Avaliação do conteúdo de elementos genéticos móveis em duas espécies próximas de microsporídios

• Autor(a) principal: Albuquerque, Nathalia Rammé Medeiros de
• Data de Publicação: 2017
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/187443
• topic: Microsporídios; Retroelementos; Elementos de DNA transponíveis; Microsporidia; LTR retrotransposons; Transposable Elements

Os microsporídios possuem um dos menores genomas entre os eucariotos devido ao parasitismo intracelular obrigatório, que resultou em uma extensiva redução no tamanho e complexidade do genoma. Elementos transponíveis são segmentos de DNA que podem se mover de um locus para outro dentro de um genoma. Esses elementos compõe uma grande fração dos genomas eucarióticos, sendo a maioria retrotransposons devido ao seu mecanismo de transposição "copiar-e-colar". São capazes de mutar, alterar a regulação de genes e gerar novos genes. Eventos de transposição podem ser deletérios quando elementos transponíveis se integram em regiões codificantes e interrompem genes importantes. Devido à ausência de recombinação, esses elementos podem acumular no genoma de organismos assexuados e contribuir para a extinção desses organismos. No presente estudo foi analisado o conteúdo de elementos móveis de duas espécies proximamente relacionadas de microsporídios que diferem no modo de reprodução. Hamiltosporidium tvaerminnensis é assexuado e é transmitido horizontal e verticalmente, H. magnivora é sexuado transmitido verticalmente ao seu hospedeiro. Foram analisados dois genomas de linhagens de H. magnivora (BE-OM-2 e IL-BN-2), e um genoma de uma linhagem de H. tvaerminnensis (FI-OER-3-3). O programa RepeatMasker foi usado para a triagem inicial do conteúdo de elementos transponíveis. Um conjunto de domínios de proteínas codificadas por retrotransposons LTR foi utilizado para realizar um BLASTp nos proteomas preditos de BE-OM-2, IL-BN-2 e FI-OER-3-3. Por fim, a ferramenta LTRharvest foi utilizada para detectar retrotransposons LTR inteiros nos genomas. Foi encontrada uma diferença significativa entre as linhagens, com acúmulo de elementos transponíveis na linhagem sexuada IL-BN-2 em contraste com o baixo número de cópias na linhagem assexuada FI-OER-3-3. Foram encontrados dois retrotransposons LTR potencialmente ativos, "Nanomov" e "Bigshot". Ambos elementos são compartilhados entre as três linhagens, indicando inserções fixas que ocorreram antes da divergência das espécies. A filogenia de "Bigshot" mostrou elementos homólogos distribuídos em diversas espécies de microsporídios. Também está relacionado com elementos encontrados em artrópodes como D. magna, indicando uma possível transferência gênica horizontal entre microsporídios e seus hospedeiros artrópodes ancestrais. Para melhor compreender o papel dos elementos transponíveis na arquitetura e evolução dos genomas e a diferença no conteúdo em organismos sexuados e assexuados, é necessário uma investigação mais profunda em diferentes famílias de retrotransposons e transposons de DNA.