeverson
Frazzon, Ana Paula Guedes
author2_role author
author
author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Medeiros, Aline Weber
D'Azevedo, Pedro Alves
Pereira, Rebeca Inhoque
Cassenego, Ana Paula Vaz
Van der Sand, Sueli Terezinha
Frazzon, Jeverson
Frazzon, Ana Paula Guedes
dc.subject.por.fl_str_mv Enterococcus gallinarum
Enterococcus casseliflavus
topic Enterococcus gallinarum
Enterococcus casseliflavus
PCR-RFLP of 16S rDNA
Enterococcus gallinarum
Enterococcus casseliflavus
dc.subject.eng.fl_str_mv PCR-RFLP of 16S rDNA
Enterococcus gallinarum
Enterococcus casseliflavus
description Introdução: O objetivo deste estudo foi confirmar a identificação de amostras clínicas e alimentos de Enterococcus gallinarum e Enterococcus casseliflavus por PCR-RFLP. Métodos: Cinquenta e duas cepas identificadas por exames bioquímicos convencionais foram submetidos a amplificação por PCR e digestão com HinfI. Apenas 20 (38,5%) das 52 amostras apresentaram um padrão de DNA esperado E. gallinarum e E. casseliflavus. Resultados: Analise dos resultados deste estudo demonstraram que, algumas vezes E. gallinarum e E. casseliflavus são erroneamente identificados e confirmaram a potencial aplicação da análise do 16S rDNA para identificação exata destas espécies. Conclusões: A correta identificação é importante a fim de distinguir entre resistência intrínseca e adquirida à vancomicina.
publishDate 2010
dc.date.issued.fl_str_mv 2010
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2011-05-06T06:00:04Z
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/other
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/28877
dc.identifier.issn.pt_BR.fl_str_mv 0037-8682
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 000757905
identifier_str_mv 0037-8682
000757905
url http://hdl.handle.net/10183/28877
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.relation.ispartof.pt_BR.fl_str_mv Revista da Sociedade Brasileira de Medicina Tropical. Brasília. Vol. 43, n. 1 (jan./fev. 2010), p. 100-101.
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Repositório Institucional da UFRGS
collection Repositório Institucional da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/28877/2/000757905.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/28877/1/000757905.pdf
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/28877/3/000757905.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv ad96349314dca13ac641d754b8b91d89
37ddad42cc45dc7faa25735cf358098b
49a7f2188ee5f4bebea203fbfd42ccdc
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1815447423502254080

Registros relacionados