Detecção do vírus da cinomose canina por RT-PCR utilizando-se oligonucleotídeos para os genes da fosfoproteína, hemaglutinina e neuraminidase

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Pozza, Michel
Data de Publicação: 2007
Outros Autores: Simonetti, Amauri Braga, Roehe, Paulo Michel, Esteves, Paulo Augusto, Rijsewijk, Franciscus Antonius Maria
Tipo de documento: Artigo
Idioma: por
Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/76984
Resumo: Empregou-se a técnica de reação em cadeia pela polimerase precedida de transcrição reversa para detecção do vírus da cinomose canina (CC). Para a padronização da técnica foram selecionados quatro pares de oligonucleotídeos (P1, P2, N1, H1), baseados em seqüências dos genes da fosfoproteína, neuraminidase e hemaglutinina, sendo utilizadas três cepas vacinais de vírus da CC como controles positivos. Foram analisadas três amostras isoladas de cães com cinomose e quatro amostras provenientes de cães com suspeita clínica de cinomose. Não houve amplificação nas amostras com suspeita clínica da doença. Os resultados obtidos com os oligonucleotídeos P1 e N1 foram superiores aos de H1. Os oligonucleotídeos P2 foram considerados inapropriados para a detecção do vírus da CC. Os amplicons obtidos com os oligonucleotídeos P1, N1 e H1 foram clivados com endonucleases de restrição, sendo os perfis das amostras virais comparados aos da amostra vacinal Lederle, utilizada como referência. Um padrão similar de restrição foi observado em todas as amostras analisadas.
id UFRGS-2_4eb8e102c1c36526d428ac6958577b53
oai_identifier_str oai:www.lume.ufrgs.br:10183/76984
network_acronym_str UFRGS-2
network_name_str Repositório Institucional da UFRGS
repository_id_str
spelling Pozza, MichelSimonetti, Amauri BragaRoehe, Paulo MichelEsteves, Paulo AugustoRijsewijk, Franciscus Antonius Maria2013-08-13T01:47:12Z20070102-0935http://hdl.handle.net/10183/76984000634289Empregou-se a técnica de reação em cadeia pela polimerase precedida de transcrição reversa para detecção do vírus da cinomose canina (CC). Para a padronização da técnica foram selecionados quatro pares de oligonucleotídeos (P1, P2, N1, H1), baseados em seqüências dos genes da fosfoproteína, neuraminidase e hemaglutinina, sendo utilizadas três cepas vacinais de vírus da CC como controles positivos. Foram analisadas três amostras isoladas de cães com cinomose e quatro amostras provenientes de cães com suspeita clínica de cinomose. Não houve amplificação nas amostras com suspeita clínica da doença. Os resultados obtidos com os oligonucleotídeos P1 e N1 foram superiores aos de H1. Os oligonucleotídeos P2 foram considerados inapropriados para a detecção do vírus da CC. Os amplicons obtidos com os oligonucleotídeos P1, N1 e H1 foram clivados com endonucleases de restrição, sendo os perfis das amostras virais comparados aos da amostra vacinal Lederle, utilizada como referência. Um padrão similar de restrição foi observado em todas as amostras analisadas.The reverse transcription-polymerase chain reaction was used to detect canine distemper virus (CDV). Four oligonucleotide pairs were selected (P1, P2, N1, H1), based on the sequences of the phosphoprotein, hemagglutinin and nuraminidase genes for assay standardization, and three CDV vaccine strains were used as positive controls. Three viral isolates from dogs with canine distemper and four samples from animals clinically suspected of distemper were analysed. No amplification was detected in suspected samples. Results obtained by using P1 and N1 oligonucleotides were superior to those with H1 ones. P2 oligonucleotides were considered inadequate for CDV detection. Amplicons resulting from amplification of P1, N1 and H1 oligonucleotides were submitted to cleavage by restriction endonucleases and restriction patterns of viral samples were compared to that of Lederle strain used as reference. A similar restriction pattern was observed in all analysed samples.application/pdfporArquivo brasileiro de medicina veterinária e zootecnia = Brazilian journal of veterinary and animal sciences. Belo Horizonte. Vol. 59, n. 5 (out. 2007), p. 1154-1162CinomoseCãesOligonucleotídeosPolimorfismoDogCanine distemper virusRT-PCRPolymorphismDetecção do vírus da cinomose canina por RT-PCR utilizando-se oligonucleotídeos para os genes da fosfoproteína, hemaglutinina e neuraminidaseDetection of canine distemper virus by RT-PCR using oligonucleotides targeted to the phosphoprotein, hemagglutinin and neuraminidase genes info:eu-repo/semantics/articleinfo:eu-repo/semantics/otherinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSORIGINAL000634289.pdf000634289.pdfTexto completoapplication/pdf978294http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/76984/1/000634289.pdf5e6fb50bfa7ccffe87b442fca182bf9dMD51TEXT000634289.pdf.txt000634289.pdf.txtExtracted Texttext/plain31543http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/76984/2/000634289.pdf.txt5369fa0f7aa7b413e2f6181a68e3dd37MD52THUMBNAIL000634289.pdf.jpg000634289.pdf.jpgGenerated Thumbnailimage/jpeg1479http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/76984/3/000634289.pdf.jpgc10a69282a241719872dc2a5a664ae59MD5310183/769842023-08-10 03:31:09.638449oai:www.lume.ufrgs.br:10183/76984Repositório de PublicaçõesPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestopendoar:2023-08-10T06:31:09Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false
dc.title.pt_BR.fl_str_mv Detecção do vírus da cinomose canina por RT-PCR utilizando-se oligonucleotídeos para os genes da fosfoproteína, hemaglutinina e neuraminidase
dc.title.alternative.en.fl_str_mv Detection of canine distemper virus by RT-PCR using oligonucleotides targeted to the phosphoprotein, hemagglutinin and neuraminidase genes
title Detecção do vírus da cinomose canina por RT-PCR utilizando-se oligonucleotídeos para os genes da fosfoproteína, hemaglutinina e neuraminidase
spellingShingle Detecção do vírus da cinomose canina por RT-PCR utilizando-se oligonucleotídeos para os genes da fosfoproteína, hemaglutinina e neuraminidase
Pozza, Michel
Cinomose
Cães
Oligonucleotídeos
Polimorfismo
Dog
Canine distemper virus
RT-PCR
Polymorphism
title_short Detecção do vírus da cinomose canina por RT-PCR utilizando-se oligonucleotídeos para os genes da fosfoproteína, hemaglutinina e neuraminidase
title_full Detecção do vírus da cinomose canina por RT-PCR utilizando-se oligonucleotídeos para os genes da fosfoproteína, hemaglutinina e neuraminidase
title_fullStr Detecção do vírus da cinomose canina por RT-PCR utilizando-se oligonucleotídeos para os genes da fosfoproteína, hemaglutinina e neuraminidase
title_full_unstemmed Detecção do vírus da cinomose canina por RT-PCR utilizando-se oligonucleotídeos para os genes da fosfoproteína, hemaglutinina e neuraminidase
title_sort Detecção do vírus da cinomose canina por RT-PCR utilizando-se oligonucleotídeos para os genes da fosfoproteína, hemaglutinina e neuraminidase
author Pozza, Michel
author_facet Pozza, Michel
Simonetti, Amauri Braga
Roehe, Paulo Michel
Esteves, Paulo Augusto
Rijsewijk, Franciscus Antonius Maria
author_role author
author2 Simonetti, Amauri Braga
Roehe, Paulo Michel
Esteves, Paulo Augusto
Rijsewijk, Franciscus Antonius Maria
author2_role author
author
author
author
dc.contributor.author.fl_str_mv Pozza, Michel
Simonetti, Amauri Braga
Roehe, Paulo Michel
Esteves, Paulo Augusto
Rijsewijk, Franciscus Antonius Maria
dc.subject.por.fl_str_mv Cinomose
Cães
Oligonucleotídeos
Polimorfismo
topic Cinomose
Cães
Oligonucleotídeos
Polimorfismo
Dog
Canine distemper virus
RT-PCR
Polymorphism
dc.subject.eng.fl_str_mv Dog
Canine distemper virus
RT-PCR
Polymorphism
description Empregou-se a técnica de reação em cadeia pela polimerase precedida de transcrição reversa para detecção do vírus da cinomose canina (CC). Para a padronização da técnica foram selecionados quatro pares de oligonucleotídeos (P1, P2, N1, H1), baseados em seqüências dos genes da fosfoproteína, neuraminidase e hemaglutinina, sendo utilizadas três cepas vacinais de vírus da CC como controles positivos. Foram analisadas três amostras isoladas de cães com cinomose e quatro amostras provenientes de cães com suspeita clínica de cinomose. Não houve amplificação nas amostras com suspeita clínica da doença. Os resultados obtidos com os oligonucleotídeos P1 e N1 foram superiores aos de H1. Os oligonucleotídeos P2 foram considerados inapropriados para a detecção do vírus da CC. Os amplicons obtidos com os oligonucleotídeos P1, N1 e H1 foram clivados com endonucleases de restrição, sendo os perfis das amostras virais comparados aos da amostra vacinal Lederle, utilizada como referência. Um padrão similar de restrição foi observado em todas as amostras analisadas.
publishDate 2007
dc.date.issued.fl_str_mv 2007
dc.date.accessioned.fl_str_mv 2013-08-13T01:47:12Z
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/article
info:eu-repo/semantics/other
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
format article
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10183/76984
dc.identifier.issn.pt_BR.fl_str_mv 0102-0935
dc.identifier.nrb.pt_BR.fl_str_mv 000634289
identifier_str_mv 0102-0935
000634289
url http://hdl.handle.net/10183/76984
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.ispartof.pt_BR.fl_str_mv Arquivo brasileiro de medicina veterinária e zootecnia = Brazilian journal of veterinary and animal sciences. Belo Horizonte. Vol. 59, n. 5 (out. 2007), p. 1154-1162
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositório Institucional da UFRGS
instname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron:UFRGS
instname_str Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
instacron_str UFRGS
institution UFRGS
reponame_str Repositório Institucional da UFRGS
collection Repositório Institucional da UFRGS
bitstream.url.fl_str_mv http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/76984/1/000634289.pdf
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/76984/2/000634289.pdf.txt
http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/76984/3/000634289.pdf.jpg
bitstream.checksum.fl_str_mv 5e6fb50bfa7ccffe87b442fca182bf9d
5369fa0f7aa7b413e2f6181a68e3dd37
c10a69282a241719872dc2a5a664ae59
bitstream.checksumAlgorithm.fl_str_mv MD5
MD5
MD5
repository.name.fl_str_mv Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)
repository.mail.fl_str_mv
_version_ 1798487194795507712