Estudo “in sílico” dos componentes do medicamento Paxlovid na ação conjunta como inibidor da proteína humana CYP3A4 e da proteína Mpro do vírus SARS-CoV-2

• Autor(a) principal: Soares, Maurício Jaeger
• Data de Publicação: 2023
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/265927
• topic: SARS-CoV-2; COVID-19; Medicamentos; SARS-CoV-2; Mpro; COVID-19; Paxlovid; Nirmatrelvir; Ritonavi

O Paxlovid® é um medicamento desenvolvido por pesquisadores da indústria Pfizer Inc., composto pela administração combinada de um inibidor de protease, denominado nirmatrelvir, e um inativador de enzima CYP3A4, denominado ritonavir. De acordo com o fabricante, o ritonavir é utilizado para aumentar a concentração plasmática do nirmatrelvir, que desempenha o papel de inibidor da protease viral. Este trabalho foi executado utilizando-se as técnicas computacionais de docagem molecular para predição de afinidade dos componentes do medicamento Paxlovid®, os fármacos ritonavir e nirmatrelvir, com o objetivo de identificar as energias de ligação e as interações com a proteína Mpro , do vírus SARS-CoV-2. A docagem foi empregada também nas simulações entre o componente ritonavir e a enzima CYP3A4, citocromo responsável pelo metabolismo primário da maioria dos agentes xenobióticos. Para essa finalidade foram utilizados os programas AutoDock 4.2 e AutoDock Vina, sendo as análises executadas com os softwares AutoDock Tools (ADT), PyMol e Discovery Studio. Complementando os objetivos deste trabalho, foi realizada ainda a simulação de dinâmica molecular clássica em duplicata para as análises do comportamento dinâmico entre o inibidor nirmatrelvir e o receptor viral Mpro. Os resultados indicaram que, no período de 200 ns, o ligante permaneceu ancorado ao sítio ativo da protease Mpro , corroborando com o que já havia sido publicado na literatura recente.