Estrutura populacional da raça girolando e efeito da endogamia sobre características produtivas e reprodutivas
Autor(a) principal: | |
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Data de Publicação: | 2018 |
Tipo de documento: | Trabalho de conclusão de curso |
Idioma: | por |
Título da fonte: | Repositório Institucional da UFRGS |
Texto Completo: | http://hdl.handle.net/10183/234123 |
Resumo: | O objetivo do estudo foi avaliar a estrutura populacional da raça Girolando e o impacto da endogamia sobre características de importância econômica. Os dados foram cedidos pela Associação Brasileira de Criadores de Girolando. A população foi subdividida em duas populações referências, uma formada apenas por animais puro-sintéticos (RefPS) e outra com animais de todas as composições genéticas do Girolando (RefPop) nascidos entre 2004 e 2015. Para diminuir o efeito da disparidade do pedigree a taxa de endogamia individual (ΔF) foi utilizada para estimar a depressão endogâmica. O efeito da endogamia no primeiro intervalo de partos (IP), idade no primeiro parto (IPP), produção de leite na primeira (LAC1), segunda (LAC2) e terceira lactação (LAC3) e produção de leite nas três primeiras lactações (LAC123) foram determinados a partir do ajuste dos modelos de regressão (linear, quadrático, exponencial e Michaelis-Menten) sobre o erro gerado pelo modelo animal. O valor da relação número de fundadores e ancestrais efetivos (fe:fa) foram de 3,27 (RefPS) e 3,06 (RefPop). Na RefPS o coeficiente de endogamia (F) médio foi de 0,0116, com máxima de 0,3773, em que 92,99% dos animais dessa população são endogâmicos. Na RefPop o F médio foi menor (0,0029), com máxima de 0,3773, sendo que 21,25% dos animais são endogâmicos. A grande proporção de animais endogâmicos, principalmente, no puro-sintético refletem a diminuição da diversidade na raça. Os resultados do efeito do F serão apresentados com base na predição média. Os efeitos quando F nos animais atinge 0,15 foram respectivamente de +0,11 mês, +0,46 mês, -70,4 kg, -140 kg, -231,4 kg e -85,5 kg, para IP, IPP, LAC1, LAC2, LAC3 e LAC123. Os valores de fe:fa possivelmente indicam efeito de gargalo nas populações. Apesar da raça Girolando apresentar baixos níveis de F, há uma grande proporção de endogâmicos, principalmente na RefPS. Nenhum dos modelos apresentou certeza para ser eleito como o mais adequado, segundo o critério de informação de Akaike para ajuste nas características. De acordo com a predição média o aumento do nível de endogamia pode causar depressão nas características de importância econômica. Programas de acasalamento dirigido devem ser realizados afim de reduzir o incremento da endogamia e garantir a variabilidade genética, por exemplo, para manutenção da expressiva adaptação em diferentes ambientes e sustentar progressivos avanços no melhoramento genético da raça. |
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Machado, Juliana DementshukCobuci, Jaime Araújo2022-01-15T04:49:10Z2018http://hdl.handle.net/10183/234123001073088O objetivo do estudo foi avaliar a estrutura populacional da raça Girolando e o impacto da endogamia sobre características de importância econômica. Os dados foram cedidos pela Associação Brasileira de Criadores de Girolando. A população foi subdividida em duas populações referências, uma formada apenas por animais puro-sintéticos (RefPS) e outra com animais de todas as composições genéticas do Girolando (RefPop) nascidos entre 2004 e 2015. Para diminuir o efeito da disparidade do pedigree a taxa de endogamia individual (ΔF) foi utilizada para estimar a depressão endogâmica. O efeito da endogamia no primeiro intervalo de partos (IP), idade no primeiro parto (IPP), produção de leite na primeira (LAC1), segunda (LAC2) e terceira lactação (LAC3) e produção de leite nas três primeiras lactações (LAC123) foram determinados a partir do ajuste dos modelos de regressão (linear, quadrático, exponencial e Michaelis-Menten) sobre o erro gerado pelo modelo animal. O valor da relação número de fundadores e ancestrais efetivos (fe:fa) foram de 3,27 (RefPS) e 3,06 (RefPop). Na RefPS o coeficiente de endogamia (F) médio foi de 0,0116, com máxima de 0,3773, em que 92,99% dos animais dessa população são endogâmicos. Na RefPop o F médio foi menor (0,0029), com máxima de 0,3773, sendo que 21,25% dos animais são endogâmicos. A grande proporção de animais endogâmicos, principalmente, no puro-sintético refletem a diminuição da diversidade na raça. Os resultados do efeito do F serão apresentados com base na predição média. Os efeitos quando F nos animais atinge 0,15 foram respectivamente de +0,11 mês, +0,46 mês, -70,4 kg, -140 kg, -231,4 kg e -85,5 kg, para IP, IPP, LAC1, LAC2, LAC3 e LAC123. Os valores de fe:fa possivelmente indicam efeito de gargalo nas populações. Apesar da raça Girolando apresentar baixos níveis de F, há uma grande proporção de endogâmicos, principalmente na RefPS. Nenhum dos modelos apresentou certeza para ser eleito como o mais adequado, segundo o critério de informação de Akaike para ajuste nas características. De acordo com a predição média o aumento do nível de endogamia pode causar depressão nas características de importância econômica. Programas de acasalamento dirigido devem ser realizados afim de reduzir o incremento da endogamia e garantir a variabilidade genética, por exemplo, para manutenção da expressiva adaptação em diferentes ambientes e sustentar progressivos avanços no melhoramento genético da raça.The aim of the study was to evaluate the population structure of the Girolando breed and the effect of inbreeding on economic important traits. The data were provided by the Brazilian Association of Breeders of Girolando. The population was divided into two reference populations, one consisting only of pure-synthetic animals (RefPS) and other with all Girolando compositions (RefPop) born between 2004 and 2014. The individual inbreeding rate (ΔF) was used to estimate inbreeding depression to decrease the effect of pedigree disparity. The inbreeding depression for the first calving interval (IP), age at first calving (PI), milk production at first (LAC1), second (LAC2) and third lactation (LAC3) and milk production at the first three lactations (LAC123) were determined from the adjustment of the regression models (linear, quadratic, exponential and Michaelis-Menten) on the error generated by the animal model. The relationship between effective number of founders and ancestors (fe:fa) were 3.27 (RefPS) and 3.06 (RefPop). In RefPS the mean mean inbreeding coefficient (F) was 0.0116, with a maximum of 0.3777, with 92.99% of the population being inbred. In RefPop the mean F was lower (0.0029), with a maximum of 0.3777, with 21.25% of the animals being inbred. The large proportion of inbreed animals, principally in the pure-synthetic, reflect the decrease of the diversity of the new breed. The results of this work will be presented based on the average prediction. The effects of inbreeding in 0.15 were +0.11 month, +0.46 month, -70.4 kg, -140 kg, -231.4 kg and -85.5 kg, respectively for IP, IPP, LAC1, LAC2, LAC3 and LAC123.The fe:fa value possibly indicates a bottleneck effect in the populations. Despite the Girolando breed presents low levels of F, there is a large proportion of inbreds, mainly in RefPS. None of the models presented certainty about their selection with akaike information criterion. According to the average prediction, the increase in the level of inbreeding may cause depression in the characteristics of economic importance. Directed mating programs should be carried out to reduce the increase of inbreeding and to guarantee the genetic variability of the new breed for adaptation in different environments and to support genetic improvement.application/pdfporProdução animalGenética animalMelhoramento genetico animalEndogamiaDairy cattleRegressionInbreeding depressionEstrutura populacional da raça girolando e efeito da endogamia sobre características produtivas e reprodutivasinfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisUniversidade Federal do Rio Grande do SulFaculdade de AgronomiaPorto Alegre, BR-RS2018Zootecnia: Bachareladograduaçãoinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositório Institucional da UFRGSinstname:Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)instacron:UFRGSTEXT001073088.pdf.txt001073088.pdf.txtExtracted Texttext/plain82407http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/234123/2/001073088.pdf.txt8e9e9e8f300c523507d3f17ab5902788MD52ORIGINAL001073088.pdfTexto completoapplication/pdf1050074http://www.lume.ufrgs.br/bitstream/10183/234123/1/001073088.pdfca5601f7df64fb2c6efcd4b9db7e1969MD5110183/2341232022-06-15 04:49:33.156597oai:www.lume.ufrgs.br:10183/234123Repositório de PublicaçõesPUBhttps://lume.ufrgs.br/oai/requestopendoar:2022-06-15T07:49:33Repositório Institucional da UFRGS - Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS)false |
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O objetivo do estudo foi avaliar a estrutura populacional da raça Girolando e o impacto da endogamia sobre características de importância econômica. Os dados foram cedidos pela Associação Brasileira de Criadores de Girolando. A população foi subdividida em duas populações referências, uma formada apenas por animais puro-sintéticos (RefPS) e outra com animais de todas as composições genéticas do Girolando (RefPop) nascidos entre 2004 e 2015. Para diminuir o efeito da disparidade do pedigree a taxa de endogamia individual (ΔF) foi utilizada para estimar a depressão endogâmica. O efeito da endogamia no primeiro intervalo de partos (IP), idade no primeiro parto (IPP), produção de leite na primeira (LAC1), segunda (LAC2) e terceira lactação (LAC3) e produção de leite nas três primeiras lactações (LAC123) foram determinados a partir do ajuste dos modelos de regressão (linear, quadrático, exponencial e Michaelis-Menten) sobre o erro gerado pelo modelo animal. O valor da relação número de fundadores e ancestrais efetivos (fe:fa) foram de 3,27 (RefPS) e 3,06 (RefPop). Na RefPS o coeficiente de endogamia (F) médio foi de 0,0116, com máxima de 0,3773, em que 92,99% dos animais dessa população são endogâmicos. Na RefPop o F médio foi menor (0,0029), com máxima de 0,3773, sendo que 21,25% dos animais são endogâmicos. A grande proporção de animais endogâmicos, principalmente, no puro-sintético refletem a diminuição da diversidade na raça. Os resultados do efeito do F serão apresentados com base na predição média. Os efeitos quando F nos animais atinge 0,15 foram respectivamente de +0,11 mês, +0,46 mês, -70,4 kg, -140 kg, -231,4 kg e -85,5 kg, para IP, IPP, LAC1, LAC2, LAC3 e LAC123. Os valores de fe:fa possivelmente indicam efeito de gargalo nas populações. Apesar da raça Girolando apresentar baixos níveis de F, há uma grande proporção de endogâmicos, principalmente na RefPS. Nenhum dos modelos apresentou certeza para ser eleito como o mais adequado, segundo o critério de informação de Akaike para ajuste nas características. De acordo com a predição média o aumento do nível de endogamia pode causar depressão nas características de importância econômica. Programas de acasalamento dirigido devem ser realizados afim de reduzir o incremento da endogamia e garantir a variabilidade genética, por exemplo, para manutenção da expressiva adaptação em diferentes ambientes e sustentar progressivos avanços no melhoramento genético da raça. |
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