Caracterização in silico do modelo de interação de genes da auto-renovação das células tronco e sinalização por cálcio em metástases de melanoma humano

• Autor(a) principal: Oliveira, Ben Hur Neves de
• Data de Publicação: 2016
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/178275
• topic: Células-tronco tumorais; Melanoma; Cálcio; Cancer stem cell; Systems biology; Pluripotency; Calcium; Metastasis

Melanoma é um câncer de pele muito suscetível à ocorrência de metástases e, por isso, é considerado uma neoplasia maligna agressiva. Até hoje, mais de 90% das causas de morte por câncer são atribuídas à ocorrência de metástases. Acredita-se, ainda, que especificamente um subconjunto de células da população de um tecido tumoral é capaz de semear e repopular o seu tumor de origem. Estudos evidenciam que essas células “iniciadoras” de tumores comumente possuem características semelhantes às de células tronco, tais como poder de auto-renovação e capacidade de dar origem a células progenitoras ou diferenciadas, o que lhes rendeu o nome de células tronco tumorais (CTTs). Existem evidencias de que a via de sinalização do íon cálcio tem papel fundamental em uma série ampla de processos biológicos, dentre os quais estão o comprometimento celular na diferenciação de células tronco. Sendo assim, nós questionamos no presente estudo a influência da via de sinalização do Ca2+ na regulação da pluripotência de células tronco dentro de um contexto de neoplasia maligna. Para isso, nós criamos uma rede in silico (“STEMCa”) de interação proteína-proteína para modelar a integração de ambas as vias (sinalização por Ca2+ e regulação de pluripotência de células tronco). Após, nós avaliamos a expressão dos genes que codificam as proteínas desse modelo, utilizando um repositório público de microarranjos. Para os dados de expressão, foram utilizadas apenas amostras clínicas de melanomas metastáticos (tendo tumores primários como controle) de três conjuntos independentes de amostras de pacientes. Por fim, utilizamos ferramentas de biologia de sistemas para inferir potenciais candidatos a alvos terapêuticos e/ou marcadores de metástase. Nossa análise de expressão diferencial indica que, em ao menos um dos conjuntos de amostras de pacientes, 51% dos genes do modelo construído (151 de um total de 294 genes) encontram-se consistentemente desregulados (valor de p corrigido <0.05) em metástases de melanoma quando são comparados com amostras de tumor primário, sugerindo que, de fato, as vias avaliadas têm expressão aberrante. Além disso, nossos cálculos topológicos em cima do modelo proposto apontam GNAQ, GSK3B, GSTP1, MAPK3, PPP1CC, PRKACA, e SMAD4 como potenciais candidatos a serem estudados para intervenções terapêuticas ou como biomarcadores.