Metanálise de dados de transcriptoma revela módulos patofisiológicos envolvidos com a fibrilação atrial

• Autor(a) principal: Bueno, Rodrigo Haas
• Data de Publicação: 2019
• Tipo de documento: Trabalho de conclusão de curso
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Institucional da UFRGS
• Texto Completo: http://hdl.handle.net/10183/239134
• topic: Fibrilação atrial : Fisiopatologia; Transcrição genética; Transcriptoma; Metanálise em rede; Network analysis; Functional enrichment; Atrial fibrillation; Meta-analysis; Microarray; Transcriptome

A fibrilação atrial (FA) é o tipo de arritmia cardíaca mais comum e afeta de forma crescente milhões de pessoas ao redor do mundo. Sua patofisiologia envolve mecanismos complexos de remodelamento estrutural e elétrico dos átrios, muitos dos quais são pouco compreendidos. Dados de transcriptoma têm histórico em serem utilizados para levantar hipóteses de mecanismos biológicos por trás de doenças complexas. Contudo, a análise desse tipo de dado sofre com baixo poder estatístico e problemas de reprodutibilidade. Nesse sentido, este trabalho teve como objetivo realizar uma metanálise de dados de microarranjo envolvendo amostras de pacientes com fibrilação atrial. Os dados dos estudos selecionados foram baixados, analisados quanto a sua qualidade e pré-processados. A seguir, foi realizado uma análise de expressão diferencial de cada conjunto de dados individual. Estes resultados foram integrados por meio de metanálise, resultando numa lista final de 589 transcritos diferencialmente expressos na FA em relação a controles. Uma rede de interação proteína-proteína foi gerada a partir dessa lista e analisada quanto a seus parâmetros topológicos - identificando 11 hubs-bottlenecks principais - e por meio de análise de clusterização - identificando 4 módulos funcionais principais. Estes 4 módulos enriqueceram para 23, 54, 33 e 53 vias biológicas, respectivamente, as quais envolvem, entre outros, processos relacionados ao estresse do retículo endoplasmático, estresse oxidativo, catabolismo proteico e inflamação. Os hubs-bottlenecks, por sua vez, representam proteínas densamente conectadas e com possível papel chave regulatório da rede principal. A chaperona HSPA5, a proteína de ancoramento ANK2 e a proteína CTNNB1, chave da via Wnt/β-catenina são alguns exemplos. Dessa forma, a metanálise de dados de microarranjo foi útil em identificar mecanismos patofisiológicos e transcritos desregulados envolvidos com a FA, demonstrando seu uso potencial no estudo de doenças complexas. Nossos resultados poderão, portanto, ser utilizados como base sólida para o levantamento de hipóteses de pesquisas futuras envolvendo a FA.